2022 Fiscal Year Annual Research Report
Mechanisms of sex-extinction avoidance approaching from frequent XY/ZW sex-chromosome turnover in amphibians
| Project Area | Sex-chromosome cycle: Dissecting mechanisms of sex-extinction avoidance approaching from sex-chromosome turnover |
|---|
| Project/Area Number |
22H05070
|
|---|
| Research Institution | Kyoto University |
|---|
Principal Investigator |
桂 有加子 京都大学, ヒト行動進化研究センター, 助教 (00624727)
|
|---|
| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
井川 武 広島大学, 両生類研究センター, 准教授 (00507197)
|
|---|
| Project Period (FY) |
2022-05-20 – 2025-03-31
|
| Keywords | 性染色体 / ゲノム / トランスクリプトーム / ターンオーバー / 両生類 |
|---|
| Outline of Annual Research Achievements |
本研究の目的は、両生類でXY型からZW型への性染色体の入れ替わりが生じるプロセスを明らかにすることである。そのために、XY型とZW型をもつツチガエルとネッタイツメガエルの両生類2種の大規模な塩基配列情報を決定し、性染色体配列を同定し、集団あるいは系統間での性染色体の違いを明らかにする。2023年度は、塩基配列情報の解析により、日本に分布するツチガエル集団の系統関係を明らかにした。さらに、X,Y,Z,W染色体由来の配列の解析により、Y染色体とZ染色体の相同性が高いことを明らかにした。以上について学会等で発表を行った。また、実験に利用するために、6-7月にツチガエル2集団の野外サンプリングを行い、研究室で飼育を継続している。繁殖期のツチガエルの自然交配により、オタマジャクシから未分化な性腺を含む組織を採取し、RNA抽出を行った。ネッタイツメガエルについて4近交系統での性決定時期の幼生組織のRNA-seq解析を行った。雌雄で多型のあるゲノム領域をGRAS-Di 法により決定した。以上より、一部系統で性決定候補遺伝子の絞り込みに成功した。
|
| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
当初予定していた通り、両生類2種において大規模な塩基配列情報の決定を行い、性染色体及び性決定候補遺伝子の絞り込みを行うことができたため。
|
| Strategy for Future Research Activity |
今後は、ツチガエルの2個体（XX,ZZ）についてPacBio Revioシステムによるロングリードシーケンスの染色体レベルでのアッセンブルを行う。また、RNA-seq法による遺伝子発現解析を行い、雌雄で発現差のある遺伝子を同定し、性決定候補遺伝子の探索を行う。ネッタイツメガエルについては、性決定候補遺伝子が性決定に関わっている可能性についてCRISPR-Cas9システムを用いた機能欠失・獲得実験による性決定配列の同定を検討する。
|
-
-
[Journal Article] Cryo-injury procedure-induced cardiac regeneration shows unique gene expression profiles in the newt?Pleurodeles waltl.2022
Author(s)
Hitoshi Uemasu, Hiromi Ikuta, Takeshi Igawa, Makoto Suzuki, Mizuki Kyakuno, Yui Iwata, Ichiro Tazawa, Hajime Ogino, Yukio Satoh, Takashi Takeuchi, Noriyuki Namba, Toshinori Hayashi
-
Journal Title
Developmental Dynamics
Volume: 251
Pages: 864-876
DOI
Peer Reviewed / Open Access
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
-
[Presentation] Case Report: Findings and Statements got through the Next Generation Leadership Researchers Roundtable I and II2023
Author(s)
Michiyo Shimamura, Yuri Fujii, Zenki Hirakawa, Masanori Isobe, Kiyoshi Ito, Yukako Katsura, Mokottunas Kitahara, Nako Maishi, Satoshi Matsuoka, Noriko Nagahori, Risa Nakahara, Nobuto Nakatsukasa Kanako Sasaki, Izumi Sato, Kosuke Shiraishi, Shiyu Sun, Misaki Toyofuku, Naoko Yasui, Minako Jen Yoshikawa
Organizer
OIST Inclusive Leadership Symposium
Int'l Joint Research
-
-
-
-
-
-
-
-
[Presentation] Function of cyclin D1 in the regulation of the cell cycle in newts2022
Author(s)
HitoshiUemasu,HiromiIkuta,TakeshiIgawa,MakotoSuzuki,MitsukiKyakuno,YuiIwata,IchiroTazawa,HajimeOgino,YukioSatoh,TakashiTakeuchi,NoriyukiNamba,ToshinoriHayashi
Organizer
55th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists
Int'l Joint Research
-
-
-
-
-
-
[Presentation] NBRP Clawed frogs / Newt Genetic and genomic resources of amphibian model organisms and their applications2022
Author(s)
Makoto Suzuki, Takeshi Igawa, Nanoka Suzuki, Ichiro Tazawa, Keisuke Nakajima, Nobuaki Furuno, Ken-ichi T. Suzuki, Haruki Ochi, Takashi Kato, Toshinori Hayashi, Hajime Ogino
Organizer
The 13th International Meeting of the Asian Network of Research Resource Centers (ANRRC 2022)
-
-
-
-
[Presentation] Epigenome microevolution associated with DNA methyltransferases’ sequence-specificity alteration in H. pylori2022
Author(s)
Masaki Fukuyo, Hideo Yonezawa, Hirokazu Yano, Yukako Katsura, Koji Yahara, Mutsuko Konno, Tomoko Shibata, Shuji Shigenobu, Bahityar Rahmutulla, Ikuo Uchiyama, Yoshinori Hasegawa, Osamu Ohara, Atsushi Kaneda, Ichizo Kobayashi
Organizer
CHRO2022 (the 21st International workshop on Campylobacter, Helicobacter and Related Organisms)
Int'l Joint Research
