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2016 Fiscal Year Annual Research Report

Elucidation of mechanisms of transcription cycle using multi-color, single-molecule, quantitative fluorescence imaging of living cell nuclei.

Planned Research

Project AreaIntegral understanding of the mechanism of transcription cycle through quantitative, high-resolution approaches
Project/Area Number 24118006
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

十川 久美子  東京工業大学, 生命理工学院, 准教授 (20291073)

Project Period (FY) 2012-06-28 – 2017-03-31
Keywords1分子イメージング / 転写調節
Outline of Annual Research Achievements

本研究は、生細胞1分子イメージング観察と定量解析により、転写サイクルの動態観察と転写に関わるタンパク質群の個々の振る舞いや相互作用を、時空間の関数として高精細に定量することを目的としている。独自に開発した薄層斜光照明法による蛍光1分子イメージングの他に、FRAP(光褪色後蛍光回復法)や、超解像イメージングも用い、転写関連タンパク質について高精細な空間分布解析を行っている。具体的には、以下のような成果を得た。
1.転写開始におけるヌクレオソームリモデンリング複合体の役割解明。領域内の原田昌彦および連携研究者の木村宏との共同研究により、リモデリング複合体構成サブユニットのノックダウン解析を行い、各サブユニットの機能解析を進めた。(伊藤、生物物理学会)
2.核小体の構造と機能に関するRNA結合タンパク質の役割解明。連携研究者の斉藤典子との共同研究により、RNA結合タンパク質ノックダウン条件下での核小体構成タンパク質の動態を解析し、核小体構造維持への関与を明らかにした。(松本、生物物理学会)
3.転写抑制因子IPASの構造変化と機能の相関。東北大の十川和博との共同研究により、IPASの細胞内局在を詳細に解析した。FLIM-FRETの結果と合わせて、結合タンパク質によるIPASの構造変化を明らかにした。(J.Biochem. 161:291-296, 2017)
4.炎症性転写因子NF-kBの活性調節機構解明。炎症抑制因子MKRN2を発見し、NF-kBのユビキチン化と分解に作用することを明らかにした。(Scientific Reports. 2017 印刷中)
5.転写伸長因子DSIFの細胞内動態解明。領域内の山口雄輝らとの共同研究により、リン酸化阻害剤存在下でのFRAP解析を行い、RNAポリメラーゼのリン酸化部位による相互作用安定性の違いを明らかにした。(國見、生物物理学会)

Research Progress Status

28年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

28年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (14 results)

All 2017 2016 Other

All Journal Article (2 results) (of which Peer Reviewed: 2 results,  Open Access: 2 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (10 results) (of which Invited: 1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Conformational changes in inhibitory PAS domain protein associated with binding of HIF-1α and Bcl-xL in living cells.2017

    • Author(s)
      Kasai S, Kajimoto S, Ito Y, Saito T, Yasumoto K, Tokunaga M, Sakata-Sogawa K, Fukumura H, Sogawa K
    • Journal Title

      Journal of Biochemistry

      Volume: 106 Pages: 291-296

    • DOI

      10.1093/jb/mvw068

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] MKRN2 is a novel ubiquitin E3 ligase for the p65 subunit of NF-κB and negatively regulates inflammatory responses.2017

    • Author(s)
      Shin C, Ito Y, Ichikawa S, Tokunaga M, Sakata-Sogawa K, Tanaka T
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 7 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1038/srep46097

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] 細胞分化における核内アクチンの機能解析2017

    • Author(s)
      横山吟司, 山本浩志, 山崎祥他, 十川久美子, 徳永万喜洋, 原田昌彦
    • Organizer
      日本農芸化学会2017年度大会
    • Place of Presentation
      京都女子大学(京都市東山区)
    • Year and Date
      2017-03-17 – 2017-03-20
  • [Presentation] 1分子イメージングとFRAPによるINO80クロマチン再構成複合体の核内動態解析2016

    • Author(s)
      伊藤由馬, 原田昌彦, 木村宏, 十川久美子, 徳永万喜洋
    • Organizer
      第8回「光塾」
    • Place of Presentation
      東京工業大学すずかけ台キャンパス(横浜市緑区)
    • Year and Date
      2016-12-17 – 2016-12-18
    • Invited
  • [Presentation] Single-molecule imaging of the INO80 chromatin remodeling complex in the living cell nucleus2016

    • Author(s)
      伊藤 由馬, 原田 昌彦, 十川久美子, 徳永万喜洋
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場( 茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-25 – 2016-11-27
  • [Presentation] CLIP-170 phosphorylation mediates repositioning of microtubule-organizing center during T cell activation2016

    • Author(s)
      林 偉銘, 伊藤 由馬, 徳永万喜洋, 十川久美子
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場( 茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-25 – 2016-11-27
  • [Presentation] Single molecule imaging and quantitative analysis of nucleolar-localized protein dynamics2016

    • Author(s)
      松本 大輝, 伊藤 由馬, 斉藤 典子,徳永万喜洋, 十川久美子
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場( 茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-25 – 2016-11-27
  • [Presentation] Super-resolution analysis of microtubule dynamics on T cell activation2016

    • Author(s)
      史 恒宇, 伊藤 由馬, 林 偉銘, 十川久美子, 徳永万喜洋
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場( 茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-25 – 2016-11-27
  • [Presentation] Fluorescence recovery after photobleaching (FRAP) analysis of INO80 chromatin remodeling complex2016

    • Author(s)
      磯垣 翼, 伊藤 由馬, 市川 翔太, 木村 宏, 原田 昌彦, 十川久美子, 徳永万喜洋
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場( 茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-25 – 2016-11-27
  • [Presentation] PDLIM2-interacting protein MKRN2 functions as a novel E3 ligase for p65 subunit of NF-κB2016

    • Author(s)
      申 纂暎, 伊藤 由馬, 徳永万喜洋, 田中 貴志, 十川久美子
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場( 茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-25 – 2016-11-27
  • [Presentation] Live cell imaging and quantitative analysis of anti-inflammatory protein PDLIM2 activation upon LPS stimulation2016

    • Author(s)
      市川 翔太, 伊藤 由馬, 田中 貴志, 徳永万喜洋, 十川久美子
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場( 茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-25 – 2016-11-27
  • [Presentation] Quantitative image analysis of dynamics of promoter-proximal pausing related proteins2016

    • Author(s)
      國見 慎之介, 伊藤 由馬, 山口 雄輝, 十川久美子, 徳永万喜洋
    • Organizer
      第54回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      つくば国際会議場( 茨城県つくば市)
    • Year and Date
      2016-11-25 – 2016-11-27
  • [Remarks] 炎症反応を制御する新たな分子MKRN2を発見 ―過剰な炎症反応を防ぐ仕組みの一端を解明―

    • URL

      http://www.titech.ac.jp/news/2017/038029.html

  • [Remarks] 東京工業大学生命理工学院徳永研究室

    • URL

      http://www.toku.bio.titech.ac.jp/research/index.html

URL: 

Published: 2018-01-16  

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