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2014 Fiscal Year Annual Research Report

ハイブリット型生物モーターのイオン選択透過分子機構の解明

Planned Research

Project AreaHarmonized supramolecular machinery for motility and its diversity
Project/Area Number 24117005
Research InstitutionToyo University

Principal Investigator

伊藤 政博  東洋大学, 生命科学部, 教授 (80297738)

Project Period (FY) 2012-06-28 – 2017-03-31
Keywordsべん毛モーター / 好アルカリ性細菌 / イオンチャネル / ハイブリッドモーター / 枯草菌 / 固定子 / プロトン駆動力 / ナトリウム駆動力
Outline of Annual Research Achievements

平成26年度は、前年度に引き続き下記の3つのテーマについて研究を推進した。
テーマ1では、Bacillus属べん毛モーター固定子のイオン選択透過とモーター機能に重要なアミノ酸残基の同定を行っている。これまでにBacillus属細菌が持つMotPS型とMotAB型固定子のモーター機能に重要なアミノ酸残基を特定した。この成果は、平成26年度に論文として報告した。また、イオン選択透過に重要なアミノ酸残基としてB. alcalophilus 由来のNa+/K+駆動型固定子のMotSサブユニットの膜貫通領域の33番目のメチオニン残基をH+駆動型固定子で保存されているバリン残基に置換することでイオン選択性がH+駆動型へとダイナミックに変化する結果を得た。
テーマ2では、新規に自然界からアルカリ土類金属の2価カチオンを利用してべん毛を駆動させる菌体の単離を試みた。国内各地のサンプルからスクリーニングを行った結果、Ca2+含有量が豊富な日本国内の温泉地より候補株Paenibacillus sp. TCa20株の単離に成功した。TCa20株の全ゲノム配列を次世代シークエンサーで決定し、この株の固定子の塩基配列を取得し平成26年度に論文に報告した。TCa20株の遺伝子工学的手法は全く確立されていないので、遺伝子工学的手法が容易な枯草菌の系でこの固定子遺伝子の詳細な機能を検討した。現在までに、枯草菌の固定子を欠損させた運動性欠損株にTCa20株由来の固定子を発現させ、その運動性欠損を相補すること、この運動性がCa2+とMg2+濃度に依存していることを確認した。
テーマ3では、B. alcalophilusのNa+/K+/Rb+駆動型固定子MotPSの大腸菌での大量発現系の確立を行った。また、MotSのN末端側から55番目から90番目までの領域を段階的に欠損させたものを構築し、運動性や細胞膜への発現量を確認し、MotSの運動性に関与する最小機能領域を決定した(投稿準備中)。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

上記の研究実績の概要に記したテーマ1に関しては、おおむね順調と考えている。枯草菌の固定子を実験材料としてイオン選択やモーターの回転に重要な領域の機能解析を行い、論文2報を報告することができた。また、イオン選択透過に関する新規な情報も得られているので、今後2年間で更に発展が期待できる。テーマ2に関しては、おおむね順調と考えている。新規べん毛モーター固定子を発見し、その詳細な解析を行なうことができ、投稿準備まで進んでいる。ゲノム解析に関して、平成26年度中に論文にまとめることができた。テーマ3に関しては、B. alcalophilus由来のMotPSのMotSサブユニットの最少機能領域の同定に成功したので、この情報を生かしてタンパク質の大量精製条件の確立や結晶化を進めていくめどが立った。また、最少機能領域に関する部分は、平成27年度の早い時期に論文にまとめるめどが立ったので、おおむね順調に進展しているといえる。

Strategy for Future Research Activity

今後も上述の3つのテーマを推進する予定である。
テーマ1に関しては、Bacillus属以外のべん毛固定子のイオン選択透過性について対象箇所をMotA型サブユニットの3番目と4番目の膜貫通領域にも拡大して調べたいと考えている。すでにアライメントデータの結果より候補アミノ酸残基を選抜している。
テーマ2に関しては、現在、枯草菌を宿主として2価カチオンを利用してべん毛を駆動させ固定子の発現を活性がある形で観察することに成功した。今後、ビーズをモーターに付着させ1分子回転計測を行うために、一分子計測が容易な大腸菌の系でも機能する固定子を構築したいと考えている。これにより、これまで研究例がない2価カチオンを利用してべん毛を駆動させるモーターの特性を明らかにできると考えている。
テーマ3に関しては、連携研究者の大阪大学の今田勝巳教授の研究室の協力も得て、B. alcalophilus由来のMotPSのMotSサブユニットの最少機能領域の親水性タンパク質の結晶化を行う予定である。また、MotPSタンパク質複合体に関しても大量精製系を確立して、今田教授と結晶化へ向けての取り組みを推進する予定である。

  • Research Products

    (23 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (6 results) (of which Peer Reviewed: 6 results,  Acknowledgement Compliant: 6 results,  Open Access: 5 results) Presentation (13 results) Book (2 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Mutational analysis of charged residues in the cytoplasmic loops of MotA and MotP in the Bacillus subtilis flagellar motor.2014

    • Author(s)
      Yuka Takahashi, Masahiro Ito
    • Journal Title

      Journal of Biochemistry

      Volume: 156(4) Pages: 211-220

    • DOI

      10.1093/jb/mvu030

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Draft Genome Sequence of Potassium-Dependent Alkaliphilic Bacillus sp. Strain TS-2 isolated from a jumping spider.2014

    • Author(s)
      Fujinami S., Takeda K., Onodera T., Satoh S., Sano M., Narumi I., Ito M.
    • Journal Title

      Genome Announcements

      Volume: 2(3) Pages: e00458-14

    • DOI

      10.1128/genomeA.00458-14

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Suppressor mutants from MotB-D24E and MotS-D30E in the flagellar stator complex of Bacillus subtilis.2014

    • Author(s)
      Takahashi Y., Koyama K., Ito M.
    • Journal Title

      Journal of General and Applied Microbiology

      Volume: 60 Pages: 131-139

    • DOI

      10.2323/jgam.60.131

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Draft Genome Sequence of Calcium-dependent Paenibacillus sp. Strain TCA20, Isolated from a Hot Spring Containing a High Concentration of Calcium Ions.2014

    • Author(s)
      Fujinami S, Takeda-Yano K, Onodera T, Satoh K, Sano M, Takahashi Y, Narumi I, Ito M.
    • Journal Title

      Genome Announcements

      Volume: 2(5) Pages: e00866-14

    • DOI

      10.1128/genomeA.00866-14

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Draft Genome Sequence of Bacillus alcalophilus AV1934, a Classic Alkaliphile Isolated from Human Feces in 1934.2014

    • Author(s)
      Attie O, Jayaprakash A, Shah H, Paulsen IT, Morino M, Takahashi Y, Narumi I, Sachidanandam R, Satoh K, Ito M, and Krulwichc TA.
    • Journal Title

      Genome Announcements

      Volume: 2(6) Pages: e01175-14

    • DOI

      10.1128/genomeA.01175-14

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Ionic selectivity and thermal adaptations within the voltage-gated sodium channel family of alkaliphilic Bacillus species of bacteria.2014

    • Author(s)
      DeCaen PG, Takahashi Y, Krulwich TA, Ito M, Clapham DE.
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 3 Pages: e04387

    • DOI

      10.7554/eLife.04387

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 共培養によるMethylobacterium sp. 121株への影響2015

    • Author(s)
      若林佑、清水哲、中村顕、伊藤政博
    • Organizer
      日本農芸化学会2015年度大会
    • Place of Presentation
      岡山大学津島キャンパス(岡山県岡山市)
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] 二価カチオンで駆動する新奇べん毛モーターの発見2015

    • Author(s)
      今澤 陸、高橋 優嘉、青木 航、佐野元彦、伊藤政博
    • Organizer
      日本農芸化学会2015年度大会
    • Place of Presentation
      岡山大学津島キャンパス(岡山県岡山市)
    • Year and Date
      2015-03-26 – 2015-03-29
  • [Presentation] Search for the factor affecting motility in Methylobacterium sp. 1212015

    • Author(s)
      Yuu Wakabayasi, Tetsu Shimizu, Akira Nakamura, Masahiro Ito
    • Organizer
      2014年度べん毛交流会
    • Place of Presentation
      合歓の郷ホテル&リゾート(三重県志摩市)
    • Year and Date
      2015-03-01 – 2015-03-03
  • [Presentation] 生育pHの異なる2種類のBacillus属細菌が持つNa+駆動型べん毛モーター固定子MotPSの 中性環境におけるNa+親和性の差異2015

    • Author(s)
      高橋優嘉、野口有希奈、伊藤政博
    • Organizer
      2015年度生体運動合同班会議
    • Place of Presentation
      学習院大学目白キャンパス(東京都豊島区)
    • Year and Date
      2015-01-07 – 2015-01-09
  • [Presentation] Methylobacterium sp.121株の運動性向上に影響を与える共培養時の因子の探索2015

    • Author(s)
      若林佑、清水哲、中村顕、伊藤政博
    • Organizer
      2015年度生体運動合同班会議
    • Place of Presentation
      学習院大学目白キャンパス(東京都豊島区)
    • Year and Date
      2015-01-07 – 2015-01-09
  • [Presentation] 異なる生育pHの2種類のBacillus属細菌が持つNa+駆動型べん毛モーター固定子MotPSの中性環境におけるNa+親和性の差異の解明2014

    • Author(s)
      高橋優嘉、野口有希奈、伊藤政博
    • Organizer
      日本生体エネルギー研究会第40回討論会
    • Place of Presentation
      愛媛大学南加記念ホール(愛媛県松山市)
    • Year and Date
      2014-12-11 – 2014-12-13
  • [Presentation] Elucidation of the differences in Na+ affinity in a neutral pH environment of the Na+-driven flagellar motor stator MotPS in alkaliphilic Bacillus pseudofirmus OF4 and Bacillus subtilis.2014

    • Author(s)
      T. Takahashi, Y. Noguchi, and M. Ito
    • Organizer
      The 10th International Symposium on Bioscience and Nanotechnology
    • Place of Presentation
      東洋大学川越キャンパス(埼玉県川越市)
    • Year and Date
      2014-11-14 – 2014-11-15
  • [Presentation] Methylobacterium sp. 121株の運動性に影響を与える因子の探求2014

    • Author(s)
      若林佑、清水哲、中村顕、伊藤政博
    • Organizer
      極限環境生物学会2014年度(第15回)年会
    • Place of Presentation
      今帰仁村コミュニティセンター(沖縄県国頭郡)
    • Year and Date
      2014-11-01 – 2014-11-03
  • [Presentation] 枯草菌と好アルカリ性細菌Bacillus pseudofirmus OF4のNa+駆動型固定子MotPSの中性環境におけるNa+親和性の差異の解明2014

    • Author(s)
      高橋優嘉、野口有希奈、伊藤政博
    • Organizer
      極限環境生物学会2014年度(第15回)年会
    • Place of Presentation
      今帰仁村コミュニティセンター(沖縄県国頭郡)
    • Year and Date
      2014-11-01 – 2014-11-03
  • [Presentation] 生育にカルシウムイオンを要求するPaenibacillus sp. TCA20株 のゲノム解析および生理学的性解析2014

    • Author(s)
      今澤陸、藤浪俊、高橋優嘉、伊藤政博
    • Organizer
      極限環境生物学会2014年度(第15回)年会
    • Place of Presentation
      今帰仁村コミュニティセンター(沖縄県国頭郡)
    • Year and Date
      2014-11-01 – 2014-11-03
  • [Presentation] 枯草菌が持つハイブリット型べん毛モーターの回転機構の解明2014

    • Author(s)
      高橋優嘉、伊藤政博
    • Organizer
      日本農芸化学会関東支部2014年度支部大会
    • Place of Presentation
      埼玉大学(埼玉県さいたま市)
    • Year and Date
      2014-10-18
  • [Presentation] The clarification of the differences between alkaliphilic and neutralophilic Bacillus influx control of Na+ near neutral pH in the Na+-driven flagellar motor stator MotPS.2014

    • Author(s)
      Y. Takahashi, Y. Noguchi, and M. Ito
    • Organizer
      10th International Congress on Extremophiles 2014
    • Place of Presentation
      St. Petersburg, Russia
    • Year and Date
      2014-09-07 – 2014-09-11
  • [Presentation] Methylobacterium sp. 121株とKaistia sp. 32K株の共培養による影響2014

    • Author(s)
      若林佑、清水哲、中村顕、伊藤政博
    • Organizer
      第13回微生物研究会
    • Place of Presentation
      東京農業大学世田谷キャンパス(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2014-07-26
  • [Book] Transport and Storage of Metal Ions in Biological Cells CHAPTER 2: Sodium. Its Role in Bacterial Metabolism,2014

    • Author(s)
      M. Ito and B. Barquera,
    • Total Pages
      1000
    • Publisher
      Royal Society of Chemistry (RSC)
  • [Book] 極限環境生命- 生命の起源を考え,その多様性に学ぶ -2014

    • Author(s)
      伊藤 政博, 鳴海 一成, 佐藤 孝子, 中村 聡, 東端 啓貴, 國技 武和, 為我井 秀行, 道久 則之, 伊藤 隆
    • Total Pages
      232
    • Publisher
      コロナ社
  • [Remarks] 東洋大学生命科学部生命科学科 極限環境生命科学研究室ホームページ

    • URL

      http://www2.toyo.ac.jp/~ito1107/index.html

  • [Remarks] 新学術領域研究「運動マシナリーが織りなす調和と多様性」ホームページ

    • URL

      http://bunshi5.bio.nagoya-u.ac.jp/~mycmobile/index.php

URL: 

Published: 2016-06-01  

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