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2012 Fiscal Year Annual Research Report

Mode-of-action of endogenous factor controlling biological phenomena

Planned Research

Project AreaChemical Biology using bioactive natural products as specific ligands: identification of molecular targets and regulation of bioactivity
Project/Area Number 23102012
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

上田 実  東北大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (60265931)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2016-03-31
Keywords天然物ケミカルバイオロジー / 標的同定
Outline of Annual Research Achievements

本年度の研究においては、コンパクト分子プローブ法による植物ホルモン類縁体の新規標的タンパク質の精製に成功した。同様に、両鏡像体型分子プローブと遺伝子変異株を用いた生物検定試験を組み合わせることで植物病原菌由来植物毒素の新規標的発見の可能性を見いだすことが出来た。また、遺伝子トランスフェクション細胞系を用いるレポーターアッセイによって、ヒトの内因性ステロイド化合物の新規標的の同定も行った。
これらの例から、生体内においては、ある天然物リガンドが構造修飾されることによって、全く異なる生物活性と分子標的を持つに至るという、我々の提唱する「鍵束」説を証明する知見を得ると共に、「鍵束」から目的に応じた「鍵」を取り出すために、生体が用いる巧妙な戦略にもアプローチすることが出来た。このように、本年の研究には大きな進展があり、また、これら成果は、内因性生理活性リガンドの生体内活性制御機構に関する新知見に繋がる発見でもある。これらの研究成果は、単なる標的同定にとどまらず、そこから、生理活性リガンドの活性調節機構に関する新しい化学的知見を得るための分子的基盤をなすものである。
新学術領域「天然物ケミカルバイオロジー」の目的は、生理活性リガンドの標的同定の成功例を増やし、統一的知見の蓄積による標的同定の成功率向上を目指すと共に、そこから何らかの新しい科学的知見を得ることで、それを足がかりとして生理活性物質に関する科学を一段上のステージに引き上げることである。その観点から、本年度の成果は、まさにそのフラッグシップ的な内容となった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

本年度の研究において、当初想定していた2つの天然物リガンドの標的決定をほぼ終了することが出来た。また、これによって、生体内における内因性生理活性リガンドの活性調節に新たな機構を提唱するための分子的基盤を構築することが出来た。研究は予想を大幅に上回る進展を見せている。

Strategy for Future Research Activity

今後は、得られた成果を論文発表するために、バリデーション実験を重点的に遂行することになる。バリデーションのための異種発現系やRNAi実験などは予備実験を含めて遂行中であるが、今後実験場の困難に直面する可能性がある。その場合には、適宜、他の方策を採択することになろう。
また、コンパクト分子プローブ法とアフィニティー精製法との効率の比較による、分子標的同定のための方法的指針を策定する必要がある。また、これと平行して、天然物リガンドの標的決定の先を見据えた展開を計画している。すなわち、上記の生体内活性調節機構のスイッチ機構の発見である。
生体内で活性変化のスイッチを入れるメカニズムが発見できれば、創薬展開などの将来の応用を視野に入れた展開に道を開くことが出来よう。

  • Research Products

    (14 results)

All 2013 2012

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (9 results) (of which Invited: 9 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Triazoyl-Phenyl Linker System Enhancing Aqueous Solubility of Molecular Probe and Efficiency in Affinity Labeling of Target Protein for Jasmonate Glucoside2013

    • Author(s)
      S. Tamura, S. Inomata, M. Ebine, T. Genji, I. Iwakura, M. Mukai, M. Shoji, T. Sugai, M. Ueda
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem. Lett.

      Volume: 23 Pages: 188-193

    • DOI

      10.1016/j.bmcl.2012.10.124

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Stereoselective Construction of cis-Decalin Framework via Radical Domino Cyclization,2013

    • Author(s)
      E. Suzuki, M. Ueda, S. Ohba, T. Sugai, M. Shoji
    • Journal Title

      Tetrahedron Lett.

      Volume: 54 Pages: 1589-1592

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Hybrid Stereoisomers of Compact Molecular Probes Based on Jasmonic Acid Glucoside: Syntheses and Biological Evaluations,2012

    • Author(s)
      M. Ueda, G. Yang, Y. Ishimaru, S. Tamura, T. Itabashi, K. Kiyota, S. Kuwahara, S. Inomata, M. Shoji, T. Sugai
    • Journal Title

      Bioorg. Med. Chem.,

      Volume: 20 Pages: 5832-5843

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Creation of Pure Nanodrugs and Their Anticancer Properties2012

    • Author(s)
      H. Kasai, T. Murakami, Y. Ikuta, Y. Koseki, K. Baba, H. Oikawa, H. Nakanishi, M. Okada, M. Shoji, M. Ueda, H. Imahori, M. Hashida
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 51 Pages: 10315-10318

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] "Glycosylation Switching"による天然物リガンドの活性制御2013

    • Author(s)
      上田 実
    • Organizer
      日本化学会第93春期年会
    • Place of Presentation
      立命館大学
    • Year and Date
      2013-03-22 – 2013-03-25
    • Invited
  • [Presentation] “Glycosylation Switching”: Glycosylation regulates mode-of-action of bioactive natural products2012

    • Author(s)
      上田 実
    • Organizer
      3rd International Symposium on Creation of Functional Materials-Life Science and Materials
    • Place of Presentation
      筑波大学
    • Year and Date
      2012-12-11 – 2012-12-11
    • Invited
  • [Presentation] 配糖体型天然物リガンドのケミカルバイオロジーに見る活性制御の新戦略2012

    • Author(s)
      上田 実
    • Organizer
      後期(秋期)有機合成化学講習会
    • Place of Presentation
      日本薬学会長井記念館
    • Year and Date
      2012-11-20 – 2012-11-21
    • Invited
  • [Presentation] 「植物の運動」の化学生物学2012

    • Author(s)
      上田 実
    • Organizer
      第12回学習院大学生命科学シンポジウム
    • Place of Presentation
      学習院大学
    • Year and Date
      2012-11-15 – 2012-11-15
    • Invited
  • [Presentation] Chemical Biology of Naturally Occurring Glycosides: "Glycosylation Switching"2012

    • Author(s)
      上田 実
    • Organizer
      The International Symposium on Chemical Biology of Natural Products
    • Place of Presentation
      京都センチュリーホテル
    • Year and Date
      2012-10-31 – 2012-10-31
    • Invited
  • [Presentation] 配糖体型天然物リガンドのケミカルバイオロジーに見る活性制御の新戦略2012

    • Author(s)
      上田 実
    • Organizer
      2012年生命医薬情報学連合大会
    • Place of Presentation
      船橋タワーホール
    • Year and Date
      2012-10-10 – 2012-10-10
    • Invited
  • [Presentation] 天然物ケミカルバイオロジー:配糖体リガンドの新しい機能2012

    • Author(s)
      上田 実
    • Organizer
      早稲田大学FBT生物学・化学・情報科学融合のための戦略的先進理工学研究基盤の形成
    • Place of Presentation
      早稲田大学
    • Year and Date
      2012-09-20 – 2012-09-20
    • Invited
  • [Presentation] Chemical Biology of Glycoside Natural Products2012

    • Author(s)
      上田 実
    • Organizer
      The International Symposium on Chemical Biology of Natural Products
    • Place of Presentation
      沖縄
    • Year and Date
      2012-07-09 – 2012-07-10
    • Invited
  • [Presentation] 天然物ケミカルバイオロジー:生物現象と天然物リガンド2012

    • Author(s)
      上田 実
    • Organizer
      名古屋大学IGERグリーン自然科学レクチャー
    • Place of Presentation
      名古屋大学
    • Year and Date
      2012-06-24 – 2012-06-24
    • Invited
  • [Book] A. Volkov eds. “Plant Electrophysiology Signaling and Responses”2012

    • Author(s)
      Y. Ishimaru, S. Hamamoto, N. Uozumi, and M. Ueda
    • Total Pages
      pp. 125-142
    • Publisher
      Springer-Verlag

URL: 

Published: 2018-02-02  

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