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2012 Fiscal Year Annual Research Report

Variation and disease associations of HLA genes

Planned Research

Project AreaHLA polymorphism, disease and evolution
Project/Area Number 22133008
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

徳永 勝士  東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (40163977)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 宮川 卓  東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (20512263)
本多 真  公益財団法人東京都医学総合研究所, 精神行動医学研究分野, プロジェクトリーダー (50370979)
Project Period (FY) 2010-04-01 – 2015-03-31
KeywordsHLA / 疾病遺伝子 / ナルコレプシー / 自己免疫疾患 / 感染症 / 1型糖尿病
Outline of Annual Research Achievements

本研究では、HLA領域およびゲノム全域における最新の多型解析技術を用いたゲノムワイド関連解析(GWAS)、各々のHLA遺伝子の多型解析、およびリシークエンシングを行い、ナルコレプシーなどの睡眠障害、肝炎などの感染症、1型糖尿病などの免疫関連疾患について病因HLA遺伝子および非HLA遺伝子を特定する。
平成24年度は、関節リウマチの発症、B型肝炎ウイルスの排除、および原発性胆汁性肝硬変の発症についての大規模な多施設共同GWASを実施し、それぞれ9種類、1種類、2種類の新たな感受性遺伝子を同定して論文発表した。これらの成果により、発症感受性や抵抗性の機序について理解が深まった。B型肝炎の感受性遺伝子であるHLA-DPがウイルス排除にも関わることがわかり、一方、原発性胆汁性肝硬変の発症にはTH1細胞およびB細胞の分化・増殖が関与すると推定された。さらに、日本人およびタイ人結核についてGWASメタ解析を実施し、1個の新規感受性遺伝子を同定して論文発表した。スティーブンスジョンソン症候群については、HLA-A*0206とTLR遺伝子多型との間で発症リスクを相乗的に高める相互作用を見出し論文報告した。日本人一般集団では、HLA-DPB1*0401に正の自然淘汰が働いていることも見出し論文報告した。ナルコレプシーについては、これまでのゲノム解析に基づいて、発症機序に自己免疫およびカルニチンシャトルの異常を想定している。そこでL-カルニチンをナルコレプシー患者に経口投与したところ、居眠り時間の有意な減少を観察した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

交付申請書に記載した計画を順調に達成し、その多くを論文発表した。特に6種の免疫関連疾患についてゲノムワイド関連解析(GWAS)等を実施し、HLAと非HLA遺伝子の関連を見出した。

Strategy for Future Research Activity

未発表のGWAS成果について論文報告するとともに、GWAS後のreplication studyや第一義的遺伝子多型の同定作業を進め、論文発表を実現する。また、機能解析グループとの連携を深めるとともに、相互作用解析、パスウェイ解析なども導入して疾患発症機序の解明を目指す。

  • Research Products

    (14 results)

All 2013 2012 Other

All Journal Article (7 results) (of which Peer Reviewed: 7 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 4 results) Book (1 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results)

  • [Journal Article] Effects of oral L-carnitine administration in narcolepsy patients: a randomized, double-blind, cross-over and placebo-controlled trial.2013

    • Author(s)
      Miyagawa T 他
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 8(1) Pages: e53707

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0053707

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Meta-analysis identifies nine new loci associated with rheumatoid arthritis in the Japanese population.2012

    • Author(s)
      Okada Y 他
    • Journal Title

      Nat. Genet.

      Volume: 44(5) Pages: 511-517

    • DOI

      10.1038/ng.2231.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genomic-wide association studies of tuberculosis in Asians identify distinct at-risk locus for young tuberculosis.2012

    • Author(s)
      Mahasirimongkol S 他
    • Journal Title

      J. Hum. Genet.

      Volume: 57(6) Pages: 363-367

    • DOI

      10.1038/jhg.2012.35.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-wide association study confirming association of HLA-DP with protection against chronic hepatitis B and viral clearance in Japanese and Korean.2012

    • Author(s)
      Nishida N 他
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 7(6) Pages: e39175

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0039175

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] HLA-A*0206 with TLR3 polymorphisms exerts more than additive effects in Stevens-Johnson syndrome with severe ocular surface complications.2012

    • Author(s)
      Ueta M 他
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 7(8) Pages: e43650

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0043650

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-wide association study identifies TNFSF15 and POU2AF1 as susceptibility loci for primary biliary cirrhosis in Japanese.2012

    • Author(s)
      Nakamura M 他
    • Journal Title

      Am. J. Hum. Genet.

      Volume: 91(4) Pages: 721-728

    • DOI

      10.1016/j.ajhg.2012.08.010

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Evolutionary Analysis of Classical HLA Class I and II Genes Suggests That Recent Positive Selection Acted on DPB1*04#8758;01 in Japanese Population.2012

    • Author(s)
      Kawashima M 他
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 7(10) Pages: e46806

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0046806

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Genomic approaches to the etiology of autoimmune diseases2012

    • Author(s)
      Tokunaga K
    • Organizer
      Centennial of Hashimoto Disease International Symposium Ⅱ - Autoimmune Diseases - Etiology and Therapeutics
    • Place of Presentation
      福岡
    • Year and Date
      2012-12-02
    • Invited
  • [Presentation] Genome-wide search for disease genes and drug response genes: Implications and perspectives2012

    • Author(s)
      Tokunaga K
    • Organizer
      The 39th International Symposium on Nucleic Acids Chemistry ISNAC2012
    • Place of Presentation
      名古屋
    • Year and Date
      2012-11-17
    • Invited
  • [Presentation] ナルコレプシーの疾患感受性遺伝子の探索及び治療への応用2012

    • Author(s)
      宮川 卓
    • Organizer
      日本睡眠学会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Year and Date
      2012-06-30
    • Invited
  • [Presentation] Genome-wide approaches to complex disease: advances and perspectives, Genomic Analysis of Diseases Workshop2012

    • Author(s)
      Tokunaga K
    • Organizer
      Nature Conference
    • Place of Presentation
      Hang zhou, China
    • Year and Date
      2012-05-18
    • Invited
  • [Book] 細胞2013

    • Author(s)
      澤井裕美
    • Total Pages
      58
    • Publisher
      ニューサイエンス社
  • [Remarks] 東京大学大学院医学系研究科人類遺伝学分野

    • URL

      http://www.humgenet.m.u-tokyo.ac.jp/

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 眼合併症を伴う重症薬疹の発症リスクの評価方法2013

    • Inventor(s)
      上田真由美、外園千恵、木下茂、徳永勝士、澤井裕美
    • Industrial Property Rights Holder
      東京大学、京都府立医科大学、凸版印刷株式会社
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2013-052232
    • Filing Date
      2013-03-14

URL: 

Published: 2018-02-02  

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