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2013 Fiscal Year Annual Research Report

オルガネラ相互作用による植物環境応答の分子機構

Planned Research

Project AreaEnvironmental sensing of plants: Signal perception, processing and cellular responses
Project/Area Number 22120007
Research InstitutionNational Institute for Basic Biology

Principal Investigator

西村 幹夫  基礎生物学研究所, 研究力強化戦略室, 特任教授 (80093061)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2015-03-31
Keywordsぺルオキシソーム / オイルボディ / オルガネラ相互作用 / 環境応答 / 植物細胞
Outline of Annual Research Achievements

1.「オルガネラ相互作用の解析」:黄化芽生え時のペルオキシソームとリピッドボディとの相互作用に異常を生じたシロイヌナズナ変異体ped1 (peroxisome defective 1) の解析を進めた。免疫電子顕微鏡観察から、ped1変異体のペルオキシソーム内の膜小胞に、ペルオキシソームの脂肪酸輸送体であるPED3が集積することが明らかとなり、ペルオキシソームとリピッドボディとの相互作用にPED3が関与することが示唆された。ペルオキシソームと葉緑体との相互作用解析に関しては、光環境下での代謝系との相関性を明らかにした。また、ペルオキシソームの運動解析、ならびにアクチン骨格の接着機構への影響を詳細に解析した。オルガネラ接着機構変異体の原因遺伝子解析に関しては、全ゲノムシークエンスを進めると同時に、接着機構欠損が期待される候補変異体に関しての生理学的解析を進めた。
2.「光環境下におけるペルオキシソーム機能変換機構の解析」:発芽時の光環境下では、ペルオキシソーム内の酵素群が変化し機能が転換する。この制御機構にオートファジーが関与していることが予測され、種々のATG (Autophagy-related) 変異体を用いてその解析を進めた。同時にペルオキシソーム局在型Lon protease 2 (LON2) のペルオキシソーム機能変換機構における役割を解析し、LON2とオートファジーによる、ペルオキシソーム機能転換の新たな制御機構を解明した。
3.「ペルオキシソーム形成異常変異体の解析」:ペルオキシソーム形成変異体 (apem:aberrant peroxisome morphology) の解析を進め、機能未知なAPEM6が脂質結合能を有し、オルガネラ膜脂質の合成に関与することが予測され、ペルオキシソーム形成に膜脂質動態が関わることが強く示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

オルガネラ相互作用の解析では、光依存性のペルオキシソームと葉緑体の接着現象を見いだし、フェムト秒レーザー照射法を導入することにより接着力を測定した。この成果はNaturePlantsにarticleとして掲載され、同誌のNews and Viewsでブレイクスルーに値する論文として紹介された。さらにペルオキシソームとオイルボディの接着も見いだし、解析を加えている。また、永年、オルガネラ機能に関して注目されてきた、光によるペルオキシソームの機能転換に、オートファジーとlonタンパク質による分解系が働いていることを明らかにした。これらの成果をとりまとめた総説を作成中である。

Strategy for Future Research Activity

今後は、オルガネラ相互作用異常変異体の解析から、関連因子の同定と機能解析を進め、環境応答におけるオルガネラ相互作用の分子機構を明らかにする。また、オートファジーによるペルオキシソームの品質管理と機能転換における制御機構を解明する。

  • Research Products

    (9 results)

All 2015 2014 2013

All Journal Article (7 results) (of which Acknowledgement Compliant: 4 results,  Peer Reviewed: 3 results) Presentation (1 results) (of which Invited: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Difuse decapping enzyme DCP2 accumulates in DCP1 foci under heat stress in Arabidopsis thaliana2015

    • Author(s)
      Motomura K., Q. T. Le, T. Hamada, N. Kutsuna, S. Mano, M. Nishimura and Y. Watanabe
    • Journal Title

      Plant Cell Physiol.

      Volume: 56 Pages: 107-115

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Physical interaction between peroxisomes and chloroplasts elucidated by in situ laser analysis2015

    • Author(s)
      Oikawa K., S. Matsunaga, S. Mano, M. Kondo, K. Yamada, M. Hayashi, T. Kagawa, A. Kadota, W. Sakamoto, S. Higashi, M. Watanabe, T. Mitsui, A. Shigemasa, T. Iino, Y hosokawa and M. Nishimura
    • Journal Title

      Nature Plants

      Volume: 1 Pages: -

    • DOI

      10.1038/nplants

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] ER bodies in plants of the Brassicales order: Biogenesis and association with innate immunity.2014

    • Author(s)
      Nakano, RT., K. Yamada, P. Bednarek, M. Nishimura and I. Hara-Nishimura
    • Journal Title

      Frontiers in Plant Science

      Volume: 5 Pages: 1-17

    • DOI

      10.4161/auto.28529

  • [Journal Article] Plant autophagy is responsible for the peroxisomal transition and plays an important role in the maintenance of peroxisomal quality control.2014

    • Author(s)
      Shibata, M., K. Oikawa, K. Yoshimoto, S. Goto-Yamada, S. Mano, K. Yamada, M. Kondo, M. Hayashi, Y. Ohsumi and M. Nishimura
    • Journal Title

      Autophagy

      Volume: 10 Pages: 936-937

    • DOI

      10.4161/auto.28529

    • Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Interaction between chaperone and protease functions of LON2, and autophagy during the functional transition of peroxisomes.2014

    • Author(s)
      Goto-Yamada S., S. Mano, K. Oikawa, M. Shibata and M. Nishimura
    • Journal Title

      Plant Signal Behav.

      Volume: 9 Pages: e28838

    • Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Measurement of number of peroxisomes2014

    • Author(s)
      Shibata, M., K. Oikawa, S. Mano and M. Nishimura
    • Journal Title

      Bio-protocol

      Volume: 4 Pages: e1284

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Novel proteins interacting with peroxisomal protein receptor PEX7 in Arabidopsis thaliana2013

    • Author(s)
      Cui S. K., S. Mano, K. Yamada, M. Hayashi and M. Nishimura
    • Journal Title

      Plant Signal Behav.

      Volume: 8 Pages: e26829

    • DOI

      10.4161/psb.26829

    • Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Dynamics of peroxisomes in Arabidopsis thaliana2013

    • Author(s)
      Nishimura M.
    • Organizer
      PERFUME Kick-off Conference on “Peroxisome Formation, Function and Metabolism”
    • Place of Presentation
      Groningen, The Netherlands,
    • Year and Date
      2013-12-01 – 2013-12-04
    • Invited
  • [Book] Sexual Reproduction in Animals and Plants2014

    • Author(s)
      Goto-Yamada, S. S. Mano and M. Nishimura
    • Total Pages
      480(419-429)
    • Publisher
      Springer Japan

URL: 

Published: 2016-06-01  

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