2016 Fiscal Year Annual Research Report
Virus and host interaction on plus-strand RNA virus replication
| Project Area | Molecular basis of host cell competency in virus infection |
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| Project/Area Number |
24115003
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| Research Institution | National Institute of Infectious Diseases |
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Principal Investigator |
脇田 隆字 国立感染症研究所, 副所長, 副所長 (40280789)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
竹安 邦夫 京都大学, 生命科学研究科, 教授 (40135695)
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| Project Period (FY) |
2012-06-28 – 2017-03-31
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| Keywords | プラス鎖RNAウイルス / HCV / 宿主 / 原子間力顕微鏡 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
プラス鎖RNAウイルスは複製複合体を含む膜小胞を形成しその中で複製することが知られているが、その形成メカニズムについては不明である。我々はこれまでに、プロテオーム解析およびsiRNAスクリーニングにて、NS4B結合膜タンパクとしてPREBとSURF4を見出した。PREBはCOPIIを介した小胞体輸送に関与するタンパクとして知られている。HCV感染に伴いin vitroおよびin vivoでPREB発現の増加を認め、PREBはHCV複製複合体を含む膜小胞の形成・維持に重要な役割を果たしている。SURF4はCOPIを介した小胞体輸送に関与するタンパクで、HCV複製の場と考えられている界面活性剤不溶性分画に存在して、プラス鎖RNAウイルスの複製複合体を含む膜小胞の形成・維持に重要な役割を果たしている。さらに、COPIIおよびCOPI関連タンパクのSec23, Sec24, Sec13, Sec31, SAR1, Sec16, RAB1, CSNK1のHCV複製における役割を解析した。竹安分担者は感染体ゲノム-タンパク質複合体のナノメートルレベルの構造および感染体ゲノムの細胞内動態解析を担当した。1kb以上のRNA分子の構造解析は技術的にこれまで困難だったが、1本鎖RNAを基板（通常は劈開した雲母片）上に吸着させ、1本鎖RNAの本来の高次構造を保つことによりRNA構造解析をおこなった。画像解析の自動化プログラムを開発し、28S rRNA全長の構造を予測した。この予測と結晶構造解析から提唱されている 28S rRNA のモデルとを比較検討し、両者とも非常によく合うこと、また結晶構造解析からは不明であった部位の構造も予測可能であること、さらに、単離・精製の過程で、rRNAの構造は非常に安定であることが分かった。現在、80％が未知であるHCVのゲノム全体構造に解析に移った。
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| Research Progress Status |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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| Strategy for Future Research Activity |
28年度が最終年度であるため、記入しない。
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[Journal Article] Hepatitis C virus has a genetically determined lymphotropism through co-receptor B7.22017
Author(s)
Chen CL, Huang JY, Wang CH, Tahara SM, Zhou L, Kondo Y, Schechter J, Su L, Lai MM, Wakita T, Cosset FL, Jung JU, Machida K
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Journal Title
Nat Commun
Volume: 8
Pages: 13882
DOI
Peer Reviewed / Int'l Joint Research
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[Journal Article] Fungus-Derived Neoechinulin B as a Novel Antagonist of Liver X Receptor, Identified by Chemical Genetics Using a Hepatitis C Virus Cell Culture System2016
Author(s)
Nakajima S, Watashi K, Ohashi H, Kamisuki S, Izaguirre-Carbonell J, Kwon AT, Suzuki H, Kataoka M, Tsukuda S, Okada M, Moi ML, Takeuchi T, Arita M, Suzuki R, Aizaki H, Kato T, Suzuki T, Hasegawa H, Takasaki T, Sugawara F, Wakita T
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Journal Title
J Virol
Volume: 90(20)
Pages: 9058-74
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Single-domain intrabodies against HCV Core inhibit viral propagation and Core-induced NF-κB Activation2016
Author(s)
Suzuki R, Saito K, Matsuda M, Sato M, Kanegae Y, Shi G, Watashi K, Aizaki H, Chiba J, Saito I, Wakita T, Suzuki T
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Journal Title
J Gen Virol
Volume: 597(4)
Pages: 887-92
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Journal Article] Prolactin regulatory element binding protein is involved in hepatitis C virus replication compartment by interacting with NS4B2016
Author(s)
Kong L, Fujimoto A, Nakamura M, Aoyagi H, Matsuda M, Watashi K, Suzuki R, Arita M, Yamagoe S, Dohmae N, Suzuki T, Sakamaki Y, Ichinose S, Suzuki T, Wakita T, Aizaki H
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Journal Title
J Virol
Volume: 590(6)
Pages: 3093-111
DOI
Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
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[Presentation] Human hepatic stellate cells are permissive for hepatitis C virus infection/replication and play important roles in fibrosis2016
Author(s)
Takuma Zaitsu, Haruyo Aoyagi, Mami Matsuda, Noriyuki Watanabe, Akira Fujimoto, Koichi Watashi, Ryosuke Suzuki, Takasuke Fukuhara, Yoshiharu Matsuura, Ayako Mimata, Yuriko Sakamaki, Shizuko Ichinose, Kenjiro Wake, Tetsuro Suzuki, Hiroko Iijima, Tomokazu Matsuura, Koji Tamura, Takaji Wakita, Hideki Aizaki
Organizer
23rd International Symposium on Hepatitis C Virus and Related Viruses
Place of Presentation
Kyoto, Japan
Year and Date
2016-10-11 – 2016-10-15
Int'l Joint Research
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[Presentation] Sphingomyelin is a component in the membranous replication factories2016
Author(s)
Hossam Eid Gewaid, Haruyo Aoyagi, Koichi Watashi, Ryosuke Suzuki, Hussein Aly, Keigo Kumagai, Toshiyuki Yamaji, Masayoshi Fukasawa, Ayakom Mimata, Yuriko Sakamaki, Shizuko Ichinose, Kentaro Hanada, Takaji Wakita, Hideki Aizaki
Organizer
23rd International Symposium on Hepatitis C Virus and Related Viruses
Place of Presentation
Kyoto, Japan
Year and Date
2016-10-11 – 2016-10-15
Int'l Joint Research
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[Presentation] HCV Virology2016
Author(s)
Takaji Wakita, Lingbao Kong, Hideki Aizaki
Organizer
APASL STC
Place of Presentation
Kaohsiung, Taiwan
Year and Date
2016-06-10 – 2016-06-12
Int'l Joint Research / Invited
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[Book] Structural analysis of long single-stranded RNA molecules with atomic force microscopy imaging. In Oral A. Y., Oral Z. B. (eds.) 3rd Int. Multidiscip. Microsc. Microanal. Congr. Proc.2016
Author(s)
Gilmore JL, Yoshida A, Deguchi K, Asai S, Aizaki H, Kumeta M, Hyodo K, Okuno T, Wakita T, Tkeyasu K. et al
Total Pages
3-9
Publisher
Oludeniz, Fethiye/Mulga, Turkey
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