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2014 Fiscal Year Annual Research Report

アメーバ運動を統御するアクチン構造多型マシナリー

Planned Research

Project AreaHarmonized supramolecular machinery for motility and its diversity
Project/Area Number 24117008
Research InstitutionNational Institute of Advanced Industrial Science and Technology

Principal Investigator

上田 太郎  独立行政法人産業技術総合研究所, バイオメディカル研究部門, 総括研究主幹 (90356551)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 徳樂 清孝  室蘭工業大学, 工学(系)研究科(研究院), 准教授 (00332106)
長崎 晃  独立行政法人産業技術総合研究所, バイオメディカル研究部門, 主任研究員 (30392640)
Project Period (FY) 2012-06-28 – 2017-03-31
Keywordsアクチン / ミオシン / コフィリン / 高速AFM / 全反射蛍光顕微鏡 / 協同的構造変化
Outline of Annual Research Achievements


昨年度に、高速AFM観察により、コフィリンがアクチンフィラメントに結合してコフィリンクラスターを形成しらせんピッチが短くなると、短くなったらせんピッチがフィラメントのP端方向に一方向的に伝播すること(一方向的な協同的構造変化)、さらに溶液中のコフィリンは、このらせんピッチが短くなった領域に優先的に結合することを見出した。今年度は、S1(ミオシンIIのモーター領域)とコフィリンが共存する際、両者がアクチンフィラメントとどのように結合するかを高速AFMで観察したところ、ATP存在下でS1アクチンフィラメントと相互作用している状況では、コフィリンのアクチンフィラメント結合が強く阻害されることを見出した。ATP存在下ではS1とアクチンフィラメントの結合は非常に短寿命であり、任意の時点において大半のアクチンプロトマーはS1と結合していないにもかかわらずコフィリン結合が強く阻害されたということは、S1によるアクチンフィラメントの構造変化に関して、強い距離的な協同性があるか、時間的なメモリー効果があることを示している。
細胞内のアクチン結合ドメイン(ABD)の局在に関して、フィラミンのABDが前後極性をもったアメーバ細胞の後部に集積しやすいことが以前から報告されており、われわれはそのメカニズム解明を進めてきた。紫色の刺激光で蛍光が緑から赤に変化する蛍光タンパク質mKikGRとフィラミンABDの融合タンパク質を細胞性粘菌で発現し、前後極性をもった細胞の中央部のmKikGR-フィラミンABDを赤色に変換したところ、6秒以内に細胞後部が赤色蛍光を発するようになった。この結果は、フィラミンABDが細胞表層流れに依存してゆっくり細胞後部に集積するという従来のモデルを明確に否定するもので、細胞前後のアクチンフィラメントの構造が異なっているためにフィラミンが細胞後部に集積するという仮説が強く支持された。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

高速AFMを中心とした構造解析により、コフィリンやS1の結合がアクチンフィラメントの構造を協同的に変化させ、その結果コフィリンやS1自身の結合が促進されるだけではなく、他のアクチン結合タンパク質のアクチン結合が大きく影響を受けるというデータが蓄積しつつあり、これは当初研究目的を超える成果である。GFPなどの蛍光タンパク質を融合したABDの細胞内局在の解析は、昨年度まで思うような成果を挙げられなかったが、今年度は光変換型の蛍光タンパク質を使うことで大きな進展が見られた。また、全反射蛍光顕微鏡を用いた蛍光ABDとアクチンフィラメントの結合観察も、顕微鏡などの準備が整ったので、当初予定よりは遅れているものの、まもなく着手できる見込みである。
一方、中間審査においては、そうしたアクチンフィラメントの協同的構造変化の生理的な意義の解明への取り組みが弱いというご指摘があった。

Strategy for Future Research Activity

高速AFMや蛍光ABDを使ったin vitro観察および蛍光ABDのin vivo蛍光観察は、今後も引き続き推進していく。
一方、生理的意義の解明への取り組みが弱いというご指摘に関しては、コフィリンとミオシンIIを相互排他的な関係にある典型的なアクチン結合タンパク質のペアとして選定し、一方の細胞内局在が他方の局在によって影響を受けるかどうかを細胞生物学的な手法で解明することとした。また全反射蛍光顕微鏡を用いた蛍光ABDとアクチンフィラメントのin vitro結合観察においても、異なった蛍光タンパク質を融合した複数のABDがアクチンフィラメントと結合する様子を観察することで、アクチンフィラメントの協同的構造変化とその生理的意義についての示唆が得られるものと期待している。

  • Research Products

    (20 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 3 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (16 results) (of which Invited: 3 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Cofilin-induced unidirectional cooperative conformational changes in actin filaments revealed by high-speed atomic force microscopy2015

    • Author(s)
      Ngo, K.X., Kodera, N., Katayama, E., Ando, T., Uyeda, T.Q.P.
    • Journal Title

      eLife

      Volume: 4 Pages: e04806

    • DOI

      OI 10.7554/eLife.04806

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The Role of Structural Dynamics of Actin in Class-Specific Myosin Motility2015

    • Author(s)
      Noguchi, T.Q.P., Morimatsu, M., Iwane, A.H., Yanagida, T., Uyeda, T.Q.P.
    • Journal Title

      PLoS One

      Volume: 10 Pages: e0126262

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0126262

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Identification of kinases and regulatory proteins required for cell migration.2015

    • Author(s)
      Ohnuki-Nagasaki, R., Nagasaki, R., Hakamada, K., Uyeda, T.Q.P., Miyake, M., Miyake, J., Fujita, S.
    • Journal Title

      BMC Genet.

      Volume: 16 Pages: 9

    • DOI

      10.1186/s12863-015-0170-7

    • Peer Reviewed / Open Access
  • [Presentation] Functional differentiation of actin filaments mediated by cooperative conformational changes of the filament structure2015

    • Author(s)
      Uyeda, T.Q.P., Kodera, N., and Tokuraku, K.
    • Organizer
      日本生物物理学会第53回年会
    • Place of Presentation
      金沢大学、金沢
    • Year and Date
      2015-09-13
    • Invited
  • [Presentation] 協同的構造変化を介したアクチンフィラメントの機能制御2015

    • Author(s)
      上田太郎、古寺哲幸、徳楽清孝
    • Organizer
      第67回日本細胞生物学会大会
    • Place of Presentation
      タワーホール船堀、東京
    • Year and Date
      2015-07-02
    • Invited
  • [Presentation] アクチン結合タンパク質のアクチン結合ドメインは細胞の前後特異的に局在する2014

    • Author(s)
      柴田桂太朗、長崎晃、辻岡政経、髙稲正勝、中野賢太郎、沼田治、上田太郎
    • Organizer
      日本細胞性粘菌学会第4回例会
    • Place of Presentation
      東北大学、仙台
    • Year and Date
      2014-10-12
  • [Presentation] Cofilin-induced unidirectional cooperative conformational change of actin filaments.2014

    • Author(s)
      Ngo, K.X., 古寺哲幸、片山栄作、長崎晃、安藤敏夫、上田太郎
    • Organizer
      日本生物物理学会第52回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター、札幌
    • Year and Date
      2014-09-26
  • [Presentation] The motility of Myosin IXb depend on difference of actin filaments2014

    • Author(s)
      山田正文、梅木伸久、池辺光男、上田太郎
    • Organizer
      日本生物物理学会第52回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター、札幌
    • Year and Date
      2014-09-26
  • [Presentation] Arabidopsis thaliana actin isoforms do not bind phalloidin2014

    • Author(s)
      貴嶋紗久、孔三根、森正之、和田正三、上田太郎
    • Organizer
      日本生物物理学会第52回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター、札幌
    • Year and Date
      2014-09-25
  • [Presentation] Dictyostelium cells carrying the plasmids to express mutant actin2014

    • Author(s)
      五味渕由貴、大貫貴広、上田太郎、西山雅祥、若林健之
    • Organizer
      日本生物物理学会第52回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター、札幌
    • Year and Date
      2014-09-25
  • [Presentation] Actin binding domains of certain actin binding proteins are sufficient to localization.2014

    • Author(s)
      柴田桂太朗、長崎晃、辻岡政経、上田太郎
    • Organizer
      日本生物物理学会第52回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター、札幌
    • Year and Date
      2014-09-25
  • [Presentation] Mutations introduced into the hydrophobic helix of the Dictyostelium actin.2014

    • Author(s)
      大貫貴広、五味渕由貴、上田太郎、若林健之
    • Organizer
      日本生物物理学会第52回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター、札幌
    • Year and Date
      2014-09-25
  • [Presentation] Piezoelectric property of an actin filament2014

    • Author(s)
      大貫準、佐藤昴人、梅沢公二、上田太郎、高野光則
    • Organizer
      日本生物物理学会第52回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター、札幌
    • Year and Date
      2014-09-25
  • [Presentation] FRETプローブアクチンを用いた細胞内におけるアクチンの構造多型の検出2014

    • Author(s)
      岡崎美緒、貴嶋紗久、岩楯好昭、上田太郎、野口太郎
    • Organizer
      日本生物物理学会第52回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター、札幌
    • Year and Date
      2014-09-25
  • [Presentation] 高速AFMと蛍光顕微鏡観察によるF-アクチンへのHMM、コフィリンの協同的結合の解析2014

    • Author(s)
      上野寛朗、西川雄亮、相内瑛、平川利佳、吉野敦貴、古寺哲幸、上田太郎、徳楽清孝
    • Organizer
      日本生物物理学会第52回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター、札幌
    • Year and Date
      2014-09-25
  • [Presentation] 微小管結合蛋白質MAP2、MAP4、TauのF-アクチン-微小管束化活性の違い2014

    • Author(s)
      齊藤翔馬、倉本歩、槇原光、志賀美由貴、小谷享、徳楽清孝
    • Organizer
      日本生物物理学会第52回年会
    • Place of Presentation
      札幌コンベンションセンター、札幌
    • Year and Date
      2014-09-25
  • [Presentation] シロイヌナズナアクチンの諸性質:ミオシンとの相互作用を中心に2014

    • Author(s)
      諏訪貴大、大矢里美、貴嶋紗久、富永基樹、大木高志、中野明彦、石渡信一、上田太郎、伊藤光二
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス、川崎
    • Year and Date
      2014-09-13
  • [Presentation] 植物アクチンアイソフォームの精製・機能解析2014

    • Author(s)
      貴嶋紗久、孔三根、和田正三、上田太郎
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学生田キャンパス、川崎
    • Year and Date
      2014-09-13
  • [Presentation] アクチンフィラメントの構造多型と機能分化2014

    • Author(s)
      上田太郎
    • Organizer
      理研シンポジウム第4回分子モーター討論会
    • Place of Presentation
      大阪大学、豊中
    • Year and Date
      2014-06-27
    • Invited
  • [Remarks] セルメカニクス研究グループ

    • URL

      https://staff.aist.go.jp/t-uyeda/HP/

URL: 

Published: 2016-06-01  

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