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2015 Fiscal Year Annual Research Report

集団遺伝学理論と比較ゲノムによる非コードDNA領域の進化メカニズム

Planned Research

Project AreaFunctions of non-coding DNA region for genome integrity
Project/Area Number 23114004
Research InstitutionThe Graduate University for Advanced Studies

Principal Investigator

印南 秀樹  総合研究大学院大学, その他の研究科, 准教授 (90444140)

Project Period (FY) 2011-04-01 – 2016-03-31
Keywords集団遺伝 / ゲノム進化
Outline of Annual Research Achievements

本提案領域は、生命体の設計図であるゲノムの機能を統合的に解明することを目的とする。特に、遺伝子コード領域だけでなく、それを総括して支配する非コード領域の役目を重要視する。印南班は「非コード配列チーム」に属し、特に塩基配列の解析を中心に行い、全ての班と連携して研究を推進してきた。
本研究では、非コード領域にどのような自然選択が働き、どのような過程で進化してきたかを明らかにする。本年度は、植物のトランスポゾンの進化過程において水平移動がどれくらい貢献したかを解析した。理論的には、トランスポゾンがゲノム中で頻度を上げたり下げたりする過程を記述し、そのなかで新しいトランスポゾンファミリーが形成されるモデルを提唱した。一方、枯草菌の実験進化研究も推進し、結果を解析中である。また、ウマ350頭の全ゲノムSNP解析も進行中である。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (3 results)

All 2015

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Book (1 results)

  • [Journal Article] Evaluating the performance of neutrality tests of a local community using a niche-structured simulation model.2015

    • Author(s)
      Takeuchi, Y., and H. Innan
    • Journal Title

      Oikos

      Volume: 124 Pages: 1203-1214

    • DOI

      10.1111/oik.01703

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Spreading good news2015

    • Author(s)
      Fawcett, J. A., and H. Innan
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 4 Pages: e07108

    • DOI

      10.7554/eLife.05899

  • [Book] ゲノム進化メカニズムと情報学的解析2015

    • Author(s)
      岩嵜航、印南秀樹
    • Total Pages
      12
    • Publisher
      化学同人

URL: 

Published: 2017-01-06  

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