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2012 Fiscal Year Annual Research Report

Development of novel methods for single cell quantification with microdevices

Planned Research

Project AreaSpying minority in biological phenomena -Toward bridging dynamics between individual and ensemble processes-
Project/Area Number 23115002
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

野地 博行  東京大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (00343111)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 渡邉 朋信  独立行政法人理化学研究所, その他部局等, 研究員 (00375205)
市村 垂生  独立行政法人理化学研究所, その他部局等, 研究員 (50600748)
Project Period (FY) 2011-04-01 – 2016-03-31
KeywordsELISA / 超解像 / マイクロデバイス / 1分子検出
Outline of Annual Research Achievements

1細胞デジタルELISA
昨年度の研究のにおいて、大腸菌1個体中に存在するβーgalactosidaseの直接計数を試みた。具体的には、大腸菌が1個体であることを顕微鏡下で確認し、溶菌処理を行った。そこへ、βーgalactosidaseのフルオロジェニックな基質であるFDGをくわえ、ドロップレットを作成し、蛍光を発するチャンバーの数を数えた。すると、大腸菌1個体当たり428個という結果を得た。しかしながら、本実験においては、バックグランドが同程度となっており、信頼のおける数字とは言い難い。
高速超解像蛍光顕微鏡の開発
本研究は、細胞内における分子を網羅的に観察することを目的として、目標値として30nm/30msを設定し、様々な方面からの超解像技術の開発を行う。方法論に捕らわれることなく、目標を達成しうるあらゆる開発手段を用いる。本年度も引き続き、以下の2種類の開発を試みる。波長分離型超解像法:我々がすでに開発した瞳変調超解像法による120nm/2msでの一分子計測法は、すでに確立できている。さらに、蛍光揺らぎによる超解像を合わせることで、85nm/20msの時空間分解能は可能である。分子を標識する蛍光分子の色をN色にすることで、各色における標識濃度を減らすことができる。すなわち、検出分解能は向上する。その向上は、√N倍である。例えば、10色の蛍光色素で染色すれば、理論計算上27nmまで 空間分解能が向上する。ベクトルビームによる高速超解像:照射するレーザーの位相を空間的に変調することで、回折限界を超える点光源による照射が可能である。上記は、光軸方向の分解能が低下することが問題とされているが、全反射証明法を応用することにより解決される。MEMSミラーを用いて、多数のベクトルビームを作成し、一斉操作を行うことで、空間分解能、時間分解能共に向上する。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

昨年度は、高感度化したデジタルELISAを利用することで大腸菌1個体のβーgalactosidaseの計数にとりあえずは成功した事で、当初の計画より大きく進展していると考える。また、その他の項目も計画通り遂行されている。

Strategy for Future Research Activity

計画より進展していることから、今後も計画に変更無く遂行する。また、当初計画より進展した部分に関しては計画を前倒しておこなう。

  • Research Products

    (7 results)

All 2013 2012

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results) Presentation (3 results) (of which Invited: 3 results)

  • [Journal Article] Label-free single-particle imaging of the influenza virus by objective-type total internal reflection dark-field microscopy2012

    • Author(s)
      Enoki S
    • Journal Title

      PLoS ONE

      Volume: 7 Pages: e49208

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0049208

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Changes in Cytosolic ATP Levels and Intracellular Morphology during Bacteria-Induced Hypersensitive Cell Death as Revealed by Real-Time Fluorescence Microscopy Imaging2012

    • Author(s)
      Hatsugai N
    • Journal Title

      Plant and Cell Physiology

      Volume: 53 Pages: 1768-1775

    • DOI

      10.1093/pcp/pcs119

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Large-scale femtoliter droplet array for digital counting of single biomolecules2012

    • Author(s)
      Kim SH
    • Journal Title

      Lab on a Chip

      Volume: 12 Pages: 4986-4991

    • DOI

      10.1039/C2LC40632B

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A single-cell drug efflux assay in bacteria by using a directly accessible femtoliter droplet array2012

    • Author(s)
      Iino R
    • Journal Title

      Lab on a Chip

      Volume: 12 Pages: 3923-3929

    • DOI

      10.1039/C2LC40394C

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Design Principle of F1‐ATPase Rotary Molecular Motor2013

    • Author(s)
      Hiroyuki Noji
    • Organizer
      日仏セミナー
    • Place of Presentation
      在日フランス大使館(東京都)
    • Year and Date
      2013-02-06
    • Invited
  • [Presentation] Single-molecule digital counting of proteins2012

    • Author(s)
      Hiroyuki Noji
    • Organizer
      Paradigm Innovation in Biology: Novel Strategy and Thinking
    • Place of Presentation
      中央科学院(Taipei) (Taiwan)
    • Year and Date
      2012-10-17
    • Invited
  • [Presentation] Single-Molecule Digital Bioassay with a Million Droplets Array2012

    • Author(s)
      Hiroyuki Noji
    • Organizer
      International Conference Session 5
    • Place of Presentation
      幕張メッセ(千葉県)
    • Year and Date
      2012-09-07
    • Invited

URL: 

Published: 2018-02-02  

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