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2017 Fiscal Year Annual Research Report

Structural diversity and hydration dynamics of hydrogen bonding system studied by gas-phase spectroscopy

Planned Research

Project AreaScience on Function of Soft Molecular Systems by Cooperation of Theory and Experiment
Project/Area Number 25104008
Research InstitutionTokyo Institute of Technology

Principal Investigator

藤井 正明  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 教授 (60181319)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 宮崎 充彦  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 助教 (00378598)
石内 俊一  東京工業大学, 科学技術創成研究院, 准教授 (40338257)
石川 春樹  北里大学, 理学部, 教授 (80261551)
Project Period (FY) 2013-06-28 – 2018-03-31
Keywords分子分光 / レーザー分光 / 原子・分子物理 / 分子クラスター / コンフォメーション解析
Outline of Annual Research Achievements

昨年度開発した水和クラスター生成用の温度可変イオントラップをさらに改良し、大きなサイズの水和クラスターの生成が可能になった。これを神経ペプチドの1つであるオキシトシンに適用し、水和によるペプチドの構造変化を赤外分光により追跡した。オキシトシンは環状ペプチドで環状部と鎖状部を持つが、オキシトシン単体では環状部と鎖状部が水素結合を軽視しているのに対して、水分子が1個水素結合するとその水素結合が阻害されることが分かった。さらに水分子を付加しても赤外スペクトルに大きな変化はなく、1個の水分子の水和がペプチドの構造変化の鍵になっていることが明らかになった。
上述の赤外分光は赤外吸収に伴うイオンの解離を検出することでスペクトルを測定するが、この方法では、通常の赤外吸収分光と同様に、複数の異性体が共存すると、それらの赤外スペクトルの重ね合わせが観測される。そこで、異性体ごとの赤外スペクトルを分離して観測できる赤外・赤外二重共鳴分光法を開発した。この方法では、まず第1の赤外レーザーの波長を特定の赤外吸収バンドに固定し、そのとき生成する解離イオンを検出する。解離イオン量はプローブしている赤外吸収バンドを与える異性体の基底状態の分子数に比例する。ここに第2の赤外レーザーを第1の赤外レーザーより時間的に前に照射する。第2の赤外レーザーを波長掃引し、もし、これがプローブしている異性体を振動励起すると、基底状態の分子数が減少するので、モニターしている解離イオン量も減少する。従って、特定の異性体の赤外スペクトルを解離イオン量の減少として測定することができる。この方法を、従来法では測定困難であったプロトン付加トリプトファンに適用し、異性体選別した赤外スペクトルの測定に成功した。

Research Progress Status

29年度が最終年度であるため、記入しない。

Strategy for Future Research Activity

29年度が最終年度であるため、記入しない。

  • Research Products

    (18 results)

All 2018 2017 Other

All Int'l Joint Research (2 results) Journal Article (6 results) (of which Int'l Joint Research: 6 results,  Peer Reviewed: 6 results,  Open Access: 1 results) Presentation (10 results) (of which Int'l Joint Research: 9 results,  Invited: 5 results)

  • [Int'l Joint Research] Technische Universitat Berlin(Germany)

    • Country Name
      Germany
    • Counterpart Institution
      Technische Universitat Berlin
  • [Int'l Joint Research] CNRS, Universite Paris-Sud/CNRS, Aix-Marseille Universite(France)

    • Country Name
      France
    • Counterpart Institution
      CNRS, Universite Paris-Sud/CNRS, Aix-Marseille Universite
  • [Journal Article] Molecular Recognition by a Short Partial Peptide of the Adrenergic Receptor: A Bottom-Up Approach2018

    • Author(s)
      T. Sekiguchi, M. Tamura, H. Oba, P. Carcarbal, R. R. Lozada-Garcia, A. Zehnacker-Rentien, G. Gregoire, S. Ishiuchi, M. Fujii
    • Journal Title

      Angew. Chem. Int. Ed.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1002/anie.201712976

    • Peer Reviewed / Open Access / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Stereochemistry-dependent structure of hydrogen-bonded protonated dimers: The case of 1-amino-indanol2018

    • Author(s)
      A. Bouchet, J. Klyne, S. Ishiuchi, O. Dopfer, M. Fujii, A. Zehnacker
    • Journal Title

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      Volume: 印刷中 Pages: 印刷中

    • DOI

      10.1039/C8CP00787J

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Real-time observation of the photoionization-induced water rearrangement dynamics in the 5-hydroxyindole-water cluster by time-resolved IR spectroscopy2018

    • Author(s)
      M. Miyazaki, A. Naito, T. Ikeda, J. Klyne, K. Sakota, H. Sekiya, O. Dopfer, M. Fujii
    • Journal Title

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      Volume: 20 Pages: 3079-3091

    • DOI

      10.1039/C7CP06127G

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Cation-size dependent conformational locking of glutamic acid by alkali ions: Infrared photodissociation spectroscopy of cryogenic ions2018

    • Author(s)
      J. Klyne, A. Bouchet, S. Ishiushi, M. Fujii, O. Dopfer
    • Journal Title

      J. Phys. Chem. B

      Volume: 122 Pages: 2295-2306

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.7b12601

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Sequential Microhydration of Cationic 5-Hydroxyindole (5HI+): Infrared Photodissociation Spectra of 5HI+-Wn Clusters (W=H2O, n<=4)2018

    • Author(s)
      J. Klyne, M. Miyazaki, M. Fujii, O. Dopfer
    • Journal Title

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      Volume: 20 Pages: 3092-3108

    • DOI

      10.1039/C7CP06132C

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Stepwise Microhydration of Aromatic Amide Cations: Solvation Networks Revealed by Infrared Spectra of Acetanilide+-(H2O)n Clusters (n<=3)2018

    • Author(s)
      J. Klyne, M. Schmies, M. Miyazaki, M. Fujii, O. Dopfer
    • Journal Title

      Phys. Chem. Chem. Phys.

      Volume: 20 Pages: 3148-3164

    • DOI

      10.1039/C7CP04659F

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Presentation] 分子認識系に対すボトムアップアプローチ2018

    • Author(s)
      石内 俊一
    • Organizer
      日本化学会第98春季年会
    • Invited
  • [Presentation] Hydration effect on conformers of protonated noradrenaline studied by ESI / cold ion trap laser spectroscopy2018

    • Author(s)
      S. Ishiuchi
    • Organizer
      Gordon Research Conferences: Molecular and Ionic Clusters 2018
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Real-time observation of slow water rearrangement dynamics in the 5-hydroxyindole-water cluster cation by time-resolved IR spectroscopy2018

    • Author(s)
      M. Miyazaki
    • Organizer
      Gordon Research Conferences: Molecular and Ionic Clusters 2018
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Cluster and Condensed Phase Dynamics2018

    • Author(s)
      M. Fujii
    • Organizer
      Gordon Research Conferences: Molecular and Ionic Clusters 2018
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Bottom-up approach to complexes of catecholamines and a partial peptide of adrenoceptor by cold ion spectroscopy2017

    • Author(s)
      S. Ishiuchi
    • Organizer
      The 21st East Asian Workshop on Chemical Dynamics
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Bottom-up Spectroscopic Approach to Molecular Recognition in Neurotransmitter Systems - ESI / Cold Ion Trap Laser Spectroscopy of Molecular Complex of Adrenaline Receptor Pocket2017

    • Author(s)
      M. Fujii
    • Organizer
      The 6th Asian Spectroscopy Conference (ASC2017)
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Real-time observation of charge transfer dynamics in a (p-cyanophenyl)pentamethyldisilane-water cluster by picosecond time-resolved IR spectroscopy2017

    • Author(s)
      M. Miyazaki
    • Organizer
      Time Resolved Vibrational Spectroscopy (TRVS 2017)
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Photo-induced charge transfer and hydration dynamics in a (p-cyanophenyl)pentamethyldisilane-water cluster by picosecond time-resolved IR spectroscopy2017

    • Author(s)
      M. Miyazaki
    • Organizer
      International Symposium on Molecular Beams 2017
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Conformations of protonated noradrenaline and its alkali metal complexes studied by an electrospray and a cold ion trap laser spectroscopy2017

    • Author(s)
      M. Fujii
    • Organizer
      Bunsentagung 2017 116th General Assembly of the German Bunsen Society for Physical Chemistry
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Photoexcitation induced water reorientation dynamics in the 5-hydroxyindole-water cluster studied by time resolved IR spectroscopy2017

    • Author(s)
      M. Miyazaki
    • Organizer
      Bunsentagung 2017 116th General Assembly of the German Bunsen Society for Physical Chemistry
    • Int'l Joint Research

URL: 

Published: 2018-12-17  

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