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2013 Fiscal Year Annual Research Report

複製と修復をカップリングする損傷乗り越え複製の普遍性

Planned Research

Project AreaCoupling of replication, repair and transcription, and their common mechanism of chromatin remodeling
Project/Area Number 22131008
Research InstitutionGakushuin University

Principal Investigator

花岡 文雄  学習院大学, 理学部, 教授 (50012670)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 益谷 央豪  名古屋大学, 環境医学研究所, 教授 (40241252)
Project Period (FY) 2010-04-01 – 2015-03-31
KeywordsDNAポリメラーゼη / 体細胞超突然変異 / WAモチーフ / 損傷乗り越え合成 / ピリミジン二量体 / 紫外線損傷
Outline of Annual Research Achievements

研究代表者と研究分担者は、複製と修復をカップリングする損傷乗り越え複製の普遍性を明らかにするために、以下の研究を協力して進めた。
(1)ヒトDNAポリメラーゼ・イータ(Polη)によるWAモチーフでの体細胞超突然変異(SHM):SHMは、特異抗体を産生するために免疫グロブリン遺伝子の可変領域においてプログラムされた塩基置換により生ずる。SHMのホットスポットは、RGYWおよびWA(R、プリン;Y、ピリミジン;W、A or T)という二つのモチーフであることが分かっている。Polηは、鋳型Tに対してdGTPを取り込むことにより、上記のWAモチーフをWGモチーフに変換するところに働いていると示唆されている。そこで、ヒトPolηと鋳型TA、AA、GA、CAに対しdATPの代わりにdGTPが取り込まれるときの結晶構造と反応のキネティクスを比較した。T:dGTPというwobble塩基対は、Polηに特異的に保存されているGln-38とArg-61により安定化された。プライマー末端の弱い塩基対であるW(T:AまたはA:T)とPolηとの異なる相互作用は、WAモチーフに対してGを取り込ませた。Polηは二つのWAモチーフの間では、AAに対してTAのほうがAからGへの変異を起こし易く、T:Gミスペアを効率よく伸長した。
(2)シクロブタン型T-N4-meC二量体の安定性:TT部位のシクロブタン型ピリミジン二量体(CPD)は比較的安定で、その修復やDNA合成の阻害について詳しく研究されている。一方、Cを含むCPDは、Cが容易に脱アミノ化を起こしてUになるので、その修復や TLSの機構の研究が遅れている。今回、N4-meCを用いることでCの安定化が起き、脱アミノ化が抑制されること、Polηによる合成反応でN4-meC に対してdGMPの他にTMPの取り込みが明らかにみられることを見出した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

損傷乗り越え複製の中心的存在であるPolηについて、様々な生理的機能が明らかにされている中で、体細胞超突然変異に関する構造生物学と生化学とを組み合わせて、反応メカニズムの解析に成功した。また主要な紫外線損傷であるシクロブタン型ピリミジン二量体について、定番のTT二量体ではなく、TC二量体を安定的に供給することが出来るようになったことはDNA修復研究のみならず、TLSの研究にも大いに役立つことが期待される。

Strategy for Future Research Activity

Polηと相互作用するタンパク質をPolηの各部分に分けて同定し、それらの解析を行おうとしている。それらの解析を進めることで、Polηの更なる機能が明らかになると期待される。損傷乗り越え複製に関与するクロマチンリモデリング因子の同定もスクリーニングが進んでおり、出来るだけ早く着実なデータを蓄積したいと考えている。

  • Research Products

    (11 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (5 results) (of which Peer Reviewed: 5 results,  Open Access: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 5 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 5 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] A cyclobutane thymine-N4-methylcytosine dimer is resistant to hydrolysis but strongly blocls DNA synthesis.2014

    • Author(s)
      Yamamoto J, Oyama T, Kunishi T, Masutani C, Hanaoka F, Iwai S
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res

      Volume: 42 Pages: 2075-2084

    • DOI

      10.1093/nar/gkt1039

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Guanine-5-carboxylcytosine base pairs mimic mismatches during DNA replication.2014

    • Author(s)
      Shibutani T, Ito S, Toda M, Kanao R, Collins LB, Shibata M, Urabe M, Koseki H, Masuda Y, Swenberg JA, Masutani C, Hanaoka F, Iwai S, Kuraoka I
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 4 Pages: 5220

    • DOI

      10.1038/srep05220

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Trapping DNA replication origins from the human genome.2013

    • Author(s)
      Eki T, Murakami Y, Hanaoka F
    • Journal Title

      Genes (Basel)

      Volume: 4 Pages: 198-225

    • DOI

      10.3390/genes4020198

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Mechanism of somatic hypermutation at the WA motif by human DNA polymerase eta.2013

    • Author(s)
      Zhao Y, Gregory MT, Biertumpfel C, Hua YJ, Hanaoka F, Yang W
    • Journal Title

      Proc Natl Acad Sci USA

      Volume: 110 Pages: 8146-8151

    • DOI

      10.1073/pnas.1303126110

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Structure-function analysis of the EF-hand protein centrin-2 for its intracellular localization and nucleotide excision repair.2013

    • Author(s)
      Nishi R, Sakai W, Tone D, Hanaoka F, Sugasawa K
    • Journal Title

      Nucleic Acids Res

      Volume: 41 Pages: 6917-6929

    • DOI

      10.1093/nar/gkt434

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 損傷トレランスと突然変異生成に働く損傷乗り越え合成ポリメラーゼ2014

    • Author(s)
      花岡文雄
    • Organizer
      日本薬学会第134年会
    • Place of Presentation
      熊本
    • Year and Date
      2014-03-28 – 2014-03-30
    • Invited
  • [Presentation] Defective translesion DNA synthesis and links to human disease.2014

    • Author(s)
      Hanaoka F
    • Organizer
      International Symposium on Xeroderma Pigmentosum and Related Diseases: Disorders of DNA Damage Response -Bench to Bedside-
    • Place of Presentation
      神戸
    • Year and Date
      2014-03-05 – 2014-03-07
    • Invited
  • [Presentation] Role of DNA polymerase eta in somatic hypermutation.2013

    • Author(s)
      Hanaoka F
    • Organizer
      3rd France-Japan Cancer Meeting
    • Place of Presentation
      Toulouse, France
    • Year and Date
      2013-11-20 – 2013-11-23
    • Invited
  • [Presentation] がんとは何か?ーその発生のメカニズムを探るー2013

    • Author(s)
      花岡文雄
    • Organizer
      読売サイエンスフォーラム
    • Place of Presentation
      学習院大学
    • Year and Date
      2013-07-27
    • Invited
  • [Presentation] Structure and function of mammalian DNA polymerase eta with special reference on translesion synthesis and somatic hypermutation.2013

    • Author(s)
      Hanaoka F
    • Organizer
      Seminar at Graduate School of Medicine, Kyoto University
    • Place of Presentation
      京都大学医学部
    • Year and Date
      2013-05-27
    • Invited
  • [Remarks] 学習院大学 花岡研究室

    • URL

      http://www-cc.gakushuin.ac.jp/~20080213/

URL: 

Published: 2016-06-01  

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