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2013 Fiscal Year Annual Research Report

溶液・高分子系界面の構造および機能の理論解析

Planned Research

Project AreaScience on Function of Soft Molecular Systems by Cooperation of Theory and Experiment
Project/Area Number 25104003
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Research InstitutionTohoku University

Principal Investigator

森田 明弘  東北大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (70252418)

Project Period (FY) 2013-06-28 – 2018-03-31
Keywords界面分光 / 分子動力学シミュレーション / 差スペクトル
Research Abstract

申請者がこれまでに開発してきた分子シミュレーションに基づく界面分光の理論の成果をもとに、分光計測の実験研究者との共同研究を展開し、溶液・高分子などの柔らかな界面構造の理解を格段に深化させる。本年度はそのために我々の提唱した和周波分光の理論計算の適用範囲を大幅に拡げる高速なSFG 計算プログラムを開発した。これは従来よりも格段に汎用性が高いプログラムで、さらに並列化とチューニングを進めて、これまでよりも10-20倍程度の高速化を実現した。今後のさまざまな系に対する分光解析のためのプラットフォームを確立した。
また、微小な赤外吸収の差スペクトルを計算可能とする新たな計算手法を開発した。赤外吸収の差スペクトルは実験的に広く用いられている解析手法であるが、理論計算によって2つのスペクトルの差を求めることは、非常に大きな統計平均を必要とする困難な問題であった。本手法ではスペクトルを計算して差を求めるのではなく、差スペクトル自体を直接計算する新たな理論手法を開発し、差スペクトルの計算コストを従来よりも何桁も減少させることを可能とした。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

本領域の当初年度として、分光理論の計算にとって必要な界面和周波分光の汎用ソフトウェアを完成させた。これは次年度以降に実験研究者との共同研究によって界面構造と和周波スペクトルの解明に応用していくことを普及していくことを可能とするものである。
また、研究提案で掲げた赤外差スペクトルの理論を提案し、実際に正確で圧倒的に高速な差スペクトルの計算を可能とすることを実証した。これら理論開発の新展開は、振動分光に基づく本領域内での新たな共同研究を誘起する。当初年度として、計画時のねらい通り理論および計算手法の基礎を確立することができたと考えられる。

Strategy for Future Research Activity

今後和周波発生スペクトルの汎用プログラムをもとに、固液界面系の応用を進める。また界面のダイナミックスの界面のため、2次元和周波発生分光の理論開発を進める。また本年度に開発した振動差スペクトルの理論計算手法を水溶液系に拡張し、疎水性水和殻や電極界面など多くの分光測定の解析に応用する。
さらに溶液界面構造の詳細な理解に基づいて、柔らかな界面での物質移動の機能を分子科学の立場から解明する。従来の平均場の描像では捉えられなかった液液界面のミクロな構造ゆらぎの効果を理論的に明確化し、物質移動に与える影響を明らかにする。さらに分子レベルの界面構造とメソスケールの電気二重層構造を同時に考慮して、空間の広いスケールで界面物質移動の自由エネルギーの全貌を明らかにする理論を開発する。

  • Research Products

    (53 results)

All 2014 2013 Other

All Journal Article (9 results) (of which Peer Reviewed: 9 results,  Acknowledgement Compliant: 2 results) Presentation (43 results) (of which Invited: 14 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] Theory and Efficient Computation of Differential Vibrational Spectra2014

    • Author(s)
      Suguru Sakaguchi, Tatsuya Ishiyama, and Akihiro Morita
    • Journal Title

      J. Chem. Phys.

      Volume: 140 Pages: 144109-144121

    • DOI

      10.1063/1.4870523

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Computation of the Free Energy due to Electron Density Fluctuation of a Solute in Solution: A QM/MM Method with Perturbation Approach Combined with a Theory of Solutions2014

    • Author(s)
      Daiki Suzuoka, Hideaki Takahashi, and Akihiro Morita
    • Journal Title

      J. Chem. Phys.

      Volume: 140 Pages: 134111-134122

    • DOI

      10.1063/1.4870037

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Surface Acidity of Water Probed by Free Energy Calculation for Trimethylamine Protonation2014

    • Author(s)
      Yusuke Tabe, Nobuaki Kikkawa, Hideaki Takahashi, and Akihiro Morita
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. C

      Volume: 118 Pages: 977-988

    • DOI

      10.1021/jp4078882

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Reply to "Comment on `Surface Acidity of Water Probed by Free Energy Calculation for Trimethylamine Protonation'"2014

    • Author(s)
      Yusuke Tabe, Nobuaki Kikkawa, Hideaki Takahashi, and Akihiro Morita
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. C

      Volume: 118 Pages: 2895-2895

    • DOI

      10.1021/jp5005083

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Computational Analysis of the Quadrupole Contribution in the Second-Harmonic Generation Spectroscopy for the Water/Vapor Interface2013

    • Author(s)
      Kazuya Shiratori, Shoichi Yamaguchi, Tahei Tahara, and Akihiro Morita
    • Journal Title

      J. Chem. Phys.

      Volume: 138 Pages: 064704

    • DOI

      10.1063/1.4802916

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] A Molecular Dynamics Study on Inner Pressure of Microbubbles in Liquid Argon and Water2013

    • Author(s)
      Hideaki Takahashi and Akihiro Morita
    • Journal Title

      Chem. Phys. Lett.

      Volume: 573 Pages: 35-40

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2013.04.041

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Molecular Dynamics Study of Water Transfer at Supercooled Sulfuric Acid Solution Surface Covered with Butanol2013

    • Author(s)
      Suguru Sakaguchi and Akihiro Morita
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. A

      Volume: 117 Pages: 4602-4610

    • DOI

      10.1021/jp310305a

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Tip-Enhanced Raman Spectroscopy of 4,4'-Bipyridine and 4,4'-Bipyridine N, N'-Dioxide Adsorbed on Gold Thin Films2013

    • Author(s)
      Izabela I. Rzeznicka, Hideyuki Horino, Nobuaki Kikkawa, Suguru Sakaguchi, Akihiro Morita, Satoshi Takahashi, Tadahiro Komeda, Hiroshi Fukumura, Taro Yamada, and Maki Kawai
    • Journal Title

      Surf. Sci.

      Volume: 617 Pages: 1-9

    • DOI

      10.1016/j.susc.2013.08.010

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] Real-Time Observation of the Destruction of Hydration Shells2013

    • Author(s)
      Akira Yamakata, Eiji Soeta, Tatsuya Ishiyama, Masatoshi Osawa, and Akihiro Morita
    • Journal Title

      J. Am. Chem. Soc.

      Volume: 135 Pages: 15033-15039

    • DOI

      10.1021/ja408326d

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] 分子動力学シミュレーションを用いたイオンの液体界面通過に伴う活性化障壁の解析2014

    • Author(s)
      吉川 信明、森田 明弘
    • Organizer
      電気化学会第81回大会
    • Place of Presentation
      関西大学千里山キャンパス(吹田)
    • Year and Date
      20140329-20140331
  • [Presentation] 超並列QM/MM法による生体内化学過程の自由エネルギー計算2014

    • Author(s)
      高橋 英明
    • Organizer
      日本化学会第94回春季年会「複雑系のための分子科学―理論研究によるアプローチ」
    • Place of Presentation
      名古屋大学東山キャンパス
    • Year and Date
      20140327-20140330
    • Invited
  • [Presentation] 水の表面構造と振動スペクトルの分子動力学シミュレーション2014

    • Author(s)
      石山 達也
    • Organizer
      新学術領域「柔らかな分子系」第2回ワークショップ
    • Place of Presentation
      名古屋工業大学(名古屋)
    • Year and Date
      20140326-20140326
    • Invited
  • [Presentation] 溶液界面の計算分子科学と分光学2014

    • Author(s)
      森田 明弘
    • Organizer
      CMSI/TCCI研究会「分子集合系における先端分析と大規模計算~高度水利用に資するスマート分離技術の基盤構築を目指して~」
    • Place of Presentation
      ウィズビジネスセンター(東京)
    • Year and Date
      20140320-20140320
    • Invited
  • [Presentation] 和周波発生界面分光スペクトルに含まれる電気四重極子由来のバルク成分の計算2014

    • Author(s)
      澤井 寛美、白鳥 和矢、石山 達也、森田 明弘
    • Organizer
      第7回6専攻合同シンポジウム
    • Place of Presentation
      東北大学青葉山キャンパス(仙台)
    • Year and Date
      20140220-20140220
  • [Presentation] 溶液・高分子系界面の構造および機能の理論解析2013

    • Author(s)
      森田 明弘
    • Organizer
      新学術領域「柔らかな分子系」第2回合同合宿会議
    • Place of Presentation
      長浜ロイヤルホテル(長浜)
    • Year and Date
      20131205-20131207
    • Invited
  • [Presentation] 水,水溶液界面での構造と振動スペクトルの分子動力学シミュレーション2013

    • Author(s)
      石山 達也、森田 明弘
    • Organizer
      新学術領域「柔らかな分子系」第2回合同合宿会議
    • Place of Presentation
      長浜ロイヤルホテル(長浜)
    • Year and Date
      20131205-20131207
  • [Presentation] 和周波分光解析プログラムCalnosの開発と水/メタノール混合溶液表面への応用2013

    • Author(s)
      石原 崇志、石山 達也、森田 明弘
    • Organizer
      新学術領域「柔らかな分子系」第2回合同合宿会議
    • Place of Presentation
      長浜ロイヤルホテル(長浜)
    • Year and Date
      20131205-20131207
  • [Presentation] Molecular Science for Liquid Interfaces2013

    • Author(s)
      A. Morita
    • Organizer
      5th JCS International Symposium on Theoretical Chemistry
    • Place of Presentation
      Todai-ji Temple Comprehensive Cultural Center, Nara, Japan
    • Year and Date
      20131202-20131206
    • Invited
  • [Presentation] Free energy calculations for chemical reactions in condensed phase with massively parallel QM/MM simulations2013

    • Author(s)
      H. Takahashi, Y. Miki and A. Morita
    • Organizer
      5th JCS International Symposium on Theoretical Chemistry
    • Place of Presentation
      Todai-ji Temple Comprehensive Cultural Center, Nara, Japan
    • Year and Date
      20131202-20131206
    • Invited
  • [Presentation] Massively Parallel Implementation of the QM/MM Approach Combined with a Theory of Solutions2013

    • Author(s)
      H. Takahashi, Y. Miki and A. Morita
    • Organizer
      3rd International Conference on Molecular Simulation
    • Place of Presentation
      Kobe International Conference Center, Kobe, Japan
    • Year and Date
      20131118-20131120
  • [Presentation] Molecular Simulation for Liquid Interfaces2013

    • Author(s)
      A. Morita
    • Organizer
      3rd International Conference on Molecular Simulation
    • Place of Presentation
      Kobe International Conference Center, Kobe, Japan
    • Year and Date
      20131118-20131120
    • Invited
  • [Presentation] Study of aqueous NaOH solution surface via computational analysis of sum frequency spectra2013

    • Author(s)
      T. Imamura, T. Ishiyama, and A. Morita
    • Organizer
      3rd International Conference on Molecular Simulation
    • Place of Presentation
      Kobe International Conference Center, Kobe, Japan
    • Year and Date
      20131118-20131120
  • [Presentation] Vibrational Spectroscopic Response at Water/Vapor and Ice/Vapor Interfaces : Effect of Charge Transfer2013

    • Author(s)
      T. Ishiyama, H. Takahashi, and A. Morita
    • Organizer
      3rd International Conference on Molecular Simulation
    • Place of Presentation
      Kobe International Conference Center, Kobe, Japan
    • Year and Date
      20131118-20131120
  • [Presentation] Analysis of ion transport by using 2D free energy profile2013

    • Author(s)
      N. Kikkawa and A. Morita
    • Organizer
      3rd International Conference on Molecular Simulation
    • Place of Presentation
      Kobe International Conference Center, Kobe, Japan
    • Year and Date
      20131118-20131120
  • [Presentation] Is Water Surface Acidic or Basic?2013

    • Author(s)
      A. Morita
    • Organizer
      3rd Campus Asia Symposium
    • Place of Presentation
      Seoul National University, Seoul, Korea
    • Year and Date
      20131107-20131109
    • Invited
  • [Presentation] Development of Massively Parallel QM/MM method Combined with a Theory of Solutions2013

    • Author(s)
      H. Takahashi
    • Organizer
      CMSI International Symposium 2013
    • Place of Presentation
      Ito International Academic Research Center, Tokyo, Japan
    • Year and Date
      20131021-20131022
    • Invited
  • [Presentation] Implementation and Application of the Massively Parallel QM/MM-ER Method2013

    • Author(s)
      H. Takahashi
    • Organizer
      CMSI International Satellite Meeting in Nagoya
    • Place of Presentation
      Nagoya city center, Nagoya, Japan
    • Year and Date
      20131017-20131019
    • Invited
  • [Presentation] Molecular Dynamics Simulation of Structure and Vibrational Spectra at Water/Vapor and Ice/Vapor Interfaces : Effect of Charge Transfer2013

    • Author(s)
      T. Ishiyama
    • Organizer
      CMSI International Satellite Meeting in Nagoya
    • Place of Presentation
      Nagoya city center, Nagoya, Japan
    • Year and Date
      20131017-20131019
    • Invited
  • [Presentation] 溶液・高分子系界面の構造および機能の理論解析2013

    • Author(s)
      森田 明弘
    • Organizer
      新学術領域研究「柔らかな分子系」第1回公開シンポジウム
    • Place of Presentation
      東京工業大学町田キャンパス (東京)
    • Year and Date
      20131005-20131005
    • Invited
  • [Presentation] The Effect of Ion Pair Formation on Ion Passage through the Liquid-Liquid Interface2013

    • Author(s)
      N. Kikkawa and A. Morita
    • Organizer
      International Symposium for the 70th Anniversary of the Tohoku Branch of the Chemical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Kawauchi Campus Tohoku University, Sendai, Japan
    • Year and Date
      20130928-20130930
  • [Presentation] Comprehensive calculation of sum frequency generation spectroscopy including the bulk contribution from electric quadrupole2013

    • Author(s)
      H. Sawai, K. Shiratori, T. Ishiyama, and A. Morita
    • Organizer
      International Symposium for the 70th Anniversary of the Tohoku Branch of the Chemical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Kawauchi Campus Tohoku University, Sendai, Japan
    • Year and Date
      20130928-20130930
  • [Presentation] Molecular dynamics study of water transfer at supercooled sulfuric acid solution surface covered with butanol2013

    • Author(s)
      S. Sakaguchi and A. Morita
    • Organizer
      International Symposium for the 70th Anniversary of the Tohoku Branch of the Chemical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Kawauchi Campus Tohoku University, Sendai, Japan
    • Year and Date
      20130928-20130930
  • [Presentation] Why is benzene soluble in water? -Role of the fluctuation of π electrons in aromatic solutes immersed in water. -2013

    • Author(s)
      D. Suzuoka, S. Kimura, H. Takahashi, and A. Morita
    • Organizer
      International Symposium for the 70th Anniversary of the Tohoku Branch of the Chemical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Kawauchi Campus Tohoku University, Sendai, Japan
    • Year and Date
      20130928-20130930
  • [Presentation] Free energy analyses for ATP hydrolysis using quantum mechanical /molecular mechanical simulations combined with a theory of solutions2013

    • Author(s)
      Y. Miki, H. Takahashi, and A. Morita
    • Organizer
      International Symposium for the 70th Anniversary of the Tohoku Branch of the Chemical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Kawauchi Campus Tohoku University, Sendai, Japan
    • Year and Date
      20130928-20130930
  • [Presentation] Elucidation of surface acidity of trimethylamine water solution by computational method2013

    • Author(s)
      Y. Tabe, N. Kikkawa, H. Takahashi, and A. Morita
    • Organizer
      International Symposium for the 70th Anniversary of the Tohoku Branch of the Chemical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Kawauchi Campus Tohoku University, Sendai, Japan
    • Year and Date
      20130928-20130930
  • [Presentation] Development of SFG analyzing software CALNOS and application of surface of methanol/water mixture2013

    • Author(s)
      T. Ishihara, T. Ishiyama, and A. Morita
    • Organizer
      International Symposium for the 70th Anniversary of the Tohoku Branch of the Chemical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Kawauchi Campus Tohoku University, Sendai, Japan
    • Year and Date
      20130928-20130930
  • [Presentation] Vibrational Spectroscopic Response at Water/Vapor and Ice/Vapor Interfaces : Effect of Charge Transfer2013

    • Author(s)
      T. Ishiyama, H. Takahashi, and A. Morita
    • Organizer
      International Symposium for the 70th Anniversary of the Tohoku Branch of the Chemical Society of Japan
    • Place of Presentation
      Kawauchi Campus Tohoku University, Sendai, Japan
    • Year and Date
      20130928-20130930
  • [Presentation] 硫酸エアロゾル表面における取り込み反応への有機化合物の影響2013

    • Author(s)
      坂口 俊、森田 明弘
    • Organizer
      第7回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      京都テルサ(京都)
    • Year and Date
      20130924-20130927
  • [Presentation] 電気四重極由来のバルク成分を含めた和周波発生界面分光法の包括的な計算2013

    • Author(s)
      澤井 寛美、白鳥 和矢、石山 達也、森田 明弘
    • Organizer
      第7回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      京都テルサ(京都)
    • Year and Date
      20130924-20130927
  • [Presentation] 和周波分光解析プログラムCalnosの開発と水/メタノール混合溶液表面への応用2013

    • Author(s)
      石原 崇志、石山 達也、森田 明弘
    • Organizer
      第7回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      京都テルサ(京都)
    • Year and Date
      20130924-20130927
  • [Presentation] QM/MM-ER法によるATPモデル分子の加水分解自由エネルギーの計算2013

    • Author(s)
      三木 雄詩、高橋 英明、森田 明弘
    • Organizer
      第7回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      京都テルサ(京都)
    • Year and Date
      20130924-20130927
  • [Presentation] 実空間グリッドによる電子密度汎関数法の超並列化とその評価2013

    • Author(s)
      高橋 英明、三木 雄詩、森田 明弘
    • Organizer
      第7回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      京都テルサ(京都)
    • Year and Date
      20130924-20130927
  • [Presentation] 水和におけるπ電子の揺らぎの自由エネルギー解析2013

    • Author(s)
      鈴岡 大樹、高橋 英明、木村 慎太郎、森田 明弘
    • Organizer
      第7回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      京都テルサ(京都)
    • Year and Date
      20130924-20130927
  • [Presentation] イオン輸送に伴う液体界面の構造変化の役割2013

    • Author(s)
      吉川 信明、森田 明弘
    • Organizer
      第7回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      京都テルサ(京都)
    • Year and Date
      20130924-20130927
  • [Presentation] 水,氷の表面構造と和周波スペクトルの分子動力学計算:電荷移動の効果について2013

    • Author(s)
      石山 達也、高橋 英明、森田 明弘
    • Organizer
      第7回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      京都テルサ(京都)
    • Year and Date
      20130924-20130927
  • [Presentation] 水溶液表面における酸性度の理論計算2013

    • Author(s)
      田部 裕輔、吉川 信明、高橋 英明、森田 明弘
    • Organizer
      第7回分子科学討論会
    • Place of Presentation
      京都テルサ(京都)
    • Year and Date
      20130924-20130927
  • [Presentation] Theory and Simulation of Aqueous Interfaces and their Spectroscopy2013

    • Author(s)
      A. Morita
    • Organizer
      246th ACS National Meeting, Symposium on "Theory and Experiment on Water and Hydration,"
    • Place of Presentation
      Indiana Convention Center, Indianapolis, IN
    • Year and Date
      20130908-20130912
    • Invited
  • [Presentation] Computation of the solvation free energies due to the fluctuation of π-electrons in benzene in water utilizing the QM/MM simulations combined with perturbation theory2013

    • Author(s)
      D. Suzuoka, S. Kimura, H. Takahashi, A. Morita
    • Organizer
      Tohoku University's Chemistry Summer School 2013
    • Place of Presentation
      Aobayama campus Tohoku University, Sendai, Japan
    • Year and Date
      20130828-20130831
  • [Presentation] Theoretical analysis of ion transport through soft interfaces2013

    • Author(s)
      N. Kikkawa, A. Morita
    • Organizer
      Tohoku University's Chemistry Summer School 2013
    • Place of Presentation
      Aobayama Campus Tohoku University, Sendai, Japan
    • Year and Date
      20130828-20130831
  • [Presentation] Free energy analyses for ATP hydrolysis using quantum mechanical/molecular mechanical simulations combied with a theory of solutions2013

    • Author(s)
      Y. Miki, H. Takahashi, A. Morita
    • Organizer
      Tohoku University's Chemistry Summer School 2013
    • Place of Presentation
      Aobayama Campus Tohoku University, Sendai, Japan
    • Year and Date
      20130828-20130831
  • [Presentation] Development of software "CALNOS" for nonlinear spectroscopy calculation and its application to surface of water/methanol mixture2013

    • Author(s)
      T. Ishihara, T. Ishiyama, A. Morita
    • Organizer
      Tohoku University's Chemistry Summer School 2013
    • Place of Presentation
      Aobayama Campus Tohoku University, Sendai, Japan
    • Year and Date
      20130828-20130831
  • [Presentation] Vibrational Spectroscopic Response at Water/Vapor and Ice/Vapor Interfaces : Effect of Charge Transfer2013

    • Author(s)
      T. Ishiyama
    • Organizer
      7th International Conference on Advanced Vibrational Spectroscopy
    • Place of Presentation
      Kobe Convention Center, Kobe, Japan
    • Year and Date
      20130825-20130830
    • Invited
  • [Remarks] 計算分子科学研究室

    • URL

      http://comp.chem.tohoku.ac.jp/index.html

URL: 

Published: 2015-05-28  

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