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2015 Fiscal Year Annual Research Report

オートファジーの生理・病態生理学的意義とその分子基盤

Planned Research

Project AreaMultidisciplinary research on autophagy: from molecular mechanisms to disease states
Project/Area Number 25111005
Research InstitutionThe University of Tokyo

Principal Investigator

水島 昇  東京大学, 大学院医学系研究科(医学部), 教授 (10353434)

Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) 塚本 智史  国立研究開発法人放射線医学総合研究所, 放射線医学総合研究所 技術安全部, 主任研究員(定常) (80510693)
Project Period (FY) 2013-06-28 – 2018-03-31
Keywordsオートファジー / 細胞内分解 / リソソーム / 神経変性疾患
Outline of Annual Research Achievements

本研究課題では、モデル動物を用いたオートファジーの生理学的解析と、その基盤となる分子機構の解析を行っている。平成27年度は、生理機能の解析としては、ATG13の遺伝子欠損マウスの解析を行った。ATG13はULK、FIP200、ATG101とともに複合体を形成して、オートファゴソーム形成の始動を制御する因子である。Atg13ノックアウトマウスは胎生致死となり、心筋の発達異常がその原因と考えられた。ATG13と共同して機能するFIP200のノックアウトマウスも胎児期に死亡するが、他の多くのATG遺伝子ノックアウトマウスは出生直後に死亡するため、Atg13-FIP200がもつ非オートファジー機能が心臓発生に寄与している可能性が考えられた。また中国Hong Zhang博士と共同でヒトSENDA病のモデルとしてWIPI4/WDR45ノックアウトマウスを作製・解析し、これらがオートファジー基質の蓄積とともに学習障害、運動障害を呈することを明らかとした。また、受精によって誘導される脂肪滴の選択的分解とオートファジーとの関連について解析した。
一方、分子機構の解析はオートファジー始動複合体を中心に行った。計画研究の野田展生グループと共同で、複合体サブユニットのATG101-ATG13複合体の立体構造をX線結晶構造解析法により決定した。その結果、Atg101はAtg13のN末端領域と同様にHORMAドメイン構造を持ちAtg13とHORMA-HORMA複合体を形成すること、その反対面に特徴的なWFフィンガーをもち下流のATG因子の集積に重要であることを明らかにした。さらに、ULK1とATG13の結合の意義を解析した。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

予定されていたオートファジー関連モデル動物の作出と解析、オートファジー始動因子を中心とした分子機構の解析は順調に進んだ。ATG13ノックアウトマウス、WIPI4ノックアウトマウス、ATG101-ATG13複合体の構造解析などは論文発表に至った。その他のATGノックアウトマウスに関する研究についても、ATG101、VMP1ノックアウトマウス作出などが順調に進んでいる。STX17についてはES細胞からの作出に難航したが、方法を変更することで、約9ヶ月遅れて当初の予定のステップを完了することができている。合計して、原著論文6編、英文総説4編、和文総説1編を発表した。大学院生・学部学生などの若手の参画も多く、研究者育成も順調に進んでいる。

Strategy for Future Research Activity

後半期は、さらに発展的な内容の研究を推進する。メカニズムの研究としては、オートファゴソーム形成部位の解析、オートファゴソーム形成因子の機能解析、オートファゴソームおよび前駆体の精製と解析、オートファゴソームとリソソームの融合機構の解析、新しいタイプのオートファジーとしての水晶体細胞での小器官分解の解析等を行う。また、重要なプロジェクトとして、オートファジー定量系の構築と新規制御因子探索を行う予定である。一方、個体レベルでの生理・病態生理的意義の研究として、初期因子VMP1、FIP200、ATG101ノックアウトマウスの解析、脳を除く全身性ATG5KOマウス、各種ATGノックアウトゼブラフィッシュを樹立・解析を行う。疾患との関係としては、ヒト神経変性疾患SENDA原因因子WIPI4を欠損したゼブラフィッシュおよびマウスの解析をさらに進める。研究体制には大きな変化はない。

  • Research Products

    (51 results)

All 2016 2015 Other

All Int'l Joint Research (4 results) Journal Article (11 results) (of which Int'l Joint Research: 5 results,  Peer Reviewed: 10 results,  Acknowledgement Compliant: 8 results,  Open Access: 1 results) Presentation (33 results) (of which Int'l Joint Research: 9 results,  Invited: 20 results) Remarks (2 results) Patent(Industrial Property Rights) (1 results) (of which Overseas: 1 results)

  • [Int'l Joint Research] デュッセルドルフ大学(ドイツ)

    • Country Name
      GERMANY
    • Counterpart Institution
      デュッセルドルフ大学
  • [Int'l Joint Research] 中国科学アカデミー/清華大学/北京大学(中国)

    • Country Name
      CHINA
    • Counterpart Institution
      中国科学アカデミー/清華大学/北京大学
  • [Int'l Joint Research] シンシナティ大学/ワシントン大学/アルバート・アインシュタイン大学(米国)

    • Country Name
      U.S.A.
    • Counterpart Institution
      シンシナティ大学/ワシントン大学/アルバート・アインシュタイン大学
    • # of Other Institutions
      1
  • [Int'l Joint Research] TIGM(イタリア)

    • Country Name
      ITALY
    • Counterpart Institution
      TIGM
  • [Journal Article] Elevated p62/SQSTM1 determines the fate of autophagy-deficient neural stem cells by increasing superoxide.2016

    • Author(s)
      Wang, C., Chen, S., Yeo, S., Karsli-Uzunbas, G., White, E., Mizushima, N., Virgin, H.W., Guan, J.L.
    • Journal Title

      J. Cell Biol.

      Volume: 212 Pages: 545-560

    • DOI

      10.1083/jcb.201507023.

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Atg101: not just an accessory subunit in the autophagy-initiation complex.2016

    • Author(s)
      Noda, N.N., Mizushima, N.
    • Journal Title

      Cell Struct. Funct.

      Volume: 41 Pages: 13-20

    • DOI

      10.1247/csf.15013

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Survival of Effector CD8+ T Cells during Influenza Infection Is Dependent on Autophagy.2015

    • Author(s)
      Schlie, K., Westerback, A., DeVorkin, L., Hughson, L.R., Brandon, J.M., MacPherson, S., Gadawski, I., Townsend, K.N., Poon, V.I., Elrick, M.A., Cote, H.C., Abraham, N., Wherry, E.J., Mizushima, N., Lum, J.J.
    • Journal Title

      J Immunol.

      Volume: 194 Pages: 4277-4286

    • DOI

      10.4049/jimmunol.1402571

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] The autophagy gene Wdr45/Wipi4 regulates learning and memory function and axonal homeostasis.2015

    • Author(s)
      Zhao, Y.G., Sun, L., Miao, G., Ji, C., Zhao, H., Sun, H., Miao, L., Yoshii, S.R., Mizushima, N., Wang, X., Zhang, H.
    • Journal Title

      Autophagy

      Volume: 11 Pages: 881-890

    • DOI

      10.1080/15548627.2015.1047127

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research
  • [Journal Article] Structure of the Atg101-Atg13 complex reveals essential roles of Atg101 in autophagy initiation.2015

    • Author(s)
      Suzuki, H., Kaizuka, T., *Mizushima, N., *Noda, N. N.
    • Journal Title

      Mol. Biol.

      Volume: 2015 Pages: 572-580

    • DOI

      10.1038/nsmb.3036

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Expression of a ULK1/2 binding-deficient ATG13 variant can partially restore autophagic activity in ATG13-deficient cells.2015

    • Author(s)
      Hieke, N., Loefler, A.S., Kaizuka, T., Berleth, N., Boehler, P., Driessen, S., Stuhldreier, F., Friesen, O., Assani, K., Schmitz, K., Peter, C., Diedrich, B., Dengjel, J., Holland, P., Simonsen, A., Wesselborg, S., Mizushima, N., *Stork, B.
    • Journal Title

      Autophagy

      Volume: 11 Pages: 1471-1483

    • DOI

      10.1080/15548627

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Atg13 is essential for autophagy and cardiac development in mice.2015

    • Author(s)
      Kaizuka, T., Mizushima, N.
    • Journal Title

      Mol. Cell. Biol.

      Volume: 36 Pages: 585-595

    • DOI

      10.1128/MCB.01005-15

    • Peer Reviewed / Int'l Joint Research / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Autophagy machinery in the context of mammalian mitophagy.2015

    • Author(s)
      Yoshii, SR, Mizushima, N.
    • Journal Title

      Biochim Biophys Acta.

      Volume: 1853 Pages: 2797-2801

    • DOI

      10.1016/j.bbamcr.2015.01.013

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Autophagy in the lens2015

    • Author(s)
      Morishita, H., Mizushima, N
    • Journal Title

      Exp. Eye Res.

      Volume: 144 Pages: 22-28

    • DOI

      10.1016/j.exer.2015.08.019

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Open and closed HORMAs regulate autophagy initiation.2015

    • Author(s)
      Suzuki, H., Kaizuka, T., Mizushima, N., Noda, N.N.
    • Journal Title

      Autophagy

      Volume: 11 Pages: 2123-2124

    • DOI

      10.1080/15548627.2015.1091144

    • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] SENDA/BPANとオートファジー2015

    • Author(s)
      森下英晃、西村多喜、水島昇
    • Journal Title

      神経内科

      Volume: 83 Pages: 156-161

  • [Presentation] Initiation of Autophagosome Formation2016

    • Author(s)
      Noboru Mizushima
    • Organizer
      Gordon Research Conference, Autophagy in Stress, Development & Disease
    • Place of Presentation
      Ventura (USA)
    • Year and Date
      2016-03-20 – 2016-03-25
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] オートファジーによる細胞内分解2016

    • Author(s)
      水島昇
    • Organizer
      第89回日本薬理学会年会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県・横浜市)
    • Year and Date
      2016-03-09
    • Invited
  • [Presentation] Systemic analysis of adult Atg5-deficient mice2016

    • Author(s)
      Saori Yoshii, Akiko Kuma, Takumi, Akashi, Taichi Hara, Atsushi Yamamoto, Yoshitaka Kurikawa, Eisuke Itakura, Satoshi Tsukamoto, Hiroshi Shitara, Yoshinobu Eishi, Noboru Mizushima
    • Organizer
      Young Investigator Conference on Autophagy (A3)
    • Place of Presentation
      新潟大学(新潟県・新潟市)
    • Year and Date
      2016-02-18
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] Visualization of degradation process of intracellular protein aggregates using a reversible autophagy-regulating system2016

    • Author(s)
      Keigo Morita, Taki Nishimura, Noboru Mizushima
    • Organizer
      Young Investigator Conference on Autophagy (A3)
    • Place of Presentation
      新潟大学(新潟県・新潟市)
    • Year and Date
      2016-02-18
    • Int'l Joint Research
  • [Presentation] オートファジーによる細胞内品質管理制御2016

    • Author(s)
      水島昇
    • Organizer
      先端医療シーズ開発フォーラム2016 アカデミアからの挑戦
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都・文京区)
    • Year and Date
      2016-02-02
    • Invited
  • [Presentation] オートファジーによる細胞内分解の意義2016

    • Author(s)
      水島昇
    • Organizer
      第1回山梨医学フォーラム
    • Place of Presentation
      山梨大学(山梨県・甲府市)
    • Year and Date
      2016-02-02
    • Invited
  • [Presentation] オートファジーによる細胞内浄化2015

    • Author(s)
      水島昇
    • Organizer
      第1回Geroscience Initiative Japan~健康長寿を目指す老化医生物学~
    • Place of Presentation
      慶應義塾大学(東京都・港区)
    • Year and Date
      2015-12-19
    • Invited
  • [Presentation] Live imaging and molecular dissection of organelle degradation in the lens2015

    • Author(s)
      Noboru Mizushima, Hideaki Morishita
    • Organizer
      International Conference on the Lens 2015
    • Place of Presentation
      Kona (USA)
    • Year and Date
      2015-12-06 – 2015-12-11
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Formation and maturation of the autophagosome2015

    • Author(s)
      Noboru Mizushima
    • Organizer
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
    • Invited
  • [Presentation] Visualization of formation and degradation of intracellular protein2015

    • Author(s)
      Keigo Morita, Taki Nishimura, Noboru Mizushima
    • Organizer
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] 神経特異的オートファジーレスキューマウスの全身網羅的解析2015

    • Author(s)
      吉井紗織、久万亜紀子、栗川義峻、山本篤、板倉英祐、原太一、設楽浩志、水島昇
    • Organizer
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] Analysis of molecular mechanisms on a novel organelle degradation system in the lens using mice and zebrafish.2015

    • Author(s)
      森下英晃、青山裕加、水島昇
    • Organizer
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] 新規蛍光プローブを用いたオートファジー活性測定法の開発2015

    • Author(s)
      貝塚 剛志、森下 英晃、松井 貴英、塚本 智史、豊田 雄一郎、兒玉 昭彦、濱 祐太郎、水島 昇
    • Organizer
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会・第88回日本生化学会大会合同大会)
    • Place of Presentation
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [Presentation] オートファジーによる細胞内分解2015

    • Author(s)
      水島昇
    • Organizer
      難治性免疫疾患先端治療開発研究会
    • Place of Presentation
      慶應義塾大学(東京都・新宿区)
    • Year and Date
      2015-11-27
  • [Presentation] オートファジーによる細胞内分解:特に水晶体での機能について2015

    • Author(s)
      水島昇
    • Organizer
      第8回Retina Research Meeting
    • Place of Presentation
      JPタワー(東京都・千代田区)
    • Year and Date
      2015-10-30
    • Invited
  • [Presentation] Life of the autophagosome2015

    • Author(s)
      Kotaro Tsuboyama, Ikuko Koyama-Honda, Noboru Mizushima
    • Organizer
      JSPS A3 conference 2015
    • Place of Presentation
      Seoul (Korea)
    • Year and Date
      2015-10-29
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Molecular mechanisms of organelle degradation in the lens2015

    • Author(s)
      Hideaki Morishita, Noboru Mizushima
    • Organizer
      JSPS A3 conference 2015
    • Place of Presentation
      Seoul (Korea)
    • Year and Date
      2015-10-29
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] オートファジーによる細胞内分解2015

    • Author(s)
      水島昇
    • Organizer
      日本人類遺伝学会第60回大会
    • Place of Presentation
      京王プラザホテル(東京都・新宿区)
    • Year and Date
      2015-10-16
  • [Presentation] 受精後に起こるオートファジーを介したリサイクリングシステムの役割2015

    • Author(s)
      塚本智史
    • Organizer
      第108回日本繁殖生物学会大会シンポジウム
    • Place of Presentation
      宮崎市民プラザ(宮崎県宮崎市)
    • Year and Date
      2015-09-20
  • [Presentation] 水晶体オルガネラ分解を担う新規分解経路の分子機構の解明2015

    • Author(s)
      森下英晃、青山裕加、水島昇
    • Organizer
      2015水晶体研究会・白内障学会合同大会
    • Place of Presentation
      ミッドランドスクエア オフィスタワー(愛知県・名古屋市)
    • Year and Date
      2015-09-18 – 2015-09-20
  • [Presentation] 受精前後のマウス卵細胞質における脂肪滴の動態観察2015

    • Author(s)
      塚本智史、原太一、南直治郎、佐藤健
    • Organizer
      第108回日本繁殖生物学会大会
    • Place of Presentation
      宮崎大学(宮崎県宮崎市)
    • Year and Date
      2015-09-17 – 2015-09-19
  • [Presentation] Formation and maturation of the autophagosome2015

    • Author(s)
      Noboru Mizushima
    • Organizer
      EMBO Conference, Autophagy signalling and progression in health and disease
    • Place of Presentation
      Chia (Italy)
    • Year and Date
      2015-09-09 – 2015-09-12
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] 新規蛍光プローブを用いたオートファジー活性測定法の開発2015

    • Author(s)
      貝塚 剛志、森下 英晃、松井 貴英、塚本 智史、豊田 雄一郎、兒玉 昭彦、濱 祐太郎、水島 昇
    • Organizer
      高遠シンポジウム
    • Place of Presentation
      延暦寺ホテル(京都市・左京区)
    • Year and Date
      2015-08-26 – 2015-08-27
  • [Presentation] Syntaxin17の優勢阻害変異体を用いたオートファゴソーム蓄積方法の開発2015

    • Author(s)
      植松真章、西村多喜、酒巻有里子、水島 昇
    • Organizer
      高遠シンポジウム
    • Place of Presentation
      延暦寺ホテル(京都市・左京区)
    • Year and Date
      2015-08-26 – 2015-08-27
  • [Presentation] オートファジーによる細胞内分解2015

    • Author(s)
      水島昇
    • Organizer
      第38回日本神経科学大会
    • Place of Presentation
      神戸国際会議場(兵庫県・神戸市)
    • Year and Date
      2015-07-31
    • Invited
  • [Presentation] 受精後に起こるオートファジーの生理機能の解析2015

    • Author(s)
      塚本智史
    • Organizer
      クリニカルサミット「生殖医療の今日」
    • Place of Presentation
      東京医科歯科大学ソニーオープンラボ(東京都文京区)
    • Year and Date
      2015-07-29
    • Invited
  • [Presentation] オートファジーによる細胞内分解2015

    • Author(s)
      水島昇
    • Organizer
      第33回日本骨代謝学会学術集会
    • Place of Presentation
      京王プラザホテル(東京都・新宿区)
    • Year and Date
      2015-07-24
    • Invited
  • [Presentation] Physiological functions and molecular mechanisms of autophagy2015

    • Author(s)
      Noboru Mizushima
    • Organizer
      International Conference of Cancer Immunolotherapy and Macrophages 2015
    • Place of Presentation
      東京大学(東京都・文京区)
    • Year and Date
      2015-07-11
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] Novel insights into physiological roles of autophagy in mice2015

    • Author(s)
      Noboru Mizushima
    • Organizer
      Keystone Symposium Autophagy
    • Place of Presentation
      Breckenridge (USA)
    • Year and Date
      2015-06-19 – 2015-06-24
    • Int'l Joint Research / Invited
  • [Presentation] オートファジーによる細胞内分解の意義2015

    • Author(s)
      水島昇
    • Organizer
      第57回日本小児神経学会学術集会
    • Place of Presentation
      帝国ホテル大阪(大阪府・大阪市)
    • Year and Date
      2015-05-29
    • Invited
  • [Presentation] オートファジーによる細胞内分解2015

    • Author(s)
      水島昇
    • Organizer
      第64回日本アレルギー学会学術大会
    • Place of Presentation
      グランドプリンスホテル新高輪(東京都・港区)
    • Year and Date
      2015-05-27
    • Invited
  • [Presentation] The role of autophagy after fertilization2015

    • Author(s)
      塚本智史
    • Organizer
      IFFS/JSRM International Meeting 2015/第60回日本生殖医学会学術講演会
    • Place of Presentation
      パシフィコ横浜(神奈川県横浜市)
    • Year and Date
      2015-04-27
    • Invited
  • [Presentation] オートファジーによる細胞内分解2015

    • Author(s)
      水島昇
    • Organizer
      第52回日本臨床分子医学会学術集会
    • Place of Presentation
      みやこめっせ(京都府・京都市)
    • Year and Date
      2015-04-11
    • Invited
  • [Remarks] 東京大学大学院医学系研究科分子生物学分野ホームページ

    • URL

      http://square.umin.ac.jp/molbiol/

  • [Remarks] 領域ホームページ

    • URL

      http://www.proteolysis.jp/autophagy/

  • [Patent(Industrial Property Rights)] オートファジーの測定に好適な融合タンパク質、前記融合タンパク質をコードする核酸、及びそれらの利用2015

    • Inventor(s)
      水島昇
    • Industrial Property Rights Holder
      国立大学法人東京大学
    • Industrial Property Rights Type
      特許
    • Industrial Property Number
      PCT/JP2015/064568
    • Filing Date
      2015-05-21
    • Overseas

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Published: 2018-01-16   Modified: 2022-01-27  

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