2011 Fiscal Year Annual Research Report
代謝シグナルが投射されるゲノム領域の同定と転写環境調節機構の解明
| Project Area | Crosstalk of transcriptional control and energy pathways by hub metabolites |
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| Project/Area Number |
23116006
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| Research Category |
Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)
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| Research Institution | University of Tsukuba |
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Principal Investigator |
矢作 直也 筑波大学, 医学医療系, 准教授 (60420246)
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| Keywords | 転写複合体 |
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| Research Abstract |
代謝シグナルを受けた遺伝子発現制御機構の中で、転写因子が特定のゲノムDNA配列を読み取る「目」となって作用するには、複数の核内因子とゲノム上で複合体を構成することが重要である。本研究では、in vivo Ad-luc解析法に、さらに我々が独自に開発したゲノム上の全転写因子を網羅した発現ライブラリー (TFEL：Transcription Factor Expression Library) を用いた転写複合体解析法を組み合わせ、様々なエネルギー代謝シグナルが投射されるゲノム上の領域を同定し、その領域上におけるエピゲノム情報を含めた転写環境制御機構の解明を通じて、最終的には、エネルギー貯蔵と消費のバランス制御の転写調節機構の全体像を明らかにすることを目指す。
平成23年度においては、従来より進めてきた中性脂肪合成系の転写調節カスケードの解明をさらに進め、SREBP-1cの上流のKLF15遺伝子の、さらにその上流の調節因子の探索を中心に行った。さらに、KLF15の解析と並行して、「絶食シグナル」を受けて動く経路の解析を進めた。
また上記により得られた代謝シグナル投射領域上にどのような転写因子複合体が形成されているかを我々が独自に開発したTFEL scan法という方法により解析を進めた。
さらに各複合体構成要素分子のメチル化・アセチル化などの分子修飾の状態についても探索を行った。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
KLF15上流のcis-element解析をほぼ完了することが出来たため、順調に進展していると考えている。
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| Strategy for Future Research Activity |
KLF15上流のcis-element(代謝シグナル投射領域)について、TFEL scanによる転写複合体解明を中心に進める予定である。
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[Journal Article] TFE3 regulates muscle metabolic gene expression, increases glycogen stores, and enhances insulin sensitivity in mice.2012
Author(s)
Iwasaki H, Naka A, Iida KT, Nakagawa Y, Matsuzaka T, Ishii KA, Kobayashi K, Takahashi A, Yatoh S, Yahagi N, Sone H, Suzuki H, Yamada N, Shimano H
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Journal Title
Am J Physiol Endocrinol Metab
Volume: 302
Pages: E896-902
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Inhibition of ubiquitin ligase F-box and WD repeat domain-containing 7α (Fbw7α) causes hepatosteatosis through Kruppel-like factor 5 (KLF5)/peroxisome proliferator-activated receptor γ2 (PPARγ2) pathway but not SREBP-1c protein in mice.2011
Author(s)
Kumadaki S,Karasawa T,Matsuzaka T,Ema M,Nakagawa Y,Nakakuki M,Saito R,Yahagi N,Iwasaki H,Sone H,Takekoshi K,Yatoh S,Kobayashi K,Takahashi A,Suzuki H,Takahashi S,Yamada N,Shimano H
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Journal Title
J Biol Chem
Volume: 286
Pages: 40835-46
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Macrophage Elovl6 deficiency ameliorates foam cell formation and reduces atherosclerosis in low-density lipoprotein receptor-deficient mice.2011
Author(s)
Saito R,Matsuzaka T,Karasawa T,Sekiya M,Okada N,Igarashi M,Matsumori R,Ishii K,Nakagawa Y,Iwasaki H,Kobayashi K,Yatoh S,Takahashi A,Sone H,Suzuki H,Yahagi N,Yamada N,Shimano H
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Journal Title
Arterioscler Thromb Vasc Biol
Volume: 31
Pages: 1973-9
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Suppression of the pancreatic duodenal homeodomain transcription factor-1 (Pdx-1) promoter by sterol regulatory element-binding protein-1c (SREBP-1c).2011
Author(s)
Amemiya-Kudo M, Oka J, Takeuchi Y, Okazaki H, Yamamoto T, Yahagi N, Matsuzaka K, Okazaki S, Osuga J, Yamada N, Murase T, Shimano H
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Journal Title
J Biol Chem
Volume: 286
Pages: 27902-14
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Sterol regulatory element-binding protein-1 determines plasma remnant lipoproteins and accelerates atherosclerosis in low-density lipoprotein receptor-deficient mice.2011
Author(s)
Karasawa T,Takahashi A,Saito R,Sekiya M,Igarashi M,Iwasaki H,Miyahara S,Koyasu S,Nakagawa Y,Ishii K,Matsuzaka T,Kobayashi K,Yahagi N,Takekoshi K,Sone H,Yatoh S,Suzuki H,Yamada N,Shimano H
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Journal Title
Arterioscler Thromb Vasc Biol
Volume: 31
Pages: 1788-95
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Abrogation of neutral cholesterol ester hydrolytic activity causes adrenal enlargement.2011
Author(s)
Ohta K,SekiyaM,UozakiH,IgarashiM,Takase S,Kumagai M,Takanashi M,Takeuchi Y,Izumida Y,Kubota M,Nishi M,Okazaki H,Iizuka Y,Yahagi N,Yagyu H,Fukayama M,Kadowaki T,Ohashi K,Ishibashi S,Osuga JI
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Journal Title
Biochem Biophys Res Commun
Volume: 404
Pages: 254-60
DOI
Peer Reviewed
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