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2015 Fiscal Year Annual Research Report

生命分子システムの有機化学的拡張による動的秩序の創出

Planned Research

Project AreaDynamical ordering of biomolecular systems for creation of integrated functions
Project/Area Number 25102006
Research InstitutionJapan Advanced Institute of Science and Technology

Principal Investigator

芳坂 貴弘  北陸先端科学技術大学院大学, マテリアルサイエンス研究科, 教授 (30263619)

Project Period (FY) 2013-06-28 – 2018-03-31
Keywordsタンパク質 / 非天然アミノ酸 / 蛍光 / 光機能 / タグタンパク質
Outline of Annual Research Achievements

非天然アミノ酸のタンパク質への導入技術は、光機能性分子や蛍光標識分子などの人工機能分子をタンパク質に組み込むことで、タンパク質複合体形成などの生体分子の動的秩序の制御や検出に有用である。しかし従来の手法では無細胞翻訳系を用いる必要があり、タンパク質の発現効率の低く各種分析手法に適用する上で障害となっていた。そこで本研究では、非天然アミノ酸導入タンパク質の大腸菌内での大量発現系の確立を進めており、27年度は実際に光機能を付与したタンパク質の大量発現を行った。光異性化分子(アゾベンゼン)および光架橋分子(ベンゾフェノン)を有する非天然アミノ酸を認識するアミノアシルtRNA合成酵素変異体と、アンバーサプレッサーtRNAを用いて、一本鎖抗体へ非天然アミノ酸の導入を行った。その結果、良好な収率で非天然アミノ酸導入タンパク質が取得でき、光照射による抗原タンパク質との結合活性制御、およびタンパク質複合体の光架橋を確認できた。また、光架橋と蛍光標識を同時に行うことのできる非天然アミノ酸導入タンパク質の合成方法を新たに開発した。加えて、新たな非天然アミノ酸認識アミノアシルtRNA合成酵素変異体の分子進化を、無細胞翻訳系を内包したリポソームを用いたin vitro selection法により試みた(A02班松浦班員との共同研究)。
一方、非天然分子をタンパク質へ導入するための新規手法の開発も行った。まず、弱酸性溶液中でアルデヒド誘導体を用いてアミノ基の還元的アルキル化を行うことで、N末端アミノ基を選択的に修飾できることを見いだした。また、SNAPタグタンパク質融合と蛍光標識SNAPリガンド添加により、一本鎖抗体の近傍に蛍光分子を局在させ、抗原の結合を蛍光変化により検出できることを示した。この場合、非天然アミノ酸の導入を必要とせず、非天然分子導入タンパク質を細胞に直接発現させることも可能であった。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

これまで進めてきた非天然アミノ酸導入タンパク質の大腸菌内での合成法に関して、実際に良好な収率で光異性化および光架橋性の非天然アミノ酸を導入したタンパク質を得ることができた。また、非天然分子をタンパク質へ導入する手法に関して、N末端アミノ基をアルデヒドを用いて修飾する手法、および、SNAPタグタンパク質を介して非天然分子をタンパク質に付加する手法を検討し、抗体-抗原結合の蛍光検出に応用できることを示した。以上の点から、概ね順調に進展していると判断した。

Strategy for Future Research Activity

非天然アミノ酸導入タンパク質の大量発現系を構築することができたことから、今後は領域内での共同研究により時間分解測定等によるタンパク質の動的秩序形成過程の計測や機能制御を試みる。また、非天然分子の新たな導入法を用いて、蛍光分子以外の非天然分子をタンパク質に付加して、その人工機能を発現することを試みる。光応答性分子や超分子構造を形成する高分子をSNAPタグタンパク質を介して目的タンパク質に付加して、タンパク質の制御・検出や動的秩序形成を試みる。この手法では、非天然分子とタンパク質と複合化を細胞内で行うことも可能になるため、今後、細胞内でのタンパク質の制御や動的秩序形成も可能になると期待される。

  • Research Products

    (29 results)

All 2016 2015 Other

All Journal Article (4 results) (of which Peer Reviewed: 4 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results) Presentation (24 results) (of which Int'l Joint Research: 8 results,  Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Antibody-based fluorescent and fluorescent ratiometric indicators for detection of phosphotyrosine2016

    • Author(s)
      K. P. Huynh Nhat, T. Watanabe, K. Yoshikoshi, T. Hohsaka
    • Journal Title

      J. Biosci. Bioeng.

      Volume: 122 Pages: 146-154

    • DOI

      DOI: 10.1016/j.jbiosc.2016.01.010

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Double-Fluorescent-Labeled Single-Chain Antibodies Showing Antigen-Dependent Fluorescence Ratio Change2016

    • Author(s)
      Kensuke Yoshikoshi, Takayoshi Watanabe, Takahiro Hohsaka
    • Journal Title

      Bull. Chem. Soc. Jpn.

      Volume: - Pages: -

    • DOI

      10.1246/bcsj.20150384

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Incorporation of a Doubly Functionalized Synthetic Amino Acid into Proteins for Creating Chemical and Light-Induced Conjugates2016

    • Author(s)
      Atsushi Yamaguchi, Takayoshi Matsuda, Kazumasa Ohtake, Tatsuo Yanagisawa, Shigeyuki Yokoyama, Yoshihisa Fujiwara, Takayoshi Watanabe, Takahiro Hohsaka, Kensaku Sakamoto
    • Journal Title

      Bioconjugate Chem.

      Volume: 27 Pages: 198-206

    • DOI

      10.1021/acs.bioconjchem.5b00602

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Liposome-Based in Vitro Evolution of Aminoacyl-tRNA Synthetase for Enhanced Pyrrolysine Derivative Incorporation2015

    • Author(s)
      Atsuko Uyeda, Takayoshi Watanabe, Yasuhiko Kato, Hajime Watanabe, Tetsuya Yomo, Takahiro Hohsaka, Tomoaki Matsuura
    • Journal Title

      ChemBioChem

      Volume: 16 Pages: 1797-1802

    • DOI

      10.1002/cbic.201500174

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Presentation] Development of antibodies that show antigen-dependent fluorescence enhancement2016

    • Author(s)
      FUKUNAGA, Keisuke; WATANABE, Takayoshi; NOVITASARI, Dian; ABE, Ryoji; OHASHI, Hiroyuki; HOHSAKA, Takahiro
    • Organizer
      日本化学会第96春季年会
    • Place of Presentation
      同志社大学(京都府京田辺市)
    • Year and Date
      2016-03-24 – 2016-03-27
  • [Presentation] モノクローナルIgGのN末端選択的な蛍光標識と抗原の蛍光検出2016

    • Author(s)
      福永圭佑・渡邉 貴嘉・Novitasari Dian・阿部亮二・大橋広行・芳坂貴弘
    • Organizer
      日本化学会第96春季年会
    • Place of Presentation
      同志社大学(京都府京田辺市)
    • Year and Date
      2016-03-24 – 2016-03-27
  • [Presentation] リポソームを用いたアミノアシルtRNA 合成酵素のin vitro分子進化法の開発と非天然アミノ酸導入タンパク質合成への応用2016

    • Author(s)
      渡邉貴嘉・芳坂貴弘・植田淳子・松浦友亮
    • Organizer
      日本化学会第96春季年会
    • Place of Presentation
      同志社大学(京都府京田辺市)
    • Year and Date
      2016-03-24 – 2016-03-27
  • [Presentation] 遺伝コード化された抗体由来蛍光タンパク質プローブの開発2016

    • Author(s)
      HUYNH NHAT Kim Phuong・渡邉貴嘉・芳坂貴弘
    • Organizer
      日本化学会第96春季年会
    • Place of Presentation
      同志社大学(京都府京田辺市)
    • Year and Date
      2016-03-24 – 2016-03-27
  • [Presentation] 非天然アミノ酸導入技術のバイオ医薬への応用展開2016

    • Author(s)
      芳坂貴弘
    • Organizer
      第 22 回ペプチドフォーラム
    • Place of Presentation
      金沢大学サテライトプラザ(石川県金沢市)
    • Year and Date
      2016-03-05
    • Invited
  • [Presentation] NOVEL METHOD FOR SITE-SPECIFIC PROTEIN PEGYLATION USING AROMATIC AMINE-CONTAINING NON-NATURAL AMINO ACID2016

    • Author(s)
      Takayoshi Watanabe, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      8th Japan-Korea Seminars on Biomolecular Sciences
    • Place of Presentation
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市)
    • Year and Date
      2016-02-15 – 2016-02-17
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Site-specific protein PEGylation through incorporation of aromatic amine-containing non-natural amino acid2015

    • Author(s)
      Takayoshi Watanabe, Rumi Shiba, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      PACIFICHEM2015(環太平洋国際化学会議)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Novel genetically encoded antibody-based biosensor for fluorescence ratio detection of antigen2015

    • Author(s)
      Kim Phuong Huynh-Nhat, Takayoshi Watanabe, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      PACIFICHEM2015(環太平洋国際化学会議)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Incorporation of a photoisomerizable non-natural amino acid into proteins through in vitro and in vivo protein expression2015

    • Author(s)
      Rumi Shiba, Takayoshi Watanabe, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      PACIFICHEM2015(環太平洋国際化学会議)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Fluorescence ratiometric detection of antigen using double fluorescent-labeled scFv based on FRET and fluorescence quenching2015

    • Author(s)
      Kensuke Yoshikoshi, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      PACIFICHEM2015(環太平洋国際化学会議)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Novel IgG-based fluorescent biosensor that shows antigen-dependent fluorescence enhancement2015

    • Author(s)
      Keisuke Fukunaga, Takayoshi Watanabe, Dian Novitasari, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      PACIFICHEM2015(環太平洋国際化学会議)
    • Place of Presentation
      Honolulu, Hawaii, USA
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Incorporation of nonnatural amino acids through expansion of the genetic code and its application to fluorescence analysis of proteins2015

    • Author(s)
      Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会)
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場他(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
    • Invited
  • [Presentation] N末端特異的に蛍光標識したIgGによる抗原の蛍光検出2015

    • Author(s)
      渡邉 貴嘉, 福永 圭佑, Dian Novitasari , 芳坂 貴弘, 阿部 亮二, 大橋 広行
    • Organizer
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会)
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場他(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] 非天然アミノ酸導入技術を用いた光機能基と蛍光基のタンパク質への二重導入2015

    • Author(s)
      芝 るみ, 渡邉 貴嘉, 芳坂 貴弘
    • Organizer
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会)
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場他(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] Site-specifically fluorescent-labeled proteins for sensing and controlling protein functions2015

    • Author(s)
      Takahiro Hohsaka, Keisuke Fukunaga, HUYNH NHAT Kim Phuong, Rumi Shiba, Takayoshi Watanabe
    • Organizer
      新学術領域研究「生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現」第4回国際シンポジウム
    • Place of Presentation
      九州大学西新プラザ(福岡県福岡市)
    • Year and Date
      2015-11-22 – 2015-11-23
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] N-TERMINAL-SPECIFIC FLUORESCENT LABELING OF PEPTIDES AND PROTEINS2015

    • Author(s)
      Keisuke Fukunaga, Takayoshi Watanabe, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      第52回ペプチド討論会
    • Place of Presentation
      平塚中央公民館(神奈川県平塚市)
    • Year and Date
      2015-11-16 – 2015-11-18
  • [Presentation] 抗原依存的な蛍光増強を示すN末端蛍光標識IgGの創製2015

    • Author(s)
      福永 圭佑・渡邉 貴嘉・Novitasari Dian・阿部 亮二・大橋 広行・芳坂 貴弘
    • Organizer
      生物発光化学発光研究会第32回学術講演会
    • Place of Presentation
      電気通信大学(東京都調布市)
    • Year and Date
      2015-10-31
  • [Presentation] 非天然アミノ酸のタンパク質への二重導入によるタンパク質の光制御と蛍光検出2015

    • Author(s)
      芝 るみ、渡邉 貴嘉、芳坂 貴弘
    • Organizer
      第10回無細胞生命科学研究会
    • Place of Presentation
      理研(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2015-10-13 – 2015-10-14
  • [Presentation] Novel genetically encoded antibody-based biosensors allowing fluorescence ratio detection of antigens2015

    • Author(s)
      Kim Phuong Huynh Nhat, Takayoshi Watanabe, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      第53回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      金沢大学(石川県金沢市)
    • Year and Date
      2015-09-13 – 2015-09-15
  • [Presentation] Incorporation of a photoisomerizable non-natural amino acid into proteins for photo-control of protein functions2015

    • Author(s)
      Rumi Shiba, Takayoshi Watanabe, Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      第53回日本生物物理学会年会
    • Place of Presentation
      金沢大学(石川県金沢市)
    • Year and Date
      2015-09-13 – 2015-09-15
  • [Presentation] 抗原依存的な蛍光増強を示すN末端蛍光標識IgGの開発2015

    • Author(s)
      福永 圭佑・渡邉 貴嘉・Novitasari Dian・阿部 亮二・大橋 広行・芳坂 貴弘
    • Organizer
      第9回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      熊本大学(熊本県熊本市)
    • Year and Date
      2015-09-10 – 2015-09-12
  • [Presentation] リポソームを用いた非天然アミノアシルtRNA合成酵素のin vitro進化法の開発2015

    • Author(s)
      渡邉 貴嘉・芳坂 貴弘・植田 淳子・松浦 友亮
    • Organizer
      第9回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      熊本大学(熊本県熊本市)
    • Year and Date
      2015-09-10 – 2015-09-12
  • [Presentation] 部位特異的蛍光標識抗体を用いた抗原の蛍光レシオ検出2015

    • Author(s)
      芳坂 貴弘・吉越 健輔・福永 圭佑・HUYNH NHAT, Kim Phuong・渡邉 貴嘉・阿部 亮二・大橋 広行
    • Organizer
      第9回バイオ関連化学シンポジウム
    • Place of Presentation
      熊本大学(熊本県熊本市)
    • Year and Date
      2015-09-10 – 2015-09-12
  • [Presentation] Incorporation of nonnatural amino acids by expanding the genetic code and its application to fluorescence analysis of proteins2015

    • Author(s)
      Takahiro Hohsaka
    • Organizer
      アジア連携分子研研究会“Supramolecular Dynamics at the Interface of Chemistry and Biology”
    • Place of Presentation
      岡崎統合バイオ(愛知県岡崎市)
    • Year and Date
      2015-06-12 – 2015-06-13
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Remarks] 芳坂研究室ホームページ

    • URL

      http://www.jaist.ac.jp/ms/labs/hohsaka/

URL: 

Published: 2017-01-06  

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