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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Mechanism of Mycoplasma gliding

Planned Research

Project AreaHarmonized supramolecular machinery for motility and its diversity
Project/Area Number 24117002
Research InstitutionOsaka City University

Principal Investigator

宮田 真人  大阪市立大学, 大学院理学研究科, 教授 (50209912)

Project Period (FY) 2012-06-28 – 2017-03-31
Keywords細胞運動 / 一分子計測 / 電子顕微鏡 / 構造生物学 / 微生物 / 寄生細菌 / 電子線クライオトモグラフィー / 遺伝子操作
Outline of Annual Research Achievements

淡水魚の病原細菌,Mycoplasma mobile(モービレ)はその片側に滑走装置を形成し,ユニークなメカニズムで‘滑走運動’する.本研究ではこれまでの実験結果から提案した運動メカニズムの作業仮説,「滑走装置は4種類の新規巨大タンパク質から成る表面構造と,7種類のタンパク質から成る内部構造に分けられる.滑走装置からは長さ50ナノメートルのやわらかいあしが多数つきだしている.ATPの加水分解により装置に動きが生じ,あしのタンパク質が宿主細胞表面などのシアル酸オリゴ糖をつかんだり,ひっぱったり,はなしたりして,滑走運動が起こる.」に基づいた実験を行った.これまで不明であった内部構造とその動きを,蛍光タンパク質による標識,従来型電子顕微鏡法,クライオ電子顕微鏡法,高速原子間力顕微鏡法などで明らかにした.また,プラスチックビーズを,ガラス表面に固定した菌につかませることで,1本の動きを直接観察することに成功した.さらに遊離のシアル酸オリゴ糖を加えて働くあしの数を減らすことで,1本のあしの出す力が一般的なモータータンパク質の数分の1であることを突き止めた.
モービレと同じモリクテス綱に属するヒト病原細菌,Mycoplasma pneumoniae(ニューモニエ)は同様に滑走運動を行うが,必須タンパク質などにモービレとの共通性はない.この滑走のあしとして働くP1 adhesinの構造を,クライオ電子顕微鏡を用いた単粒子解析により,9オングストロームの解像度で明らかにした.さらに,モービレの研究で培った測定技術を応用することで,エネルギー源がATPであることを示した.
これまでの結果を基に,マイコプラズマ属,さらには全生物における運動能獲得過程の議論を行った.

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (53 results)

All 2018 2017 2016 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (12 results) (of which Int'l Joint Research: 2 results,  Peer Reviewed: 12 results,  Open Access: 12 results) Presentation (32 results) (of which Int'l Joint Research: 11 results,  Invited: 16 results) Book (2 results) Remarks (5 results)

  • [Int'l Joint Research] 南京師範大学(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      南京師範大学
  • [Int'l Joint Research] The Barcelona Inst. of Sci. and Tech./Universitat Pompeu Fabra, Barcelona(スペイン)

    • Country Name
      SPAIN
    • Counterpart Institution
      The Barcelona Inst. of Sci. and Tech./Universitat Pompeu Fabra, Barcelona
  • [Journal Article] Detailed analyses of stall force generation in Mycoplasma mobile gliding.2018

    • Author(s)
      Mizutani M, Tulum I, Kinosita Y, Nishizaka T and Miyata M
    • Journal Title

      Biophysical Journal

      Volume: 114 Pages: 1411-9

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2018.01.029.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] マイコプラズマ・モービレの滑走運動2018

    • Author(s)
      宮田真人
    • Journal Title

      生物工学会誌

      Volume: 96 Pages: 200-3

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Transformation of crustacean pathogenic bacterium Spiroplasma eriocheiris and expression of yellow fluorescent protein.2017

    • Author(s)
      Terahara N, Tulum I and Miyata M
    • Journal Title

      Biochemical and Biophysical Research Communication

      Volume: 487 Pages: 488-93

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2017.03.144.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Overall shapes of the SMC-ScpAB complex are determined by balance between constraint and relaxation of its structural parts.2017

    • Author(s)
      Kamada K, Suetsugu M, Takada H, Miyata M and Hirano T
    • Journal Title

      Structure

      Volume: 25 Pages: 603-16

    • DOI

      10.1016/j.str.2017.02.008.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Defined chromosome structure in a genome-reduced Mycoplasma pneumonia.2017

    • Author(s)
      Trussart M, Yus E, Martinez S, Ba? D, Tahara YO, Pengo T, Widjaja M, Kretschmer S, Swoger J, Miyata M, Marti-Renom MA, Lluch-Senar M and Serrano L
    • Journal Title

      Nature Communications

      Volume: 8 Pages: 14665

    • DOI

      10.1038/ncomms14665.

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Force measurement on Mycoplasma mobile gliding using optical tweezers.2017

    • Author(s)
      Mizutani M and Miyata M
    • Journal Title

      Bio protocol

      Volume: 7 Pages: Iss 3, 2/5/2017

    • DOI

      10.21769/BioProtoc.2127.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Chemotaxis without conventional two-component system, based on cell polarity and aerobic conditions in helicity-switching swimming of Spiroplasma eriocheiris.2017

    • Author(s)
      Liu P, Zheng H, Meng Q, Terahara N, Gu W, Wang S, Zhao G, Nakane D, Wang W and Miyata M
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 8 Pages: 58

    • DOI

      10.3389/fmicb.2017.00058.

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structural study of MPN387, an essential protein for gliding motility of a human pathogenic bacterium, Mycoplasma pneumoniae.2016

    • Author(s)
      Kawakita Y, Kinoshita M, Furukawa Y, Tulum I, Tahara YO, Katayama E, Namba K, and Miyata M
    • Journal Title

      Journal of Bacteriology

      Volume: 198 Pages: 2352-9

    • DOI

      10.1128/JB.00160-16.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Integrated information and prospects for gliding mechanism of the pathogenic bacterium Mycoplasma pneumoniae.2016

    • Author(s)
      Miyata M and Hamaguchi T
    • Journal Title

      Frontiers in Microbiology

      Volume: 7 Pages: 960

    • DOI

      10.3389/fmicb.2016.00960.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Directed binding of gliding bacterium, Mycoplasma mobile, shown by detachment force and bond lifetime.2016

    • Author(s)
      Tanaka A, Nakane D, Mizutani M, Nishizaka T and Miyata M
    • Journal Title

      mBio

      Volume: 7 Pages: e00455-16

    • DOI

      10.1128/mBio.00455-16.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Periodicity in attachment organelle revealed by electron cryotomography suggests conformational changes in gliding mechanism of Mycoplasma pneumoniae.2016

    • Author(s)
      Kawamoto A, Matsuo L, Kato T, Yamamoto H, Namba K and Miyata M
    • Journal Title

      mBio

      Volume: 7 Pages: e00243-16

    • DOI

      10.1128/mBio.00243-16.

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Journal Article] Prospects for the gliding mechanism of Mycoplasma mobile2016

    • Author(s)
      Miyata M Hamaguchi T
    • Journal Title

      Current Opinion in Microbiology

      Volume: 29 Pages: 15-21

    • DOI

      10.1016/j.mib.2015.08.010

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Mycoplasma mobile glides on fish gills by propulsion force of multiple legs2018

    • Author(s)
      水谷雅希,Isil Tulm,木下佳昭,西坂嵩之,宮田真人
    • Organizer
      第91回日本細菌学会総会
    • Invited
  • [Presentation] Motor evolved from F-ATPase for Mycoplasma mobile gliding2018

    • Author(s)
      豊永 拓真,加藤 貴之,川本 晃大,古寺 哲幸,安藤 敏夫,難波 啓一,宮田 真人
    • Organizer
      第91回日本細菌学会総会
  • [Presentation] 急速凍結レプリカ電子顕微鏡法および高速原子間力顕微鏡を用いたマイコプラズマモービレの滑走装置の可視化2018

    • Author(s)
      小林 昂平,古寺 哲幸,田原 悠平,豊永 拓真,笠井 大司,安藤 敏夫,宮田 真人
    • Organizer
      第91回日本細菌学会総会
  • [Presentation] 急速凍結レプリカ電子顕微鏡法の薦め2018

    • Author(s)
      宮田真人
    • Organizer
      9th OCARINA International Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Structure of P1 adhesin, the leg for infection of Mycoplasma pneumoniae, as novel sialic acid receptor2018

    • Author(s)
      Matsumoto U, Kawamoto A, Kato T, Kinoshita M, Kawakami Y, Kenr Ti, Mori S, Namba K, Miyata M
    • Organizer
      9th OCARINA International Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Approach to biological specimens and material observation using Quick-Freeze and Deep-Etch (QFDE) replica microscopy2018

    • Author(s)
      田原悠平,宮田真人
    • Organizer
      9th OCARINA International Symposium
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 第二のマイコプラズマ滑走運動,Mycoplasma gallisepticumの詳細解析2018

    • Author(s)
      水谷 雅希, 宮田 真人
    • Organizer
      2018年生体運動研究合同班会議
  • [Presentation] Gliding motility of Mycoplasma developed from rotary ATPase2017

    • Author(s)
      Miyata M
    • Organizer
      IGER International Symposium on Cell Surface Structures and Functions 2017
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 滑走するヒト肺炎原因菌 Mycoplasma pneumoniae の“あし”P1 adhesin2017

    • Author(s)
      豊永 拓真, 加藤 貴之, 川本 晃大, 難波 啓一, 宮田 真人
    • Organizer
      第55回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Motor evolved from F-ATPase for Mycoplasma mobile gliding2017

    • Author(s)
      松本 優,川本 晃大,加藤 貴之,川北 祥人,見理 剛,森 茂太郎,難波 啓一,宮田 真人,
    • Organizer
      第55回日本生物物理学会年会
  • [Presentation] Gliding motility of Mycoplasma mobile2017

    • Author(s)
      Miyata M
    • Organizer
      nternational Symposium on"Harmonized supramolecular motility machinery and its diversity"
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Application of Quick- freeze and deep-etch replication to motility and surface structure2017

    • Author(s)
      Tahara YO, Miyata M
    • Organizer
      nternational Symposium on"Harmonized supramolecular motility machinery and its diversity"
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Motor evolved from F-ATPase for Mycoplasma mobile Gliding2017

    • Author(s)
      Takuma Toyonaga, Takayuki Kato, Akihiro Kawamoto, Keiichi Namba, and Makoto Miyata
    • Organizer
      International Symposium on"Harmonized supramolecular motility machinery and its diversity"
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] マイコプラズマの滑走運動2017

    • Author(s)
      宮田真人
    • Organizer
      生体分子の形と機能(科学技術振興機構・2005-2007年度さきがけ)10年間の展開
  • [Presentation] ATP合成酵素から進化したマイコプラズマの滑走運動2017

    • Author(s)
      宮田真人
    • Organizer
      東京大学大学院工学系研究科 野地研究室セミナー
    • Invited
  • [Presentation] 感染と生き残り戦略から俯瞰するモリクテス綱の運動能2017

    • Author(s)
      宮田真人
    • Organizer
      日本マイコプラズマ学会第44回学術集会
    • Invited
  • [Presentation] Subcellular localization of internal structure of gliding machinery in Mycoplasma mobile2017

    • Author(s)
      TULUM I, 木村賢太, 宮田真人
    • Organizer
      日本マイコプラズマ学会第44回学術集会
  • [Presentation] 最小生物,マイコプラズマの滑走運動 -メカニズムと起源2017

    • Author(s)
      宮田真人
    • Organizer
      第3回山口大学理学部講演会
    • Invited
  • [Presentation] 運動超分子マシナリーと光センサータンパク質2017

    • Author(s)
      宮田真人, 寺北明久
    • Organizer
      8th OCARINA International Symposium
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] マイコプラズマ-滑走する肺炎細菌-2017

    • Author(s)
      宮田真人
    • Organizer
      平成28年度総合生命科学部シンポジウム/見ればわかる。見せる最新の生命科学
    • Invited
  • [Presentation] F1-ATPase から進化したマイコプラズマ滑走運動のモーター2017

    • Author(s)
      豊永拓真, 加藤貴之, 川本晃大, 浜口 祐, 田原悠平, 難波啓一, 宮田真人
    • Organizer
      2017年生体運動研究合同班会議
  • [Presentation] F-ATPase から進化したマイコプラズマ滑走運動/Mycoplasma gliding developed from F-type ATPase2016

    • Author(s)
      宮田真人
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Invited
  • [Presentation] 病原細菌,マイコプラズマの滑走運動2016

    • Author(s)
      宮田真人
    • Organizer
      大阪府立母子保健総合医療センター・DNA組換実験講習会
    • Invited
  • [Presentation] 肺炎細菌,マイコプラズマの滑走運動2016

    • Author(s)
      宮田真人
    • Organizer
      大阪市立大学・杉本・阿倍野ライフサイエンス談話会
    • Invited
  • [Presentation] 病原細菌,マイコプラズマの滑走運動 - メカニズムと起源 -2016

    • Author(s)
      宮田真人
    • Organizer
      第83回日本細菌学会北海道支部各術総会
    • Invited
  • [Presentation] 病原細菌,マイコプラズマの滑走運動 - メカニズムと起源 -2016

    • Author(s)
      宮田真人
    • Organizer
      北海道大学大学院歯学研究科セミナー
    • Invited
  • [Presentation] 最小生物,マイコプラズマの滑走運動2016

    • Author(s)
      宮田真人
    • Organizer
      第332回生物科学セミナー/大阪大学理学研究科生物学科
    • Invited
  • [Presentation] マイコプラズマ滑走運動2016

    • Author(s)
      宮田真人
    • Organizer
      大阪大学蛋白質研究所セミナー第6回分子モーター討論会分子モーターの研究の最前線
    • Invited
  • [Presentation] Characteristic motion of surface proteins involved in Mycoplasma mobile gliding observed by electron microscopy (EM) and high speed atomic force microscopy (AFM)2016

    • Author(s)
      Yuhei O. Tahara, Noriyuki Kodera, Toshio Ando, Makoto Miyata
    • Organizer
      21st Congress of International Organization for Mycoplasmology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Chemotaxis without two-component system, based on cell polarity and aerobic condition in "kink swimming" of crab pathogen, Spiroplasma eriocheiris2016

    • Author(s)
      Peng Liu, HuajunZheng, Quingguo Meng, Natsuho Terahara, Wei Gu, Shengyue Wang, Guoping Zhao, Daisuke Nakane, Wen Wang, Makoto Miyata
    • Organizer
      21st Congress of International Organization for Mycoplasmology
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Chemotaxis without two-component system, based on cell polarity and aerobic condition in "kink swimming" of crab pathogen, Spiroplasma eriocheiris2016

    • Author(s)
      Liu P, Zheng H, Meng Q, Terahara N, Gu W, Wang S, Zhao G, Nakane D, Wang W, Miyata M
    • Organizer
      21st Congress of International Organization for Mycoplasmolog
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] マイコプラズマの遺伝子操作/Gene manipulation of Mycoplasma2016

    • Author(s)
      Isil TULUM, 木村賢太, 宮田真人
    • Organizer
      日本マイコプラズマ学会第43回学術集会
    • Invited
  • [Book] CSJレビュー26 分子マシンの科学 分子の動きとその機能を見る2017

    • Author(s)
      宮田 真人、南後 守、橋爪 章仁、原田 明(ほか28名)
    • Total Pages
      182(14-21)
    • Publisher
      化学同人
    • ISBN
      978-4-7598-1386-9
  • [Book] 最新マイコプラズマ学2016

    • Author(s)
      神谷 茂, 泉川欣一, 賀来満男, 佐々木次雄, 難波成任, 宮田真人,大島 研郎,柿澤茂行,見理 剛,佐々木裕子,佐藤静雄,皿谷 健,柴田健一 郎,清水 隆,田中裕士,原澤 亮,堀野敦子,松田和洋,柳原 格,渡邉 秀裕(ほか37名)
    • Total Pages
      259(19-24)
    • Publisher
      近代出版
    • ISBN
      978-4-87402-219-1
  • [Remarks] 研究室ホームページ

    • URL

      http://www.sci.osaka-cu.ac.jp/~miyata/index.html

  • [Remarks] 新学術領域「運動マシナリー」ホームページ

    • URL

      http://bunshi5.bio.nagoya-u.ac.jp/~mycmobile/index.php

  • [Remarks] 新学術領域「運動マシナリー」による汎用3Dプリンターの生物学への応用 Facebook

    • URL

      https://www.facebook.com/motility.machinery

  • [Remarks] 新学術領域「運動マシナリー」総括班による先端的電子顕微鏡観察法の開発 Facebook

    • URL

      https://www.facebook.com/freeze.fracture

  • [Remarks] 運動マシナリー・ディスカッション Facebook

    • URL

      https://www.facebook.com/mycmobile

URL: 

Published: 2018-12-17   Modified: 2022-02-22  

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