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2014 Fiscal Year Annual Research Report

クロマチンリモデリング制御複合体の構造と機能の解析

Planned Research

Project AreaStructural basis of cell-signalling complexes mediating signal perception, transduction and responses
Project/Area Number 22121005
Research InstitutionHigh Energy Accelerator Research Organization

Principal Investigator

千田 俊哉  大学共同利用機関法人高エネルギー加速器研究機構, 物質構造科学研究所, 教授 (30272868)

Project Period (FY) 2010-04-01 – 2015-03-31
KeywordsX線結晶構造解析 / クロマチン / ヌクレオソーム / 転写 / 複製 / CAF-I複合体 / HIRA
Outline of Annual Research Achievements

本申請で主なターゲットとするCAF-I複合体は、酵母からヒトまで進化上保存された複製依存のクロマチンアッセンブリー因子であり、p150, p60, p48という3種類のサブユニットから構成されるヘテロ三量体である。今年度は、出芽酵母CAF-I複合体を細胞内から高純度で精製することに成功した。精製の過程、特に濃縮のステップにおいて回収率が低かったため、様々な条件検討を行ったところ、回収率を向上させる条件を見出すことに成功した。その後、発見した条件で大量スケール(40L培養菌体)からの精製を行い、0.3mg/mL x 50uLの精製標品を得ることに成功した。電子顕微鏡にて負染色像観察を行ったところ、約10nmの均一な大きさの粒子が観察された。これらの粒子像から、試験的な単粒子解析像を得ることに成功した。
ヒトCAF-I複合体については、今年度までに昆虫細胞での大量発現系を構築することはできたが、大量精製においてはサブユニットの1つが非常に解離しやすいことが明らかになった。電子顕微鏡で約10nmの粒子を観察できたが、同時に小さなサイズの粒子も多数観察され、電子顕微鏡で観察された粒子像は不揃いになってしまっていた。サブユニットが解離する原因としては、a)複合体の形成に何らかの補助因子(分子シャペロンなど)が必要、b)サブユニットへの翻訳後修飾が必要、c)元来解離しやすいサブユニットである、などが考えられる。
ヒトHIRAについては、昨年度までに全長を単独で発現・精製することを試みたが極めて困難だったので、今年度は、相互作用因子との共発現や、一部ドメインの発現・結晶化を検討した。この中で、HIRAのC末端側ドメインについては結晶が得られており、現在、結晶の質を改善する試みを行っている。

Research Progress Status

26年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

26年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (9 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (6 results) (of which Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Structure of a BAG6 (Bcl-2-associated Athanogene 6)-Ubl4a (Ubiquitin-like Protein 4a) Complex Reveals a Novel Binding Interface That Functions in Tail-anchored Protein Biogenesis.2015

    • Author(s)
      Kuwabara N, Minami R, Yokota N, Matsumoto H, Senda T, Kawahara H, Kato R.
    • Journal Title

      J. Biol. Chem.

      Volume: 290 Pages: 9387-9398

    • DOI

      10.1074/jbc.M114.631804.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular mechanism of strict substrate specificity of an Extradiol Dioxygenase, DesB, derived from Sphingobium sp. SYK-6.2014

    • Author(s)
      Sugimoto, K., Senda, M., Kasai, D., Fukuda, M., Masai, E. and Senda, T.
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 9 Pages: e92249

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0092249.

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 創薬等支援技術基盤プラットフォームにおける構造研究2015

    • Author(s)
      千田俊哉
    • Organizer
      日本薬学会
    • Place of Presentation
      神戸・神戸学院大学/兵庫医療大学
    • Year and Date
      2015-03-26
    • Invited
  • [Presentation] エピジェネティックおよび疾病関連タンパク質の構造生物学研究2014

    • Author(s)
      千田俊哉
    • Organizer
      日本結晶学会
    • Place of Presentation
      東京・東京大学農学部弥生キャンパス
    • Year and Date
      2014-11-01
    • Invited
  • [Presentation] ピロリ菌由来のがんタンパク質CagAの構造-機能相関研究2014

    • Author(s)
      千田俊哉
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      京都・国立京都国際会館
    • Year and Date
      2014-10-16
    • Invited
  • [Presentation] ヒストンシャペロンHIRA C domainの精製系の確立2014

    • Author(s)
      佐藤優花里
    • Organizer
      日本生化学会
    • Place of Presentation
      京都・国立京都国際会館
    • Year and Date
      2014-10-16
  • [Presentation] Structure and Function of an Oncoprotein CagA from Helicobacter Pylori2014

    • Author(s)
      千田俊哉
    • Organizer
      8th Asia-Ocdania Forum for synchrotron radiation research
    • Place of Presentation
      新竹(台湾)・National Synchrotron Radiation Research Center
    • Year and Date
      2014-09-16
    • Invited
  • [Presentation] Large-scale purification of general transcription factor TFIIF2014

    • Author(s)
      Naruhiko Adachi, Kyohei Aizawa, Yuka Yamaguchi, and Toshiya Senda
    • Organizer
      Epigenetics & chromatin
    • Place of Presentation
      米国・コールドスプリングハーバー研究所
    • Year and Date
      2014-09-09 – 2014-09-13
  • [Remarks] KEK, IMSS, SBRC

    • URL

      http://pfweis.kek.jp/index.html

URL: 

Published: 2016-06-01  

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