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2013 Fiscal Year Annual Research Report

オートファジーを担うAtgタンパク質群の構造基盤

Planned Research

Project AreaMultidisciplinary research on autophagy: from molecular mechanisms to disease states
Project/Area Number 25111004
Research Category

Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area)

Research InstitutionMicrobial Chemistry Research Foundation

Principal Investigator

野田 展生  公益財団法人微生物化学研究会, 微生物化学研究所, 主席研究員 (40396297)

Project Period (FY) 2013-06-28 – 2018-03-31
Keywordsオートファジー / 構造生物学 / Atg1複合体 / Atg13 / Atg17 / リン酸化 / 飢餓応答
Research Abstract

オートファジーは飢餓で強く誘導される.出芽酵母では飢餓依存的にAtg13が脱リン酸化し,Atg1,Atg17などとAtg1複合体を形成し,オートファジーの始動に働く.Atg13の天然変性領域内にAtg1結合領域およびAtg17結合領域を同定し,小型化したAtg1-Atg13複合体およびAtg13-Atg17複合体の結晶構造を決定した.その結果,Atg1はMITドメインを持ち,Atg13はMIT相互作用モチーフ(MIM)を用いてそれに結合すること,一方Atg13は短いAtg17結合領域(17BR)でAtg17の疎水性ポケットに結合することが明らかとなった.
次に飢餓依存的に脱リン酸化を受けるAtg13の残基をLC-MS/MSにより網羅的に決定した.それらのうち5残基はAtg13のMIMに存在し,そのリン酸化はAtg1との親和性を下げること,別の2残基はAtg13の17BRに存在し,そのリン酸化はAtg17との結合を消失させることを明らかにした.以上の結果から,飢餓によりAtg13の脱リン酸化が生じることで,Atg13はAtg1,Atg17両方に強く結合してAtg1複合体を形成し,その結果としてオートファジーが始動するというモデルを提示した.
また選択的オートファジーを担うアダプター因子群および哺乳類オートファジーを制御する因子群の発現,精製系の確立を行い,そのうちのいくつかについては結晶の作製に成功した.

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

Atg1複合体の構造生物学研究に大幅な進展が見られた.他の因子群についても順調に調製,結晶化が進んでいる.

Strategy for Future Research Activity

予定通り酵母主要Atg因子群,選択的オートファジーを担うアダプター因子群および哺乳類オートファジーを制御する因子群の構造生物学的研究を進める.また天然変性タンパク質や凝集体を形成するタンパク質の構造観察が可能な高速原子間力顕微鏡を新たな研究手法として導入し,構造研究の適用範囲を広げる.

  • Research Products

    (6 results)

All 2013 Other

All Journal Article (1 results) Presentation (4 results) (of which Invited: 4 results) Remarks (1 results)

  • [Journal Article] オートファジーの構造生物学2013

    • Author(s)
      野田 展生
    • Journal Title

      生化学

      Volume: 85 Pages: 762-774

  • [Presentation] オートファゴソームの形成と選択的積荷取り込みの構造基盤

    • Author(s)
      野田 展生
    • Organizer
      第86回日本生化学会大会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(横浜市)
    • Invited
  • [Presentation] 飢餓によるオートファジー始動の分子機構

    • Author(s)
      野田 展生
    • Organizer
      細胞内ロジスティクスシンポジウム
    • Place of Presentation
      淡路夢舞台国際会議場(兵庫県淡路市)
    • Invited
  • [Presentation] Structural basis of autophagy initiation by starvation.

    • Author(s)
      Nobuo N. Noda
    • Organizer
      3rd China-Japan Symposium on Autophagy
    • Place of Presentation
      敦煌国際ホテル(敦煌,中国)
    • Invited
  • [Presentation] 飢餓によるオートファジー始動の分子機構

    • Author(s)
      野田 展生
    • Organizer
      第7回オートファジー研究会
    • Place of Presentation
      ヤマハリゾートつま恋(静岡県掛川市)
    • Invited
  • [Remarks] 公益財団法人微生物化学研究会微生物化学研究所分子構造解析部

    • URL

      http://www.bikaken.or.jp/laboratories/molecule/summary.html

URL: 

Published: 2015-05-28  

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