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2013 Fiscal Year Annual Research Report

カメの甲の新規形態パターンをもたらした発生機構の変化

Planned Research

Project AreaGenetic bases for the evolution of complex adaptive traits
Project/Area Number 22128003
Research InstitutionInstitute of Physical and Chemical Research

Principal Investigator

倉谷 滋  独立行政法人理化学研究所, 発生・再生科学総合研究センター, グループディレクター (00178089)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 入江 直樹  東京大学, 大学院理学系研究科(理学部), 准教授 (10536121)
PASCUAL JUAN  独立行政法人理化学研究所, 発生・再生科学総合研究センター, 研究員 (30594098)
Project Period (FY) 2010-06-23 – 2015-03-31
Keywords進化 / 発生 / ゲノム / バイオインフォマティクス / 脊椎動物 / カメ
Research Abstract

カメの甲およびそれに付随する筋骨格系のパターンは、この系統の共有派生形質であり、脊椎動物の進化史における新規形質とも目される。我々のグループは、この形質の獲得を導いた発生機構の変化、およびその背景となるゲノムレベルでの進化を明らかにすることを目指している。平成25年度は、スッポン(Pelodiscus sinensis)のゲノム解読をもとにした成果を論文として出版し(Nat Genet)、その中で(1)カメの系統が約2億6800ー4800万年前(後期ペルム紀ー前期三畳紀)に主竜類から分岐したこと、(2)胚発生でカメの背甲の外側縁、甲稜にWnt5aが発現すること、(3)カメ特異的な発生プログラムは脊椎動物の基本設計が揃うファイロティピック期の後に発動すること等を報告した。加えて、(4)スッポン背甲の骨形成過程を詳細に観察することにより、縁辺部以外の背甲骨格は肋骨と椎骨が変形した内骨格要素のみからなること、 (5)背甲骨格の形態学的特徴の一部はカメの姉妹群に当たる化石種にも備わっていた可能性を報告した(Nat Commun)。現在、須磨海浜水族園の協力の下、スッポン以外のカメ胚を得、胚発生において肋骨原基が傍軸部に停まり体壁部に侵入しない現象(axial arrest) についても解析を進めている。その結果、他のカメ類と異なり、スッポンでは鱗板や縁辺部の背甲骨格要素は二次的に失われているため、そのような付属構造の影響を除いて甲の発生過程を分析するのにスッポンはむしろ適しているということがあらためて示唆された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

前年度までに予想以上のスピードでカメゲノム解読プロジェクトが完了し、カメ特有の胚発生過程に関して比較形態学上の新発見が相次いだため、計画以上の成果を得ることができている。

Strategy for Future Research Activity

よりゲノムに焦点を当てた研究を展開する。まず、スッポン胚における甲稜と他の組織の間、およびスッポン胚と他の羊膜類(ニワトリ等)の胚における各組織間において、比較トランスクリプトーム解析を進め、甲稜の発生を司る分子を特定、その発生機構がco-optionにより獲得された可能性の検証を試みる。また、甲稜における(Wnt5aの制御機構を解明するため、周辺の非コード保存領域の探索を行う。

  • Research Products

    (20 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (13 results) (of which Invited: 12 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Evolution of the vertebrate skeleton: morphology, embryology, and development2014

    • Author(s)
      Hirasawa, T., Kuratani, S.
    • Journal Title

      Zoo. Sci.

      Volume: in press Pages: in press

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] カメの甲の初期進化:約2億5000万年前に何が起きたのか2014

    • Author(s)
      平沢達矢、Juan Pascual-Anaya、倉谷滋
    • Journal Title

      細胞工学

      Volume: 33(2) Pages: 208-211

  • [Journal Article] The endoskeletal origin of the turtle carapace2013

    • Author(s)
      Hirasawa, T., Nagashima, H., Kuratani, S.
    • Journal Title

      Nature Commnications

      Volume: 4:2107 Pages: -

    • DOI

      10.1038/ncomms3107

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Body wall development in lamprey and a new perspective on the origin of vertebrate paired fins2013

    • Author(s)
      Tulenko, F. J., McCauley, D.W., Mackenzie, E.L., Mazan, S., Kuratani, S., Sugahara, F., Kusakabe, R., Burke, A.C.
    • Journal Title

      PNAS

      Volume: 110(29) Pages: 11899-11904

    • DOI

      10.1073/pnas.1304210110

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Origin of the unique morphology of the shoulder girdle in turtles.2013

    • Author(s)
      Nagashima, H., Hirasawa, T., Sugahara, F., Takechi, M., Usuda, R., Sato, N., Kuratani, S.
    • Journal Title

      J. Anat.

      Volume: 223(6) Pages: 547-556

    • DOI

      10.1111/joa.12116.

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] What we can learn from hagfish embryology

    • Author(s)
      Shigeru Kuratani
    • Organizer
      American Association of Anatomists Anuual Meeting Experimental Biology
    • Place of Presentation
      Boston Convention & Exhibition center, Boston, USA
    • Invited
  • [Presentation] カメゲノムと脊椎動物ボディプラン

    • Author(s)
      入江 直樹
    • Organizer
      第60回日本実験動物学会総会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場 茨城県つくば市
    • Invited
  • [Presentation] Evolutionary origin of the turtle body plan from genomic, anatomical and developmental perspectives.

    • Author(s)
      Shigeru Kuratani, Hiroshi Nagashima, Naoki Irie.
    • Organizer
      International Society of Developmental Biologists 17th International Congress of Developmental Biology
    • Place of Presentation
      Cuncun Center Conventions & Exhibitions, Cancun, Mexico
    • Invited
  • [Presentation] What does it take to be a turtle?-from embryology to genomics.

    • Author(s)
      Shigeru Kuratani, Hiroshi Nagashima, Naoki Irie.
    • Organizer
      10th International Congress of vertebrate Morphology
    • Place of Presentation
      Fira Palace Hotel, Barcelona, Spain
    • Invited
  • [Presentation] Vertebrates' basic body plan embedded in the waist of hourglass

    • Author(s)
      Naoki irie
    • Organizer
      Vertebrates' basic body plan embedded in the waist of hourglass
    • Place of Presentation
      筑波大学、茨城県つくば市
    • Invited
  • [Presentation] 発生ゲノムと化石から見たカメの起源

    • Author(s)
      倉谷 滋
    • Organizer
      日本遺伝学会第85回大会
    • Place of Presentation
      慶応義塾大学日吉キャンパス、神奈川県横浜市
    • Invited
  • [Presentation] ネッタイツメガエル胚発生期の包括的遺伝子発現データ

    • Author(s)
      入江 直樹
    • Organizer
      日本動物学会 第84回大会
    • Place of Presentation
      岡山大学津島キャンパス、岡山県岡山市
    • Invited
  • [Presentation] Flexibility in early animal developmental system.

    • Author(s)
      Naoki Irie
    • Organizer
      The 2nd International Workshop for Quantitative Biology
    • Place of Presentation
      Osaka, Japan
    • Invited
  • [Presentation] Evolution of the turtle shell-from developmental, paleontological and genomic perspectives

    • Author(s)
      Shigeru Kuratani
    • Organizer
      大韓解剖学会第63回学術大会
    • Place of Presentation
      Danyang Daemyung Resort, Danyang-gun(丹陽郡), Korea
    • Invited
  • [Presentation] Turtle also follows the general formulation of Embryonic Evolution.

    • Author(s)
      Naoki Irie
    • Organizer
      The 8th International Conference on Genomics in China (ICG-8)
    • Place of Presentation
      ShenZhen, China.
    • Invited
  • [Presentation] Evolutionary Origin of the Vertebrate Head

    • Author(s)
      Shigeru Kuratani
    • Organizer
      Commemorative Symposium for the 29th International Prize for Biology “Influences and Impacts of Evolutionary Biology”
    • Place of Presentation
      九州大学、福岡県福岡市
    • Invited
  • [Presentation] 進化と形態のはなし

    • Author(s)
      倉谷 滋
    • Organizer
      神戸学院大学ポートアイランドキャンパス図書館 2013年度後期書籍テーマ展示関連企画講演会(公開講座)
    • Place of Presentation
      神戸学院大学ポートアイランドキャンパス 兵庫県神戸市
    • Invited
  • [Presentation] Vertebrate phylotypic period as a source of basic body plan.

    • Author(s)
      Naoki Irie, Guogie Zhang, Shigeru Kuratani
    • Organizer
      International Society of Developmental Biologists 17th International Congress of Developmental Biology
    • Place of Presentation
      Cuncun Center Conventions & Exhibitions, Cancun, Mexico
  • [Remarks] 複合適応形質進化の遺伝子基盤解明 WEBSITE

    • URL

      http:/ / staff.aist.go.jp/ t- fukatsu/ SGJHome.html

  • [Remarks] 理化学研究所 形態進化研究グループ WEBSITE

    • URL

      http:/ / www.cdb.riken.jp/ emo/ japanese/ indexj.html

URL: 

Published: 2015-05-28  

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