2013 Fiscal Year Annual Research Report
| Project Area | Systematic study of chromosome adaptation |
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| Project/Area Number |
22125007
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
岡田 由紀 東京大学, 分子細胞生物学研究所, 准教授 (60546430)
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| Project Period (FY) |
2010-06-23 – 2015-03-31
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| Keywords | 受精卵 / 転写 / リプログラミング |
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| Research Abstract |
本研究課題は本研究は以下の2つのパートに大別される。
A. （マウス）受精卵を対象とした高効率ChIP法の開発
B. ChIP-seq法を用いた受精卵のクロマチンダイナミクスの解析
A）500～1000個の細胞でIVTおよびライブラリ作製の条件等を詳細に検討した結果、上位25% 程度の遺伝子については評価できる成績が得られている。ただChIP効率については抗体の性質に依存する部分が大きく、最終的にはヒストン抗体（の中でもさらに高効率IPの実績があるもの）に限定されそうであるが、それでも1000個以下の細胞でChIP-seqができる可能性を示す意義は大きいと考えられる。
B) A)の結果を踏まえてどのヒストンが受精卵ChIP-seq解析に最適であるかを、変異体を用いた方法で検討した。その結果、受精卵の初期発生に重要なヒストン修飾を１つ同定することができた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初の計画にあった雌雄前核を分けた解析は技術的に克服できそうにないが、その他の部分は概ね計画どおりに進捗しており、今年度中に受精卵ChIPの結果を示すことができると考えている。
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| Strategy for Future Research Activity |
当初の計画にあった雌雄前核を分けた解析は技術的に克服できそうにないが、その他の部分は概ね計画どおりに進捗しており、今年度中に受精卵ChIPの結果を示すことができると考えている。最も問題が出る可能性は、IPによって得られるDNA量が少ない事であるが、それを克服するために現在ChIP標的ヒストンを過剰発現させた卵を準備している。
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