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2012 Fiscal Year Annual Research Report

Temporal and Spacial Analyses of Sensing and Responses to Temperature during Cold Acclimation and Deacclimation in Plants

Planned Research

Project AreaEnvironmental sensing of plants: Signal perception, processing and cellular responses
Project/Area Number 22120003
Research InstitutionIwate University

Principal Investigator

上村 松生  岩手大学, 農学部, 教授 (00213398)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 河村 幸男  岩手大学, 農学部, 准教授 (10400186)
Project Period (FY) 2010-04-01 – 2015-03-31
Keywords凍結耐性 / 低温馴化 / 環境刺激受容 / 細胞膜 / 遺伝子発現 / プロテオーム
Outline of Annual Research Achievements

平成24年度は以下の4点について成果を得た。
1.「低温馴化に関する生理条件の検討」:これまでの報告と異なり、暗所でも馴化することが明らかとなった。また、低温馴化過程では、赤色光と青色光が異なった効果を与えていることが認められた。
2.「ルシフェラーゼ導入変異株の作成および発光検出系の構築」:ルシフェラーゼ導入形質転換体を用いた凍結耐性関連因子の時空間的解析」:COR15a、Lipocalin、PLDδ、SYT1、PIP1-4およびPIP2-5のタンパク質をコードする遺伝子のプロモータ領域にルシフェラーゼをつないだコンストラクトを用いて形質転換体を作成し、低温条件下での発光検出系を構築し、順次、時空間的解析を実施した。脱水ストレス応答因子であるCOR15aおよびLipocalinはPLDδとは異なる部位での発現がみられ、また、比較的高い温度で低温馴化を行った場合には、発現が早まる傾向が観察されている。一方、PIP1-4およびPIP2-5に関しては、凍結耐性との関わりは全く不透明であるため、阻害剤および欠損株を用いて凍結耐性への関与を確認した。
3.「凍結情報受容メカニズムの解析」:特徴的なERの凍結挙動が観察されたが、この凍結挙動にはアクチンフィラメントが関与していることが予想された。現在、同時観察実験系をシロイヌナズナ変異体を用いて構築中である。
4. 「細胞膜の低温応答に関するプロテオーム解析」:シロイヌナズナ、ライムギ、カラスムギおよびBrachypodiumを用いて、低温馴化過程で凍結傷害の初発部位である細胞膜(および細胞膜マイクロドメイン)のプロテオームが大きく変動することを見いだし、一部は凍結耐性の程度と関連していると考えられた。特に、GPIアンカー型タンパク質群が低温馴化過程で特徴的に変動している可能性が示された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

馴化・脱馴化の生理条件の検討、凍結情報受容メカニズムの解析、および、細胞膜の低温応答に関するプロテオーム解析に関しては、当初の計画通りに進展し、複数の論文発表を行うとともに、国際会議で招待講演を行った。脱水ストレス応答遺伝子の低温・凍結過程で各器官・組織・細胞で時間的・空間的発現様相が明らかになった。今後、さらに機械的ストレス応答因子などの発現パターンと比較する基盤ができあがってきた。凍結情報受容メカニズムや細胞膜プロテオーム解析も順調に進んでおり、来年度には論文発表が可能な段階に至っている。

Strategy for Future Research Activity

平成25~26年度は、ルシフェラーゼ導入株およびそのEMS変異体ラインを作成し、変異が入らないラインとの発現比較や凍結融解過程における細胞観察を開始する。さらに、プロテオーム解析を細胞膜以外にも広げ、細胞内での低温応答・適応へのプロテオーム関与について考察を開始する。以上の実験で見いだされる新奇凍結耐性因子に関しては、形質転換体実験によりモデル植物から農作物への展開可能性を探る。

  • Research Products

    (34 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (11 results) (of which Peer Reviewed: 11 results) Presentation (22 results) (of which Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Plant strategies for survival in changing environment (Editorial)2013

    • Author(s)
      Matsuo Uemura
    • Journal Title

      Physiologia Plantarum

      Volume: 147 Pages: 1-3

    • DOI

      10.3389/fpls.2013.00027

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Allium fistulosum L. as a novel system to investigate mechanisms of freezing resistance2013

    • Author(s)
      Karen K. Tanino, Yukio Kawamura, Matsuo Uemura
    • Journal Title

      Physiologia Plantarum

      Volume: 147 Pages: 101-111

    • DOI

      10.1007/s00425-011-1550-5

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Roles of cell walls and intracellular contents in supercooling capability of xylem parenchyma cells of boreal trees2013

    • Author(s)
      Jun Kasuga, Matsuo Uemura
    • Journal Title

      Physiologia Plantarum

      Volume: 148 Pages: 25-35

    • DOI

      doi: 10.1111/j.1399-3054.2012.01678.x.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detergent-resistant plasma membrane proteome to elucidate microdomain functions in plant cells2013

    • Author(s)
      Daisuke Takahashi, Yukio Kawamura, Matsuo Uemura
    • Journal Title

      Frontier in Plant Science

      Volume: 4 Pages: 27 (5 pages)

    • DOI

      10.3389/fpls.2013.00027

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Sucrose phosphate phosphatase in the green alga Klebsormidium flaccidum (Streptophyta) lacks an extensive C-terminal domain and differs from that of land plants2012

    • Author(s)
      Manabu Nagao, Matsuo Uemura
    • Journal Title

      Planta

      Volume: 235 Pages: 851-861

    • DOI

      10.1007/s00425-011-1550-5

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Detergent-resistant plasma membrane proteome in oat and rye: similarities and dissimilarities between two monocotyledonous plants2012

    • Author(s)
      Daisuke Takahashi, Yukio Kawamura, Matsuo Uemura
    • Journal Title

      Journal of Proteome Research

      Volume: 11 Pages: 1654-1665

    • DOI

      10.1021/pr200849v

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Comparison of plasma membrane proteomic changes of Arabidopsis suspension cells (T87 line) after cold and abscisic acid treatment in association with freezing tolerance development2012

    • Author(s)
      Bin Li, Yukio Kawamura, Matsuo Uemura
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 53 Pages: 542-554

    • DOI

      10.1093/pcp/pcs010

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Cold-stress-induced acclimation in rice is mediated by root-specific aquaporins2012

    • Author(s)
      Arifa Ahamed, Yukio Kawamura, Matsuo Uemura
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 53 Pages: 1445-1456

    • DOI

      10.1093/pcp/pcs089

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 水から氷へ:凍結傷害発生と回避2012

    • Author(s)
      河村 幸男、上村 松生
    • Journal Title

      低温生物工学会誌

      Volume: 58 Pages: 53-57

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] シロイヌナズナ低温馴化過程における細胞膜ダイナミン関連タンパク質の機能2012

    • Author(s)
      近藤 万里子、河村 幸男、上村 松生
    • Journal Title

      低温生物工学会誌

      Volume: 58 Pages: 105-110

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] 植物細胞における小胞体凍結動態の観察2012

    • Author(s)
      小林 紫苑、河村 幸男、上村 松生
    • Journal Title

      低温生物工学会誌

      Volume: 58 Pages: 111-115

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Proteomic profiles of Pisum sativum inner and outer chloroplast envelope membranes2013

    • Author(s)
      Javier Abadia, Matsuo Uemura
    • Organizer
      International Workshop on Plant Membrane Biology XVI
    • Place of Presentation
      芸文館(岡山県)
    • Year and Date
      2013-03-26 – 2013-03-31
  • [Presentation] 植物はどの波長の光を利用して低温馴化を行うか2013

    • Author(s)
      今井 裕之、河村 幸男、上村 松生
    • Organizer
      第54回日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山県)
    • Year and Date
      2013-03-21 – 2013-03-23
  • [Presentation] シロイヌナズナの低温応答に関与する翻訳制御機構の研究2013

    • Author(s)
      中南 健太郎、上村 松生
    • Organizer
      第54回日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山県)
    • Year and Date
      2013-03-21 – 2013-03-23
  • [Presentation] 春季にセイヨウハコヤナギの枝で起こるタンパク質変動のショットガンプロテオーム解析2013

    • Author(s)
      春日 純、上村 松生
    • Organizer
      第63回日本木材学会
    • Place of Presentation
      岩手大学(岩手県)
    • Year and Date
      2013-03-21 – 2013-03-23
  • [Presentation] シロイヌナズナGPIアンカー型タンパク質の網羅的解析および低温馴化過程における変動2013

    • Author(s)
      高橋 大輔、河村 幸男、上村 松生
    • Organizer
      第54回日本植物生理学会
    • Place of Presentation
      岡山大学(岡山県)
    • Year and Date
      2013-03-21
  • [Presentation] Proteomic profiles of Pisum sativum inner and outer chloroplast envelope membranes2013

    • Author(s)
      Elain Gutierrez-Carbonell, Matsuo Uemura
    • Organizer
      5th Congress of the Spanish Proteomics Society
    • Place of Presentation
      Axa Auditorium Center (Spain)
    • Year and Date
      2013-02-05 – 2013-02-08
  • [Presentation] シロイヌナズナ低温馴化過程における細胞膜ダイナミン関連タンパク質の機能2012

    • Author(s)
      近藤 万里子、河村 幸男、上村 松生
    • Organizer
      東北植物学会第2回大会
    • Place of Presentation
      弘前大学(青森県)
    • Year and Date
      2012-12-16
  • [Presentation] シロイヌナズナ低温馴化および脱馴化過程における細胞膜プロテオーム解析2012

    • Author(s)
      三木 雄史、河村 幸男、上村 松生
    • Organizer
      東北植物学会第2回大会
    • Place of Presentation
      弘前大学(青森県)
    • Year and Date
      2012-12-16
  • [Presentation] Proteomic analysis of detergent-resistant plasma membrane in association with development of freezing tolerance in plants2012

    • Author(s)
      Daisuke Takahashi, Yukio Kawamura, Matsuo Uemura
    • Organizer
      International Conference on Membrane Domains
    • Place of Presentation
      AgroSup Dijon (France)
    • Year and Date
      2012-11-27 – 2012-11-30
  • [Presentation] 樹木冬芽の越冬過程における可溶性タンパク質の組成変化2012

    • Author(s)
      鈴木 伸吾、上村 松生
    • Organizer
      日本木材学会北海道支部平成24年度研究発表会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター(北海道)
    • Year and Date
      2012-11-13
  • [Presentation] B. distachyon の凍結耐性と細胞膜プロテオーム解析2012

    • Author(s)
      上村 松生、河村 幸男
    • Organizer
      第1回ブラキポディウムワークショップ
    • Place of Presentation
      横浜市立大学(神奈川県)
    • Year and Date
      2012-11-07
    • Invited
  • [Presentation] Comprehensive analysis of glycosylphosphatidylinositol-anchored proteins and lipids of the plasma membrane to understand their functional involvement in plant freezing tolerance2012

    • Author(s)
      Daisuke Takahashi, Yukio Kawamura, Matsuo Uemura
    • Organizer
      Conference on Lipid-Protein Interactions in Membranes
    • Place of Presentation
      Centre for Cellular and Molecular Biology (India)
    • Year and Date
      2012-11-01 – 2012-11-05
  • [Presentation] Changes and differences in plasma membrane proteins associated with plant cold tolerance2012

    • Author(s)
      Matsuo Uemura
    • Organizer
      Plant Sciences Seminar, University of Hyderabad
    • Place of Presentation
      University of Hyderabad (India)
    • Year and Date
      2012-10-30
    • Invited
  • [Presentation] 凍結した植物細胞におけるカルシウムの役割とは?2012

    • Author(s)
      河村 幸男、上村 松生
    • Organizer
      第76回日本植物学会
    • Place of Presentation
      兵庫県立大学(兵庫県)
    • Year and Date
      2012-09-17
    • Invited
  • [Presentation] Proteomic approaches for analyzing responsiveness of glycosylphosphatidylinositol- anchored proteins to cold acclimation in oat and rye2012

    • Author(s)
      Daisuke Takahashi, Yukio Kawamura, Matsuo Uemura
    • Organizer
      Plant Biology 2012
    • Place of Presentation
      Austin Convention Center (USA)
    • Year and Date
      2012-07-20 – 2012-07-24
  • [Presentation] Comparable plasma membrane proteomics of Brachypodium distachyon with two cereals (oat and rye) in association with cold acclimation2012

    • Author(s)
      Takato Nakayama, Yukio Kawamura, Matsuo Uemura
    • Organizer
      Plant Biology 2012
    • Place of Presentation
      Austin Convention Center (USA)
    • Year and Date
      2012-07-20 – 2012-07-24
  • [Presentation] Obtaining direct evidence for freezing avoidance and tolerance mechanisms using a single cell layer of Allium fistulosum L2012

    • Author(s)
      Karen K. Tanino, Yukio Kawamura, Matsuo Uemura
    • Organizer
      Plant and Microbe Adaptations to Cold 2012
    • Place of Presentation
      北海道大学学術交流会館(北海道)
    • Year and Date
      2012-06-26
    • Invited
  • [Presentation] Involvement of plasma membrane microdomains in cold acclimation and freezing tolerance in plants2012

    • Author(s)
      Daisuke Takahashi, Yukio Kawamura, Matsuo Uemura
    • Organizer
      Plant and Microbe Adaptations to Cold 2012
    • Place of Presentation
      北海道大学学術交流会館(北海道)
    • Year and Date
      2012-06-24 – 2012-06-27
  • [Presentation] Cryodynamics of organelles in living plant cells2012

    • Author(s)
      Shion Kobayashi, Yukio Kawamura, Matsuo Uemura
    • Organizer
      Plant and Microbe Adaptations to Cold 2012
    • Place of Presentation
      北海道大学学術交流会館(北海道)
    • Year and Date
      2012-06-24 – 2012-06-27
  • [Presentation] Semiquantitative plasma membrane proteomics of Brachypodium distachyon in association with cold acclimation2012

    • Author(s)
      Takato Nakayama, Yukio Kawamura, Matsuo Uemura
    • Organizer
      Plant and Microbe Adaptations to Cold 2012
    • Place of Presentation
      北海道大学学術交流会館(北海道)
    • Year and Date
      2012-06-24 – 2012-06-27
  • [Presentation] Proteomic analysis of seasonal cold-deacclimation process in poplar phloem and xylem tissues2012

    • Author(s)
      Jun Kasuga, Matsuo Uemura
    • Organizer
      Plant and Microbe Adaptations to Cold 2012
    • Place of Presentation
      北海道大学学術交流会館(北海道)
    • Year and Date
      2012-06-24 – 2012-06-27
  • [Presentation] 低温馴化過程におけるB. distachyon 細胞膜タンパク質の組成変動の解析2012

    • Author(s)
      中山 貴人、河村 幸男、上村 松生
    • Organizer
      第57回低温生物工学会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場(茨城県)
    • Year and Date
      2012-06-01
  • [Remarks] 岩手大学農学部 附属寒冷バイオフロンティア研究センター 生命適応機能研究分野 ホームページ

    • URL

      http://news7a1.atm.iwate-u.ac.jp/~crcdbbt/index.htm

URL: 

Published: 2018-02-02  

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