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2015 Fiscal Year Annual Research Report

気相分光による水素結合系の構造多様性と水和ダイナミクスの解明

Planned Research

Project AreaScience on Function of Soft Molecular Systems by Cooperation of Theory and Experiment
Project/Area Number 25104008
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

藤井 正明  東京工業大学, ソリューション研究機構, 教授 (60181319)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 宮崎 充彦  東京工業大学, 資源化学研究所, 助教 (00378598)
石内 俊一  東京工業大学, 資源化学研究所, 助教 (40338257)
石川 春樹  北里大学, 理学部, 教授 (80261551)
Project Period (FY) 2013-06-28 – 2018-03-31
Keywords分子分光 / レーザー分光 / 原子・分子物理 / 分子クラスター
Outline of Annual Research Achievements

種々のポリペプチドや有機ソフト系分子集合体などに気相分光の手法を適用するために、エレクトロスプレー法と冷却イオントラップを組み合わせた分光装置を開発した。冷却イオントラップには新規に開発した銅製の四重極イオントラップを用いることで、イオンの冷却効率をの飛躍的向上に成功した。これにより、極低温イオンのコンフォマー選別した電子スペクトルの測定が可能になった。
本装置を用いて、カテコールアミン神経伝達物質、そのレセプタータンパク質の結合部位部分ペプチド、及びそれらの複合体のコンフォマー選別した赤外スペクトルの測定に成功した。カテコールアミン神経伝達物質であるアドレナリンは、単体ではカテコールOH基が分子ない水素結合を形成しているが、レセプタータンパク質の結合部位部分ペプチドと複合体を形成すると、2種類のコンフォメーションを取り、片方を分子内水素結合を形成したまま、もう片方は分子ない水素結合が消滅し、両方のカテコールOH基がペプチドと強い水素結合を形成した構造を取ることが明らかに成った。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

銅製イオントラップの導入により、イオンの高い冷却効率が得られ、高S/Nのスペクトル測定が可能になった。これにより、ペプチドやそれを含む複合体のコンフォメーション選別したスペクトルを比較的容易に高分解能で測定できる様になり、実験のスループットが飛躍的に向上した。その結果、理論解析がそれに追いつかない状況であり、今後、さらなる加速を図りたい。

Strategy for Future Research Activity

比較的大きな分子系に対する測定法はほぼ確立したが、それらの水和クラスターの生成が現有装置では難しいことが分かってきた。水和クラスターを脱溶媒を目的としたエレクトロスプレーイオン源で生成するのは、そもそも矛盾しており、不可能ではないにしても条件制御が非常に難しい。そこで、エレクトロスプレーで脱溶媒したイオンを真空中に導入し、反応セル(水和セル)を通過させることで、真空中で水和クラスターを生成させる。そのために、現有装置に水和セルとして温度可変イオントラップを増設する。これにより、神経伝達物質やペプチド及びその複合体の水和クラスターを生成し、それらの構造に対する水和の効果を検討する。

  • Research Products

    (17 results)

All 2016 2015

All Journal Article (8 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 7 results,  Acknowledgement Compliant: 7 results) Presentation (9 results) (of which Int'l Joint Research: 9 results,  Invited: 9 results)

  • [Journal Article] Structural motifs of 2-(2-fluoro-phenyl)-ethylamine conformers2015

    • Author(s)
      N. Mayorkas, H. Sachs, M. Schutz, S. Ishiuchi, M. Fujii, O. Dopfer, I. Bar
    • Journal Title

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      Volume: 18 Pages: 1191-1201

    • DOI

      10.1039/c5cp06131h

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] The Mechanism of Excited-State Proton Transfer in 1-Naphthol–Piperidine Clusters2015

    • Author(s)
      T. Shimizu, S. Manita, S. Yoshikawa, K. Hashimoto, M. Miyazaki, M. Fujii
    • Journal Title

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      Volume: 17 Pages: 25393-22402

    • DOI

      10.1039/c5cp03620h

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Spectroscopic study of jet-cooled indole-3-carbinol by laser desorption technique: Franck–Condon simulations and anharmonic calculations2015

    • Author(s)
      A. Ahn, A. Min, C.J. Moon, J.H. Lee, S.J. Lee, T. Warashina, S. Ishiuchi, M. Fujii, M. Y. Choi
    • Journal Title

      Chem. Phys. Lett.

      Volume: 638 Pages: 237-243

    • DOI

      10.1016/j.cplett.2015.08.063

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Real time observation of the excimer formation dynamics of gas phase benzene dimer by picosecond pump-probe spectroscopy2015

    • Author(s)
      M. Miyazaki,i M. Fujii
    • Journal Title

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      Volume: 17 Pages: 25989-25997

    • DOI

      10.1039/c5cp03010b

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Single Water Solvation Dynamics in the 4-Aminobenzonitrile–Water Cluster Cation Revealed by Picosecond Time-Resolved Infrared Spectroscopy2015

    • Author(s)
      M. Miyazaki, T. Nakamura, M. Wohlgemuth, R. Mitric, O. Dopfer, M. Fujii
    • Journal Title

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      Volume: 17 Pages: 29969-29977

    • DOI

      10.1039/c5cp05400a

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Electron-Proton Decoupling in Excited State Hydrogen Atom Transfer in the Gas Phase2015

    • Author(s)
      M. Miyazaki, R. Ohara, K. Daigoku, K. Hashimoto, J. R. Woodward, C. Dedonder, C. Jouvet, M. Fujii
    • Journal Title

      Angew. Chem. int. ed.

      Volume: 54 Pages: 15089-15093

    • DOI

      10.1002/anie.201506467

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Trapped Hydronium Radical Produced by UV Excitation of Substituted Aromatic Molecule2015

    • Author(s)
      F. J. Hernandez, M. C. Capello, A. Naito, S. Manita, K. Tsukada, M. Miyazaki, M. Fujii, M. Broquier, G. Gregoire, C. Dedonder-Lardeux, C. Jouvet, G. A. Pino
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. A

      Volume: 119 Pages: 12730-12735

    • DOI

      10.1021/acs.jpca.5b10142

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Mass analyzed threshold ionization detected infrared spectroscopy: isomerization activity of the phenol-Ar cluster near the ionization threshold2015

    • Author(s)
      M. Miyazaki, S. Yoshikawa, F. Michels, K. Misawa, S. Ishiuchi, M. Sakai, O. Dopfer, K. Muller-Dethlefs, M. Fujii
    • Journal Title

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      Volume: 17 Pages: 2494-2503

    • DOI

      10.1039/c4cp04584j

  • [Presentation] Development of high-cooling-efficiency quadrupole ion trap for conformer-selected UV spectroscopy of biomolecules2016

    • Author(s)
      S. Ishiuchi
    • Organizer
      IBBI 2016
    • Place of Presentation
      Oxford, UK
    • Year and Date
      2016-04-10 – 2016-04-15
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Vibrational spectroscopy on partial peptides SIVSF of adrenaline receptor2016

    • Author(s)
      M. Fujii
    • Organizer
      251st ACS meeting
    • Place of Presentation
      San Diego, USA
    • Year and Date
      2016-03-10 – 2016-03-17
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Gas phase spectroscopy of complex of adrenaline and its binding site of adrenoceptor2016

    • Author(s)
      S. Ishiuchi
    • Organizer
      Gordon Research Conferences “Molecular and Ionic Clusters 2016”
    • Place of Presentation
      Ventura, USA
    • Year and Date
      2016-01-10 – 2016-01-15
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Picosecond Time-Resolved IR/NIR Spectroscopy on Intra-Cluster Structural Dynamics2016

    • Author(s)
      M. Fuji
    • Organizer
      Gordon Research Conferences “Molecular and Ionic Clusters 2016”
    • Place of Presentation
      Ventura, USA
    • Year and Date
      2016-01-10 – 2016-01-15
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Mechanism of the ionization induced isomerization of phenol–Ar cluster studied by mass analyzed threshold ionization detected infrared spectroscopy2015

    • Author(s)
      M. Miyazaki
    • Organizer
      Pacifichem 2015 “Developments in Spectroscopic Investigation of Intermolecular Interactions and Dynamics of Molecular Clusters (#438)”
    • Place of Presentation
      Honolulu, USA
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Vibrational imaging by two-color infrared microscope2015

    • Author(s)
      M. Fujii
    • Organizer
      Pacifichem 2015 “Chemical Imaging: Frontiers of Spatio-Temporal Resolution (#134)
    • Place of Presentation
      Honolulu, USA
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Gas phase spectroscopy of neurotransmission system by laser desorption supersonic jet technique2015

    • Author(s)
      S. Ishiuchi
    • Organizer
      Pacifichem 2015 “Developments in Spectroscopic Investigation of Intermolecular Interactions and Dynamics of Molecular Clusters (#438)”
    • Place of Presentation
      Honolulu, USA
    • Year and Date
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Gas Phase Spectroscopy of Neurotransmitters and Partial Peptides of Receptor by IR-UV Double Resonance Spectroscopy2015

    • Author(s)
      M. Fujii
    • Organizer
      The Australasian Spectroscopy Conferences (The 11th Australian Conference on Vibrational Spectrosocpy: ACOVS11 and the 5th Asian Spectroscopy Conference: ASC5)
    • Place of Presentation
      Sydney, Australia
    • Year and Date
      2015-09-29 – 2015-10-02
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Real-time observation of intramolecular charge transfer dynamics in the (p-cyanophenyl)pentamethyldisilan–water cluster by picosecond time resolved IR spectroscopy2015

    • Author(s)
      M. Miyazaki
    • Organizer
      45th World Chemistry Congress (IUPAC 2015)
    • Place of Presentation
      Busan, Korea
    • Year and Date
      2015-08-09 – 2015-08-14
    • Int'l Joint Research / Invited

URL: 

Published: 2017-01-06  

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