2011 Fiscal Year Annual Research Report
治療によって修飾されるがんのゲノミクス解析とバイオマーカー探索
| Project Area | Integrative Systems Understanding of Cancer for Advanced Diagnosis, Therapy and Prevention |
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22134003
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
石川 俊平 東京大学, 大学院・医学系研究科, 准教授 (50418638)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
前田 大地 東京大学, 医学部付属病院, 助教 (30585500)
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| Keywords | がん / ゲノミクス / 治療薬 / バイオマーカー |
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| Research Abstract |
がんにおける治療薬の効果、副作用に関わるバイオマーカー探索は、市販後ある程度時間がたち多くの臨床サンプルを収集することによって為されるのが通常であり、治験プロトコールの改定といった臨床開発早期における効果的な対応には必ずしも直結しないことが多い。新世代の抗腫瘍薬であり低分子multi-kinase inhibitor、エピゲノム修飾薬などは抗腫瘍性効果の重要標的が必ずしも明確ではなく、ターゲットアプローチによるバイオマーカーの探索を困難にしている。また一方で近年の超並列型シーケンシングの技術によりがんにおける塩基レベルでの体細胞量的、質的ゲノム変異、エピゲノムの変異が全ゲノムスケールで同定可能となっている。
本提案では培養細胞株等を用いて比較的世代の新しい抗腫瘍薬、臨床開発中の新薬を対象に系統的に耐性株を樹立し耐性獲得過程におけるダイナミックなゲノミクス解析を行うことにより治療薬のゲノム、エピゲノムのバイオマーカー候補を同定すること行う。それら候補については機能的実験、実際の臨床検体における奏功性、副作用の発現、耐性の獲得との比較を行うことにより薬剤の真の重要標的分子、バイオマーカーの同定を行う。最終的には臨床開発早期におけるバイオマーカーの同定を可能とし開発側のバイオマーカーを用いた積極的な臨床開発への先鞭をつけることを目的とする。本年は度複数の抗腫瘍薬について耐性獲得が確認されたのに加え、半導体シーケンサーを用いた薬剤耐性の評価に関わる解析技術の一次的な完成をみた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初の予定通り、薬剤耐性株の樹立が確認されたのに加え半導体シーケンサーを用いた薬剤耐性の評価に関わる解析技術の一次的な完成をみた。
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| Strategy for Future Research Activity |
計画通り治療、薬剤に応答するダイナミックなゲノム情報の取得を目指す予定である。耐性の起きにくい細胞に関しては継時的な発現解析、functional genomicsの手法等を用いて探索していく予定。
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Research Products
(9 results)
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[Journal Article] ASCL1-coexpression profiling but not single gene expression profiling defines lung adenocarcinomas of neuroendocrine nature with poor prognosis2012
Author(s)
Fujiwara T, Hiramatsu M, Isagawa T, Ninomiya H, Inamura K, Ishikawa S, Ushijima M, Matsuura M, Jones MH, Shimane M, Nomura H, Ishikawa Y, Aburatani H
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Journal Title
Lung Cancer
Volume: 75
Pages: 119-125
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Homozygously deleted gene DACH1 regulates tumor-initiating activity of glioma cells2011
Author(s)
Watanabe A, Ogiwara H, Ehata S, Mukasa A, Ishikawa S, Maeda D, Ueki K, Ino Y, Todo T, Yamada Y, Fukayama M, Saito N, Miyazono K, Aburatani H
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Journal Title
Proc Natl Acad Sci USA
Volume: 26
Pages: 12384-12389
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] B-catenin (CTNNB1) S33C mutation in ovarian microcystic stromal tumors2011
Author(s)
Maeda D, Shibahara J, Sakuma T, Isobe M, Teshima S, Mori M, Oda K, Nakagawa S, Taketani Y, Ishikawa S, Fukayama M
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Journal Title
Am J Surg Pathol
Volume: 35
Pages: 1429-1440
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Tissue-specific demethylation in CpG-poor promoters during cellular differentiation2011
Author(s)
Nagae G, Isagawa T, Shiraki N, Fujita T, Yamamoto S, Tsutsumi S, Nonaka A, Yoshiba S, Matsusaka K, Midorikawa Y, Ishikawa S, Soejima H, Fukayama M, Suemori H, Nakatsuji N, Kume S, Aburatani H
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Journal Title
Hum Mol Genet
Volume: 15
Pages: 2710-2721
DOI
Peer Reviewed
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