代謝シグナルが投射されるゲノム領域の同定と転写環境調節機構の解明

2015 Fiscal Year Annual Research Report

• Project Area: Crosstalk of transcriptional control and energy pathways by hub metabolites
• Project/Area Number: 23116006
• Research Institution: University of Tsukuba
• Principal Investigator: 矢作 直也 筑波大学, 医学医療系, 准教授 (60420246)
• Project Period (FY): 2011-04-01 – 2016-03-31
• Keywords: 転写複合体

Outline of Annual Research Achievements

代謝シグナルを受けた遺伝子発現制御機構の中で、転写因子が特定のゲノムDNA配列を読み取る「目」となって作用するには、複数の核内因子とゲノム上で複合体を構成することが重要である。研究代表者は、エネルギー代謝シグナルの解析のための個体を用いたアッセイ系として、in vivo Ad-luc解析法を確立してきた。本研究では、このin vivo Ad-luc解析法に、さらに我々が独自に開発したゲノム上の全転写因子を網羅した発現ライブラリー (TFEL：Transcription Factor Expression Library) を用いた転写複合体解析法を組み合わせ、様々なエネルギー代謝シグナルが投射されるゲノム上の領域を同定し、その領域上におけるエピゲノム情報を含めた転写環境制御機構の解明を通じて、最終的には、エネルギー貯蔵と消費のバランス制御の転写調節機構の全体像を明らかにすることを目指す。

平成27年度においては、従来より進めてきた中性脂肪合成系の転写調節カスケードの解析をさらに進め、SREBP-1cの上流のKLF15遺伝子の、さらにその上流の調節因子の探索、ならびに、「絶食シグナル」を受けて動く他の経路の解析を進めた。

また上記により得られた代謝シグナル投射領域上にどのような転写因子複合体が形成されているかを、我々が独自に開発したTFEL scan法ならびに、その改良版であるTFEL Multi-scan法を用いて解析を行った。さらに各複合体構成要素因子のメチル化・アセチル化などの分子修飾の状態についても探索を行い、修飾アミノ酸抗体の作成を行って解析した。

Research Progress Status

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

27年度が最終年度であるため、記入しない。

Research Products

• [Journal Article] Identification of human ELOVL5 enhancer regions controlled by SREBP. (2015)
  • Author(s): Shikama A, Shinozaki H, Takeuchi Y, Matsuzaka T, Aita Y, Murayama T, Sawada Y, Piao X, Toya N, Oya Y, Takarada A, Masuda Y, Nishi M, Kubota M, Izumida Y, Nakagawa Y, Iwasaki H, Kobayashi K, Yatoh S, Suzuki H, Yagyu H, Kawakami Y, Yamada N, Shimano H, Yahagi N
  • Journal Title: Biochem Biophys Res Commun. Volume: 465 Pages: 857-63
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2015.08.101
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Absence of Elovl6 attenuates steatohepatitis but promotes gallstone formation in a lithogenic diet-fed Ldlr(-/-) mouse model. (2015)
  • Author(s): Kuba M, Matsuzaka T, Matsumori R, Saito R, Kaga N, Taka H, Ikehata K, Okada N, Kikuchi T, Ohno H, Han SI, Takeuchi Y, Kobayashi K, Iwasaki H, Yatoh S, Suzuki H, Sone H, Yahagi N, Arakawa Y, Fujimura T, Nakagawa Y, Yamada N, Shimano H
  • Journal Title: Sci Rep. Volume: 5 Pages: 17604
  • DOI: 10.1038/srep17604
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Skeletal muscle-specific HMG-CoA reductase knockout mice exhibit rhabdomyolysis: A model for statin-induced myopathy. (2015)
  • Author(s): Osaki Y, Nakagawa Y, Miyahara S, Iwasaki H, Ishii A, Matsuzaka T, Kobayashi K, Yatoh S, Takahashi A, Yahagi N, Suzuki H, Sone H, Ohashi K, Ishibashi S, Yamada N, Shimano H
  • Journal Title: Biochem Biophys Res Commun. Volume: 466 Pages: 536-40
  • DOI: 10.1016/j.bbrc.2015.09.065
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Circulating malondialdehyde-modified LDL-related variables and coronary artery stenosis in asymptomatic patients with type 2 diabetes. (2015)
  • Author(s): Fujihara K, Suzuki H, Sato A, Kodama S, Heianza Y, Saito K, Iwasaki H, Kobayashi K, Yatoh S, Takahashi A, Yahagi N, Yagyu H, Sone H, Shimano H
  • Journal Title: J Diabetes Res. Volume: 2015 Pages: 507245
  • DOI: 10.1155/2015/507245
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] 肝臓からみた糖尿病の病態と治療 (2015)
  • Author(s): 矢作直也
  • Journal Title: 月刊糖尿病 Volume: 7 Pages: 14-20
• [Journal Article] 肝臓内グリコーゲンセンサーと飢餓応答 (2015)
  • Author(s): 矢作直也
  • Journal Title: The Lipid Volume: 26 Pages: 55-60
• [Journal Article] 肝臓から見た2型糖尿病・インスリン抵抗性 (2015)
  • Author(s): 矢作直也
  • Journal Title: 最新医学 Volume: 892 Pages: 601-610
• [Journal Article] 肝エネルギー代謝と自律神経 (2015)
  • Author(s): 矢作直也
  • Journal Title: 循環器内科 Volume: 78 Pages: 532-536
• [Presentation] 摂食・絶食サイクルの転写調節機構 (2015)
  • Author(s): 矢作直也, 武内謙憲, 西真貴子, 志鎌明人, 戸谷直樹, 沢田義一, 村山友樹, 和田亘弘, 李恩旭, 朴賢英, 會田雄一, 大屋友華里, 古賀俊介, 宝田亜矢子, 升田紫, 久保田みどり, 泉田欣彦
  • Organizer: BMB2015(第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会)
  • Place of Presentation: 神戸ポートピアホテル
  • Year and Date: 2015-12-01 – 2015-12-04
• [Presentation] 多価不飽和脂肪酸（PUFA）によるSREBP-1特異的な抑制機序の解明 (2015)
  • Author(s): 升田紫, 矢作直也, 武内謙憲, 和田亘弘, 李恩旭, 沢田義一, 朴賢英, 會田雄一, 戸谷直樹, 志鎌明人, 西真貴子, 久保田みどり, 泉田欣彦, 飯塚陽子, 位高啓史, 片岡一則, 山田信博, 島野仁, 門脇孝
  • Organizer: 第36回日本肥満学会
  • Place of Presentation: 名古屋国際会議場
  • Year and Date: 2015-10-02 – 2015-10-03
• [Presentation] In vivo Ad-luc analyses of Leptin gene expression. (2015)
  • Author(s): Toya N, Yahagi N, Takeuchi Y, Nishi M, Sawada Y, Piao XY, Aita Y, Oya Y, Shikama A, Masuda Y, Kubota M, Izumida Y, Matsuzaka T, Nakagawa Y, Yamada N, Kadowaki T, Shimano H
  • Organizer: Tsukuba Global Science Week 2015
  • Place of Presentation: つくば国際会議場
  • Year and Date: 2015-09-28 – 2015-09-30
  • Int'l Joint Research
• [Presentation] 脂肪組織におけるin vivo Ad-luc法によるfatty acid synthaseのプロモーター解析 (2015)
  • Author(s): 西真貴子, 矢作直也, 武内謙憲, 志鎌明人, 戸谷直樹, 大屋友華里, 朴賢英, 會田雄一, 沢田義一, 松坂賢, 中川嘉, 升田紫, 泉田欣彦, 飯塚陽子, 山田信博, 門脇孝, 島野仁
  • Organizer: 第58回日本糖尿病学会年次学術集会
  • Place of Presentation: 海峡メッセ下関
  • Year and Date: 2015-05-21 – 2015-05-24
• [Presentation] 多価不飽和脂肪酸（PUFA）によるSREBP-1特異的な抑制機序の解明 (2015)
  • Author(s): 升田紫, 矢作直也, 武内謙憲, 沢田義一, 朴賢英, 會田雄一, 戸谷直樹, 大屋友華里, 志鎌明人, 西真貴子, 久保田みどり, 泉田欣彦, 飯塚陽子, 位高啓史, 片岡一則, 山田信博, 島野仁, 門脇孝
  • Organizer: 第58回日本糖尿病学会年次学術集会
  • Place of Presentation: 海峡メッセ下関
  • Year and Date: 2015-05-21 – 2015-05-24
• [Presentation] Leptin遺伝子発現調節機構のin vivo Ad-luc解析 (2015)
  • Author(s): 戸谷直樹, 矢作直也, 武内謙憲, 西真貴子, 沢田義一, 朴賢英, 會田雄一, 大屋友華里, 志鎌明人, 松坂賢, 中川嘉, 升田紫, 久保田みどり, 泉田欣彦, 門脇孝, 山田信博, 島野仁
  • Organizer: 第58回日本糖尿病学会年次学術集会
  • Place of Presentation: 海峡メッセ下関
  • Year and Date: 2015-05-21 – 2015-05-24