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2011 Fiscal Year Annual Research Report

HLA遺伝子群の多様性と疾病解析

Planned Research

Project AreaHLA polymorphism, disease and evolution
Project/Area Number 22133008
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

徳永 勝士  東京大学, 大学院・医学系研究科, 教授 (40163977)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 宮川 卓  東京大学, 大学院・医学系研究科, 助教 (20512263)
本多 真  東京都医学総合研究所, 精神行動医学研究分野, プロジェクトリーダー (50370979)
KeywordsHLA / 疾病遺伝子 / ナルコレプシー / 自己免疫疾患 / 感染症 / 1型糖尿病
Research Abstract

本研究では、HLA領域およびゲノム全域における最新の多型解析技術を用いたゲノムワイド関連解析(GWAS)、各々のHLA遺伝子の多型解析、およびリシークエンシングを行い、ナルコレプシーなどの睡眠障害、肝炎などの感染症、1型糖尿病などの免疫関連疾患について病因HLA遺伝子および非HLA遺伝子を特定する。
平成23年度は、小児の1型糖尿病患者における詳細なHLA遺伝子群多型の解析結果、NK細胞受容体およびHLA遺伝子多型の組み合わせとマラリア感受性の関連解析結果、および関節リウマチについての大規模な多施設共同GWASの成果について論文発表した。また、日本人健常群試料について最新のSNP解析技術によるゲノムワイド多型解析およびHLA遺伝子群のタイピングを実施し、HLA領域のSNPハプロタイプとHLAアリルの関係・連鎖不平衡構造を解析するとともに、HLAに働く自然淘汰に関して興味深い結果が得られ、論文投稿中である。また、ナルコレプシー、1型糖尿病、インスリン自己免疫症候群、Stevens-Johnson症候群のゲノムワイド関連解析(GWAS)を実施し、HLA領域および非HLA領域において疾患と強く関連する候補SNPsを検出した。現在これらのreplication studyおよび第一義的感受性遺伝子の特定を実施中である。さらに、ゲノムワイドSNPアレイのデータよりCNV(コピー数変異)の解析法を確立し、ナルコレプシーについてゲノムワイドなCNV解析を行ったところ、興味深い結果が得られ、現在論文執筆中である。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

交付申請時に記載した計画の内容に加えて、関節リウマチに関する大規模な多施設共同GWASの成果の論文発表や、インスリン自己免疫症候群、Stevens-Johnson症候群のゲノムワイド関連解析(GWAS)を実現できた。

Strategy for Future Research Activity

HLA領域のSNPハプロタイプとHLAアリルの連鎖不平衡構造の解析結果、ならびにGWAS後のreplication studyおよび第一義的遺伝子多型の同定作業を進め、論文発表を目指す。また、平行して相互作用解析、パスウェイ解析なども導入して疾患発症機序の解明に貢献する。

  • Research Products

    (5 results)

All 2012 2011

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results) Presentation (2 results)

  • [Journal Article] Genetic Characteristics on HLA-Class II and Class I among Japanese Type1A and Type 1B Diabetic Children and Their Families2012

    • Author(s)
      Sugihara S, Ogata T, Kawamura T, Urakami T, Takemoto K, Kikuchi N, Takubo N, Tsubouchi K, Horikawa R, Kobayashi K, Kasahaera Y, Kikuchi T, Koike A, Mochizuki T, Minamitani K, Takaya R, Mochizuki H, Nishii A, Yokota I, Kizaki Z, Mori T, Shimura N, Mukai T, Matsuura N, Fujisawa T, Ihara K, Kosaka K, Kizu R, Takahashi T, Matsuo S, Hanaki K, Igarashi Y, Sasaki G, Soneda S, Teno S, Kanzaki S, Saji H, Tokunaga K, Amemiya, S, The Japanese Study Group of Insulin Therapy for Childhood and Adolescent Diabetes (JSGIT)
    • Journal Title

      Pediatric Diabetes

      Volume: 13 Pages: 33-44

    • DOI

      10.1111/j.1399-5448.2011.00833.x

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Significant association of KIR2DL3-HLA-C1, combination with cerebral malaria and implications for co-evolution of KIR and HLA2012

    • Author(s)
      Hirayasu K, Ohashi J, Kashiwase K, Hananantachai H, Naka I, Ogawa A, Takanashi M, Satake M, Nakajima K, Parham P, Arase H, Tokunaga K, Patarapotikul J, Yabe T
    • Journal Title

      PLoS Pathogens

      Volume: 8 Pages: e1002565

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Meta-analysis of genome-wide association studies identifies multiple novel loci associated with rheumatoid arthritis in the Japanese population2012

    • Author(s)
      Okada Y, Terao C, Ikari K, Kochi Y, Ohmura K, Suzuki A, Kawaguchi T, Stahl E, Kurreman F, Nishida N, Ohmiya H, Myouzen K, Takahashi M, Sawada T, Nishioka Y, Yukioka M, Matsubara T, Wakitani S, Teshima R, Tohma S, Takasugi K, Shimada K, Murasawa A, Honjo S, Matsuo K, Tanaka H, Tajima K, Suzuki T, Iwamoto T, Kawamura Y, Tanii H, Okazaki Y, Sasaki T, Gregersen PK, Padyukov L, Worthigton J, Siminovitch KA, Lathrop M, Taniguchi A, Takahashi A, Tokunaga K, Kubo M, Nakamura Y, Kamatani N, Mimori T, Plenge RM, Yamanaka H, Momohara S, Yamada R, Matsuda F, Yamamoto K
    • Journal Title

      Nature Genetics

      Volume: 44(Online pub. : 25 March, 2012)

    • DOI

      10.1038/ng.2231

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Lessons from genome-wide search for disease-related genes2011

    • Author(s)
      Tokunaga K
    • Organizer
      20^<th> Annual Conference of Korean Genome Organization
    • Place of Presentation
      Gangoe-myeon,韓国(招待講演)
    • Year and Date
      20110901-20110902
  • [Presentation] HLA and population genetics2011

    • Author(s)
      Juji T, Tokunaga K
    • Organizer
      22^<nd> Regional Congress of the International Society of Blood Transfusion
    • Place of Presentation
      台北,台湾(招待講演)
    • Year and Date
      2011-11-21

URL: 

Published: 2013-06-26  

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