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2015 Fiscal Year Annual Research Report

ソフトマターから人工細胞への物理的アプローチ

Planned Research

Project AreaSynergy of Fluctuation and Structure:Foundation of Universal Laws in Nonequilibrium Systems
Project/Area Number 25103009
Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

今井 正幸  東北大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (60251485)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 佐久間 由香  東北大学, 理学(系)研究科(研究院), 助教 (40630801)
菅原 正  神奈川大学, 理学部, 教授 (50124219)
豊田 太郎  東京大学, 総合文化研究科, 准教授 (80422377)
Project Period (FY) 2013-06-28 – 2018-03-31
Keywords人工細胞 / ベシクル / 情報分子 / 自己駆動
Outline of Annual Research Achievements

本研究グループは、生命の最も基本的な性質である、ベシクルの自己生産・代謝・遺伝情報分子との連携・自己駆動、の4つの機能を備えた人工細胞の創成を進めようとするものである。本年度の研究実績は以下の通りである。
ベシクルの自己生産:2成分ベシクルが示す変形・分裂・回帰過程を3次元共焦点顕微鏡を用いて定量化し、膜弾性モデルにより解析した結果、ベシクル膜変形に伴って膜分子の分布が変化することが、このような自己生産が繰り返し行われるための鍵になっていることが判明した。
代謝:ベシクル膜が外部から分子を取り込んで成長するためには、膜表面での分子を化学的に変調させることが重要である。そのための、最も単純なモデルとして表面電位を用いて化学平衡を変調することによりベシクルの成長が加速されることが明らかとなった。
遺伝情報分子との連携:ベシクル型人工細胞に内封する二本鎖DNAの鎖長として、374 , 1164, 3200 bp の三種を選び、それぞれ内封したDNAを複製させた後、一定時間後に膜分子前駆体を添加し、それぞれ20~30試料につき、そこで誘発されるベシクルの形態変化を、共焦点レーザー走査型顕微鏡を用いて精査した。その結果、形態変化の頻度、および分裂様式などに、明確なDNA鎖長依存性があることが示された。
自己駆動現象:リン脂質で作製した多重膜ジャイアントベシクルにオレイン酸ナトリウム水溶液を穏やかに添加することで,球形からひも状へ形態変化したジャイアントベシクルが一方向的に駆動したり回転運動したりすることを見出した。同様な現象はデシルアミンの水中で作製したリオトロピック液晶型ひも状分子凝集体でも観察された。これら駆動現象は,形状の曲率に依存した分子の溶解速度の差が,異方的な分子拡散場を凝集体周囲にうみだしたことによる拡散泳動に因るものと考えられる。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本計画研究では、人工細胞の創成に向けて合成化学とソフトマター物理学の研究者が連携して挑むものである。人工細胞の根幹をなす基本的要素(自己生産・代謝・遺伝情報分子との連携・自己駆動)に関しては、おおよそ再現に成功し、その物理的な機構も明らかになってきた。また自己駆動に関しては、ワームに似て、全体をくねらせながら前進・回転・反転運動する想定外の新しい駆動現象の発見もあった。今後は、各要素の連携に焦点をあて、より生命らしい人工細胞系の構築に向かって研究を進める。

Strategy for Future Research Activity

本研究グループは、生命の最も基本的な性質である、ベシクルの自己生産・代謝・遺伝情報分子との連携・自己駆動、の4つの機能を備えた人工細胞の創成を進めようとするものである。今後の研究の推進方策は以下の通りである。
ベシクルの自己生産:これまで解析を進めてきたのは、ベシクルを構成する分子数が一定のものであった。これをベースに外部から分子を取り込んで成長・分裂するベシクル(菅原グループの開発したベシクル)の解析を進め、分子供給系と連動した自己生産のベシクルの特質を分子供給系を持たないものと比較することにより明確にする。
代謝:膜表面での化学的な変調によりベシクル膜への分子の取り込みを、様々な分子を触媒的に媒介させることにより加速・制御できるか調べる。できればこのように成長するベシクルが分裂することが可能か、3次元解析も含めて検討を進める。
遺伝情報分子との連携:異なるDNAを内封したベシクル型人工細胞のベシクル膜を、それぞれ異なる蛍光プローブで標識する。内封DNA増幅後に膜分子前駆体を添加し、生産される第二世代のベシクルの増殖効率をフローサイトメトリーで集団計測することで、異なるDNAを保有するベシクル間の自己増殖能を競わせる。
自己駆動:界面活性剤添加時に凝集体へ補充できることを目指した人工リン脂質を新たに合成したことから,これを用いて一連の駆動現象を長時間継続させることで変形-駆動がカップリングする機構の本質へ迫る。

  • Research Products

    (50 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (5 results) (of which Int'l Joint Research: 3 results,  Peer Reviewed: 5 results,  Acknowledgement Compliant: 4 results) Presentation (36 results) (of which Int'l Joint Research: 18 results,  Invited: 11 results) Book (1 results) Remarks (3 results) Funded Workshop (1 results)

  • [Int'l Joint Research] University of Southern Denmark(デンマーク)

    • Country Name
      DENMARK
    • Counterpart Institution
      University of Southern Denmark
  • [Int'l Joint Research] University Paris Diderot Paris 7/University Pierre & Marie Curie Paris 6(フランス)

    • Country Name
      FRANCE
    • Counterpart Institution
      University Paris Diderot Paris 7/University Pierre & Marie Curie Paris 6
  • [Int'l Joint Research] University of Ljubljana/Jozef Stefan Institute(スロベニア)

    • Country Name
      SLOVENIA
    • Counterpart Institution
      University of Ljubljana/Jozef Stefan Institute
  • [Int'l Joint Research] ETH(スイス)

    • Country Name
      SWITZERLAND
    • Counterpart Institution
      ETH
  • [Journal Article] Migration of phospholipid vesicles in response to OH- stimuli2016

    • Author(s)
      Atsuji Kodama, Yuka Sakuma, Masayuki Imai, Yutaka Oya, Toshihiro Kawakatsu, Nicolas Puff and Miglena I. Angelova
    • Journal Title

      Soft Matter

      Volume: 12 Pages: 2877-2886

    • DOI

      10.1039/c5sm02220g

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Role of Inverse-Cone-Shape Lipids in Temperature-Controlled Self-Reproduction of Binary Vesicles2016

    • Author(s)
      Takehiro Jimbo, Yuka Sakuma, Naohito Urakami, Primož Ziherl, and Masayuki Imai
    • Journal Title

      Biophys. J.

      Volume: 110 Pages: 1551-1562

    • DOI

      10.1016/j.bpj.2016.02.08

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Dynamics of fatty acid vesicles in response to pH stimuli2015

    • Author(s)
      K. Ikari, Y. Sakuma, T. Jimbo, A. Kodama, M. Imai, P.-A. Monnard and S. Rasmussen
    • Journal Title

      Soft Matter

      Volume: 11 Pages: 6327-6334

    • DOI

      10.1039/c5sm01248a

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] A Recursive Vesicle-based Model Protocell with a Primitive Model Cell Cycle2015

    • Author(s)
      Kensuke Kurihara, Yusaku Okura, Muneyuki Matsuo, Taro Toyota, Kentaro Suzuki, Tadashi Sugawara
    • Journal Title

      Nature Commun.

      Volume: 6 Pages: 8352-1-7

    • DOI

      10.1038/ncomms9352

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Structure and growth behavior of centimeter-sized helical oleate assemblies formed with assistance of medium-length carboxylic acids2015

    • Author(s)
      Yoshiyuki Kageyama, Tomonori Ikegami, Natsuko Hiramatsu, Sadamu Takeda, Tadashi Sugawara
    • Journal Title

      Soft Matter

      Volume: 11 Pages: 3550-3558

    • DOI

      10.1039/C5SM00370A

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] デシルアミン/水界面で形成されるチューブ状分子凝集体の波打ち運動2016

    • Author(s)
      田中雄喜,豊田太郎
    • Organizer
      日本化学会第96春季大会
    • Place of Presentation
      同志社大学, 京都府京田辺市
    • Year and Date
      2016-03-24 – 2016-03-27
  • [Presentation] 界面活性剤溶液中における紐状分子集合体の自己駆動現象2016

    • Author(s)
      諸橋博昭・豊田太郎・今井正幸
    • Organizer
      日本物理学会第71回年次大会
    • Place of Presentation
      東北学院大学, 宮城県仙台市
    • Year and Date
      2016-03-19 – 2016-03-22
  • [Presentation] 化学刺激によるベシクル膜面上での孔形成2016

    • Author(s)
      佐久間由香・兒玉篤治・今井正幸
    • Organizer
      日本物理学会第71回年次大会
    • Place of Presentation
      東北学院大学, 宮城県仙台市
    • Year and Date
      2016-03-19 – 2016-03-22
  • [Presentation] 接着したベシクルの形態形成2016

    • Author(s)
      河野拓馬・海老原隆太・佐久間由香・今井正幸・Primoz Ziherl
    • Organizer
      日本物理学会第71回年次大会
    • Place of Presentation
      東北学院大学, 宮城県仙台市
    • Year and Date
      2016-03-19 – 2016-03-22
  • [Presentation] ベシクルの分裂シミュレーション2016

    • Author(s)
      浦上直人・今井正幸
    • Organizer
      日本物理学会第71回年次大会
    • Place of Presentation
      東北学院大学, 宮城県仙台市
    • Year and Date
      2016-03-19 – 2016-03-22
  • [Presentation] 化学刺激に誘起される分子集合体の自己駆動現象2015

    • Author(s)
      諸橋博昭・今井正幸・豊田太郎
    • Organizer
      第5回ソフトマター研究会
    • Place of Presentation
      東北大学, 宮城県仙台市
    • Year and Date
      2015-12-17 – 2015-12-19
  • [Presentation] 多細胞モデルの形態形成2015

    • Author(s)
      河野拓馬・海老原隆太・佐久間由香・今井正幸・Primoz Ziherl
    • Organizer
      第5回ソフトマター研究会
    • Place of Presentation
      東北大学, 宮城県仙台市
    • Year and Date
      2015-12-17 – 2015-12-19
  • [Presentation] 二価の陽イオンによるリン脂質ベシクルの駆動2015

    • Author(s)
      兒玉 篤治、佐久間 由香、今井 正幸、川勝 年洋、NicolasPuff、 Miglena I. Angelova
    • Organizer
      第5回ソフトマター研究会
    • Place of Presentation
      東北大学, 宮城県仙台市
    • Year and Date
      2015-12-17 – 2015-12-19
  • [Presentation] Identity as life acquired by hierarchical emerged in molecular system2015

    • Author(s)
      Tadashi Sugawara
    • Organizer
      2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2015)
    • Place of Presentation
      Hawaii, US
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Self-reproduction of giant vesicle emerged under non-equilibrium condition2015

    • Author(s)
      Tadashi Sugawara, Katsuto Takakura, Kensuke Kurihara, Taro Toyota, and Kentaro Suzuki
    • Organizer
      2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2015)
    • Place of Presentation
      Hawaii, US
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Positive phototaxis of oil-droplets of caged oleic acid against an anisotropic UV irradiation2015

    • Author(s)
      Kentaro Suzuki, Naoyuki Nakayama, and Tadashi Sugawara
    • Organizer
      2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2015)
    • Place of Presentation
      Hawaii, US
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Giant vesicle containing a photo-sensitive smaller giant vesicle2015

    • Author(s)
      Kotaro Machida, Kentaro Suzuki, Kazuo Yamaguchi, and Tadashi Sugawara
    • Organizer
      2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2015)
    • Place of Presentation
      Hawaii, US
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Morphorogical diversity of giant vesicle-based protcell depending on degree of complexation of DNA and catalysts2015

    • Author(s)
      Muneyuki Matsuo, Kensuke Kurihara, Taro Toyota, and Tadashi Sugawara
    • Organizer
      2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2015)
    • Place of Presentation
      Hawaii, US
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Self-driven motion of oil-droplet emerged after chemical reaction2015

    • Author(s)
      Kentaro Suzuki, Naoyuki Nakayama, and Tadashi Sugawara
    • Organizer
      2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2015)
    • Place of Presentation
      Hawaii, US
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 原始的細胞周期をもつベシクル型人工細胞2015

    • Author(s)
      菅原正
    • Organizer
      第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド, 兵庫県神戸市
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
    • Invited
  • [Presentation] ベシクルからプロトセルへの道:ソフトマターからのアプローチ2015

    • Author(s)
      今井正幸
    • Organizer
      山田研究会「生物と非生物をつなぐ」
    • Place of Presentation
      ラフォーレ修善寺, 静岡県伊豆市
    • Year and Date
      2015-11-16 – 2015-11-18
    • Invited
  • [Presentation] 回帰性のある人工細胞2015

    • Author(s)
      菅原正
    • Organizer
      山田研究会「生物と非生物をつなぐ」
    • Place of Presentation
      ラフォーレ修善寺, 静岡県伊豆市
    • Year and Date
      2015-11-16 – 2015-11-18
    • Invited
  • [Presentation] 二重ベシクルの紫外線照射による光応答性内部ベシクルからの内包物の放出2015

    • Author(s)
      町田巧太郎, 鈴木健太郎, 山口和夫, 菅原正
    • Organizer
      第26回基礎有機化学連合討論会
    • Place of Presentation
      愛媛大学, 愛媛県松山市
    • Year and Date
      2015-09-24 – 2015-09-26
  • [Presentation] 光分解反応と連動したo/wエマルション中の油滴の駆動現象2015

    • Author(s)
      鈴木健太郎, 中山直之, 山口和夫, 菅原正
    • Organizer
      第26回基礎有機化学連合討論会
    • Place of Presentation
      愛媛大学, 愛媛県松山市
    • Year and Date
      2015-09-24 – 2015-09-26
  • [Presentation] Chemical control of vesicle dynamics2015

    • Author(s)
      M. Imai
    • Organizer
      iCeMS International Symposium
    • Place of Presentation
      Kyoto University, Kyoto, Kyoto, Japan
    • Year and Date
      2015-09-23 – 2015-09-26
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 光分解反応に連動した自己駆動油滴ダイナミクス2015

    • Author(s)
      鈴木健太郎, 中山直之, 菅原正
    • Organizer
      第9回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      東京工業大学, 東京都目黒区
    • Year and Date
      2015-09-19 – 2015-09-22
  • [Presentation] 化学刺激によるリン脂質ベシクルの駆動2015

    • Author(s)
      兒玉篤治, 佐久間由香, 今井正幸, 大矢豊大, 川勝年洋, Nicolas Puff, Miglena I. Angelova
    • Organizer
      日本物理学会2015年秋大会
    • Place of Presentation
      関西大学, 大阪府吹田市
    • Year and Date
      2015-09-16 – 2015-09-19
  • [Presentation] Approach to Minimal Cell based on membrane physics2015

    • Author(s)
      Y. Sakuma
    • Organizer
      International Workshop on Challenge to Synthesizing Life
    • Place of Presentation
      Hotel Kagetsuen, Hakone, Kanagawa, Japan
    • Year and Date
      2015-08-25 – 2015-08-26
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Physics of self-reproduction of vesicle reveal by 3D analysis2015

    • Author(s)
      T. Jimbo
    • Organizer
      International Workshop on Challenge to Synthesizing Life
    • Place of Presentation
      Hotel Kagetsuen, Hakone, Kanagawa, Japan
    • Year and Date
      2015-08-25 – 2015-08-26
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Bifurcation of Protocell Transformation Depending on the Maturation Degree of DNA-based Pseudoenzyme2015

    • Author(s)
      Muneyuki Matsuo
    • Organizer
      International Workshop on Challenging to Synthesizing Life
    • Place of Presentation
      Hotel Kagetsuen, Hakone, Kanagawa, Japan
    • Year and Date
      2015-08-25 – 2015-08-26
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Spontaneous Motion of Photo-active Oil Droplets2015

    • Author(s)
      Kentaro Suzuki
    • Organizer
      International Workshop on Challenging to Synthesizing Life
    • Place of Presentation
      Hotel Kagetsuen, Hakone, Kanagawa, Japan
    • Year and Date
      2015-08-25 – 2015-08-26
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Migration of phospholipid vesicles in response to chemical stimuli2015

    • Author(s)
      A. Kodama, Y. Sakuma, M. Imai, Y. Oya, T. Kawakatsu, N. Puff and M. Angelova
    • Organizer
      International Symposium on Fluctuation and Structure out of Equilibrium 2015
    • Place of Presentation
      Kyoto University, Kyoto, Kyoto, Japan
    • Year and Date
      2015-08-20 – 2015-08-23
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] A key for self-reproduction of vesicles2015

    • Author(s)
      T. Jimbo, Y. Sakuma, P. Ziherl, N. Urakami, and M. Imai
    • Organizer
      International Symposium on Fluctuation and Structure out of Equilibrium 2015
    • Place of Presentation
      Kyoto University, Kyoto, Kyoto, Japan
    • Year and Date
      2015-08-20 – 2015-08-23
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Sustainability of Recursive Vesicle-based Protocell2015

    • Author(s)
      Tadashi Sugawara, Kensuke Kurihara, Muneyuki Matsuo, Taro Toyota, and Kentaro Suzuki
    • Organizer
      International Symposium on Fluctuation and Structure out of Equilibrium 2015 (SFS2015)
    • Place of Presentation
      Kyoto University, Kyoto, Kyoto, Japan
    • Year and Date
      2015-08-20 – 2015-08-23
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Construction of Photo-sensitive GV in GV2015

    • Author(s)
      Kentaro Suzuki, Kotaro Machida, Kazuo Yamaguchi, and Tadashi Sugawara
    • Organizer
      International Symposium on Fluctuation and Structure out of Equilibrium 2015 (SFS2015) 発表年月日:
    • Place of Presentation
      Kyoto University, Kyoto, Kyoto, Japan
    • Year and Date
      2015-08-20 – 2015-08-23
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Giant Vesicle-Based Protocell Model Exhibiting Bifurcation of Transformation: Budding vs Multi-Tubulation2015

    • Author(s)
      Muneyuki Matsuo, Kensuke Kurihara, Taro Toyota, and Tadashi Sugawara
    • Organizer
      International Symposium on Fluctuation and Structure out of Equilibrium 2015 (SFS2015)
    • Place of Presentation
      Kyoto University, Kyoto, Kyoto, Japan
    • Year and Date
      2015-08-20 – 2015-08-23
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Recursive Vesicle-based Protocell Constructed as a Molecular System2015

    • Author(s)
      Tadashi Sugawara, Kensuke Kurihara, Muneyuki Matsuo, Taro Toyota, and Kentaro Suzuki
    • Organizer
      SysChem 2015
    • Place of Presentation
      Kerkrade, Netherland
    • Year and Date
      2015-05-19 – 2015-05-22
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Morphological diversity emerged by complexation between DNA and catalysts in vesicle-based protocell2015

    • Author(s)
      Muneyuki Matsuo, Kensuke Kurihara, Taro Toyota, and Tadashi Sugawara
    • Organizer
      SysChem 2015
    • Place of Presentation
      Kerkrade, Netherland
    • Year and Date
      2015-05-19 – 2015-05-22
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] 界面活性剤の刺激により駆動するリン脂質凝集体2015

    • Author(s)
      諸橋博昭・豊田太郎・今井正幸
    • Organizer
      新学術領域研究「ゆらぎと構造の協奏」第2回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学, 東京都文京区
    • Year and Date
      2015-05-01 – 2015-05-01
  • [Presentation] 化学反応に遅れて出現する自己駆動油滴ダイナミクス2015

    • Author(s)
      鈴木 健太郎, 菅原 正
    • Organizer
      揺らぎと構造の協奏:第2回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京大学, 東京都文京区
    • Year and Date
      2015-05-01 – 2015-05-01
  • [Presentation] 運動開始に遅れのある紫外線応答性油滴の自己駆動系2015

    • Author(s)
      鈴木 健太郎, 中山 直之, 菅原 正
    • Organizer
      機能性物性融合科学研究会シリーズ2 ソフトダイナミクス
    • Place of Presentation
      物性研究所, 千葉県柏市
    • Year and Date
      2015-04-02 – 2015-04-03
  • [Book] 自己組織化マテリアルのフロンティア2015

    • Author(s)
      豊田太郎 (中西 尚志 編)
    • Total Pages
      10
    • Publisher
      フロンティア出版
  • [Remarks] 東北大学理学研究科物理学専攻 ソフトマター・生物物理研究室

    • URL

      http://www.bio.phys.tohoku.ac.jp

  • [Remarks] 神奈川大学理学部化学科菅原研究室

    • URL

      http://www.chem.kanagawa-u.ac.jp/~sugawara/

  • [Remarks] 東京大学駒場 豊田研究室

    • URL

      http://park.itc.u-tokyo.ac.jp/toyota_lab/

  • [Funded Workshop] International Workshop on Challenging to Synthesizing Life2015

    • Place of Presentation
      箱根
    • Year and Date
      2015-08-25 – 2015-08-26

URL: 

Published: 2017-01-06  

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