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2013 Fiscal Year Annual Research Report

HLA遺伝子群の多様性と疾病解析

Planned Research

Project AreaHLA polymorphism, disease and evolution
Project/Area Number 22133008
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

徳永 勝士  東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 教授 (40163977)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 宮川 卓  東京大学, 医学(系)研究科(研究院), 助教 (20512263)
本多 真  公益財団法人東京都医学総合研究所, その他部局等, プロジェクトリーダー (50370979)
Project Period (FY) 2010-06-23 – 2015-03-31
KeywordsHLA / 病因遺伝子 / ナルコレプシー / 自己免疫疾患 / 感染症
Research Abstract

本研究では、HLA領域およびゲノム全域における最新の多型解析技術を用いたゲノムワイド関連解析(GWAS)、各々のHLA遺伝子の多型解析、およびリシークエンシングを行い、ナルコレプシーなどの睡眠障害、肝炎などの感染症、1型糖尿病などの免疫関連疾患について病因HLA遺伝子および非HLA遺伝子を特定する。
平成25年度は、B型肝炎ウイルスの排除や病態進展、およびスティーブンス・ジョンソン症候群(SJS)の発症についての多施設共同GWASおよびHLA遺伝子群の詳細な多型解析を実施し、新たな感受性遺伝子・アリルを同定して論文発表した。またSJSについてはin silico 立体構造推定を行い、原因薬剤候補とHLA分子の結合性予測を行って論文発表した。関節リウマチに関する最大規模の国際共同研究にも参加し、100種類以上の感受性遺伝子を報告した。これらの成果により、発症・病態の分子機序について理解が深まり、また創薬のターゲットも見出された。また、ナルコレプシーについても最大規模のHLA遺伝子群多型解析を実施して新たな感受性アリルを見出すとともに、コピー数変異(CNV)解析により有意な関連を検出した。すでにGWASで同定した疾患感受性遺伝子(CPT1B)の機能検討により、risk SNPがナルコレプシー群のCPT1機能を有意に低下させること、またCPT1機能低下が臨床症状とも関連することを見出した。自己免疫機序についての検討では、TRIB2自己抗体陽性の患者血清から精製したIgGを脳室内投与すると、マウスのオレキシン細胞の著減が観察された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

B型肝炎、C型肝炎、スティーブンス・ジョンソン症候群など各種の免疫関連疾患についてゲノムワイド関連解析(GWAS)、HLA遺伝子群の多型解析などを実施し、新たなHLAおよび非HLA感受性遺伝子を見出すとともに、発症・病態機序に関する機能解析も進めた。

Strategy for Future Research Activity

より大規模なGWASの実施、並びにGWAS後のreplication studyや第一義的遺伝子多型の同定作業を進める。平行して、機能解析グループとの連携を深めるとともに、相互作用解析、パスウェイ解析なども導入して疾患発症機序の解明と創薬ターゲットの検出を目指す。

  • Research Products

    (16 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (8 results) (of which Peer Reviewed: 8 results) Presentation (5 results) (of which Invited: 4 results) Remarks (1 results) Patent(Industrial Property Rights) (2 results)

  • [Journal Article] New susceptibility and resistance HLA-DP alleles to HBV-related diseases identified by a trans-ethnic association study in Asia.2014

    • Author(s)
      Nishida N, Sawai H, Kashiwase K, Minami M, Sugiyama M, Seto WK, Yuen MF, Posuwan N, Poovorawan Y, Ahn SH, Han KH, Matsuura K, Tanaka Y, Kurosaki M, Asahina Y, Izumi N, Kang JK, (省略), Tokunaga K, and Mizokami M
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 9 Pages: e86449

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0086449

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genetics of rheumatoid arthritis contributes to biology and drug discovery.2014

    • Author(s)
      Okada Y, Wu D, Trynka G, Raj T, Terao C, Ikari K, Kochi Y, Ohmura K, Suzuki A, Yoshida S, Graham RR, Manoharan A, Ortmann W, Bhangale T, Denny JC, (省略), GARNET consortium, (以下省略).
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 506 Pages: 376-381

    • DOI

      10.1038/nature12873

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Lessons from genome-wide search for disease-related genes with special reference to HLA-disease associations.2014

    • Author(s)
      Tokunaga K
    • Journal Title

      Genes

      Volume: 5 Pages: e84-96

    • DOI

      10.3390/genes5010084

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-wide analysis of CNV (copy number variation) and their associations with narcolepsy in a Japanese population2014

    • Author(s)
      Yamasaki M, Miyagawa T, Toyoda H, Khor SS, Koike A, Nitta A, Akiyama K, Sasaki T, Honda M, and Tokunaga K
    • Journal Title

      J. Hum. Genet.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1038/jhg.2014.13.

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Independent strong association of HLA-A*02:06 and HLA-B*44:03 with cold medicine-related Stevens-Johnson syndrome with severe mucosal involvement.2014

    • Author(s)
      Ueta M, Kaniwa N, Sotozono C, Tokunaga K, Saito Y, Sawai H, Miyadera H, Sugiyama E, Maekawa K, Nakamura R, Nagato M, Aihara M, Matsunaga K, Takahashi Y, Furuya H, Muramatsu M, Ikezawa Z, and Kinoshita S.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Genome-wide association study of HLA-DQB1*06:02 negative essential hypersomnia.2013

    • Author(s)
      Khor SS, Miyagawa T, Toyoda H, Yamasaki M, Kawamura Y, Tanii H, Okazaki Y, Sasaki T, Lin L, Faraco J, Rico T, Honda Y, Honda M, Mignot E, Tokunaga K.
    • Journal Title

      PeerJ

      Volume: 1 Pages: e66

    • DOI

      10.7717/peerj.66

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Passive transfer of narcolepsy: Anti-TRIB2 autoantibody positive patient IgG causes hypothalamic orexin neuron loss and sleep attacks in mice.2013

    • Author(s)
      Katzav A, Arango MT, Kivity S, Tanaka S, Givaty G, Agmon-LevinN, Honda M, Anaya JM, Chapman J, Shoenfeld Y
    • Journal Title

      J. Autoimmun.

      Volume: 45 Pages: 24-30

    • DOI

      10.1016/j.jaut.2013.06.010

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] In silico risk assessment of HLA-A*02:06-associated Stevens-Johnson syndrome and toxic epidermal necrolysis (SJS/TEN) caused by cold medicine ingredients.2013

    • Author(s)
      Isogai H, Miyadera H, Ueta M, Sotozono C, Kinoshita S, Tokunaga K, and Hirayama N
    • Journal Title

      J. Toxicol.

      Volume: 2013 Pages: e514068

    • DOI

      10.1155/2013/514068

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] ゲノム・遺伝子解析研究がもたらす革新(教育講演)

    • Author(s)
      徳永勝士
    • Organizer
      第62回日本医学検査学会
    • Place of Presentation
      サンポートホール高松(高松市)
    • Invited
  • [Presentation] Single nucleotide polymorphisms (SNPs) in humans: Associations with disease susceptibilities and drug responses

    • Author(s)
      Katsushi Tokunaga
    • Organizer
      nternational Conference in Medicine and Public Health 2013 (ICMPH2013) “Healthy Society beyond Frontiers”
    • Place of Presentation
      Mahidol University, Siriraj Hospital(タイ国、バンコク市)
    • Invited
  • [Presentation] 肝炎の診断と治療、(シンポジウム「GWAS成果と応用」)

    • Author(s)
      徳永勝士
    • Organizer
      第58回日本人類遺伝学会大会
    • Place of Presentation
      江陽グランドホテル(仙台市)
    • Invited
  • [Presentation] ナルコレプシーの感受性遺伝子の探索及び治療への応用

    • Author(s)
      宮川 卓
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第58回大会(受賞講演)
    • Place of Presentation
      江陽グランドホテル(仙台市)
  • [Presentation] 10-50 years long-term prognosis of narcolepsy

    • Author(s)
      Honda M, Doi Y, Honda Y
    • Organizer
      Asian Narcolepsy Forum 2013
    • Place of Presentation
      Korea
    • Invited
  • [Remarks] 東京大学医学系研究科人類遺伝学分野ホームページ

    • URL

      http://www.humgenet.m.u-tokyo.ac.jp/

  • [Patent(Industrial Property Rights)] 眼合併症を伴う重症薬疹の発症リスクの評価方法2014

    • Inventor(s)
      上田真由美、外園千恵、木下茂、徳永勝士、澤井裕美
    • Industrial Property Rights Holder
      京都府立医科大学、東京大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願2014-052761
    • Filing Date
      2014-03-14
  • [Patent(Industrial Property Rights)] B型肝炎の慢性化に関与するHLA遺伝子多型2013

    • Inventor(s)
      徳永勝士、澤井裕美、溝上雅史、西田奈央
    • Industrial Property Rights Holder
      東京大学、国立国際医療研究センター
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      特願 2013-179634
    • Filing Date
      2013-08-30

URL: 

Published: 2015-05-28  

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