2014 Fiscal Year Annual Research Report
精神疾患患者死後脳における神経細胞ゲノム動態の解析
| Project Area | Unraveling micro-endophenotypes of psychiatric disorders at the molecular, cellular and circuit levels. |
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| Project/Area Number |
24116009
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
岩本 和也 東京大学, 医学部附属病院, 特任准教授 (40342753)
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| Project Period (FY) |
2012-06-28 – 2017-03-31
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| Keywords | 体細胞変異 / トランスポゾン / 精神疾患 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
レトロトランスポゾンLINE-1の体細胞転移と精神疾患様行動異常の相関を検討するため、神経発達障害動物モデルであるマウスpolyI:Cモデルを用い、様々な脳領域とL1コピー数の検討を行う。今年度は大規模な個体数での行動解析指標の取得を終え行動異常の発現の確認と、様々な脳領域および肝臓などの体細胞組織からゲノムDNA抽出を終えた。
モデルマウスにおけるLINE-1メチル化状態を検討するため、パイロシークエンシングを用いたマウスにおけるLINE-1メチル化率定量法の確立を行った。本定量法では、マウスで転移活性を保持している3種のLINE-1サブファミリーにおけるプロモーター領域のメチル化率を個別に測定する系の確立に成功した。本法を用い、polyI:Cモデル動物でのメチル化率定量を開始した。
また、ヒト死後脳微量DNAを対象としたLINE-1挿入部位検討法の確立のため、改良L1-HsSeq法を確立し、ヒト死後脳試料への応用を開始した。
トランスポゾン新規転移、一塩基多型や染色体異数性など、脳神経細胞における体細胞変異を網羅的にカタログ化するため、平均X100の深度での全ゲノム解析を大脳、小脳、神経細胞、非神経細胞および肝臓試料について行い、バイオインフォマティクス解析を開始した。一塩基多型についてはインフォマティクス解析が終了したサンプルについて、独立した手法を用いた検証実験を開始した。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
本年度計画していた、モデル動物を用いた相関解析、次世代シークエンサーによる超深度解析が順調に進展している。また、動物モデルにおける新規メチル化率定量法を確立した。
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| Strategy for Future Research Activity |
LINE-1転移について、モデル動物を用いた相関解析を続けるとともに、神経前駆細胞をターゲットとした因果関係や分子メカニズムの検討を行う、次世代シークエンサーのデータ解析は来年度一杯をかけて行う予定であるが、早い段階での検証実験を行っていく。
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[Presentation] 脳ゲノム解析と精神疾患2014
Author(s)
岩本和也、文東美紀、加藤忠史
Organizer
第37回日本分子生物学会
Place of Presentation
パシフィコ横浜(神奈川県)
Year and Date
2014-11-25 – 2014-11-27
Invited
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