2013 Fiscal Year Annual Research Report
| Project Area | Multidimensional Exploration of Logics of Plant Development |
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25113003
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| Research Institution | Kobe University |
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Principal Investigator |
深城 英弘 神戸大学, 理学(系)研究科(研究院), 教授 (80324979)
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| Project Period (FY) |
2013-06-28 – 2018-03-31
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| Keywords | 植物 / 発生・分化 / 遺伝子 / シロイヌナズナ / 突然変異体 |
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| Outline of Annual Research Achievements |
維管束植物の根系は、水分・養分の吸収、地上部の支持など、個体の生育にとって重要な役割を果たす。しかし、種によって異なる根系パターンの多様性を生み出す機構など、根の成長・発生の機構には未解明な点が数多く残されている。本研究では、植物が進化させてきた「根の成長・発生ロジック」の解明を目指し、シロイヌナズナおよび近縁種のアブラナ科タネツケバナ属を用いて主に以下の３つの研究項目に取り組む。
＜研究項目１：側根の発生ロジック＞シロイヌナズナの側根形成開始は、オーキシン誘導性転写活性化因子LBD16によって制御される。そこで、LBD16の下流遺伝子として同定したTOLS1（機能未知タンパク質）、TOLS2（推定ペプチド）、PUCHI（AP2型転写因子）遺伝子の発現制御と機能について解析した。その結果、TOLS1は側根形成を正に制御するのに対して、TOLS2とPUCHIは側根形成を負に制御することが示された。
＜研究項目２：放射パターン形成ロジック＞根の皮層と内皮が1層ずつのシロイヌナズナでは解析できない皮層の多層化機構について、根の皮層が２層（皮層２層・内皮１層）からなるタネツケバナ属ミチタネツケバナを用いた解析を行った。ミチタネツケバナの根の細胞分裂様式の観察から、皮層の層数が皮層・内皮始原細胞の娘細胞における並層分裂の回数によって決まることがわかった。また、この細胞分裂様式に異常の変異体をミチタネツケバナから複数単離した。
＜研究項目３：根の成長・発生を制御する未知の代謝システム＞根端分裂組織の維持に必須なプラスチド型フルクトース1,6-二リン酸アルドラーゼ1（FBA1）の変異体を用いて、根の成長・発生におけるFBA1を介した糖代謝の役割について解析を進めた。
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| Current Status of Research Progress |
Current Status of Research Progress
2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.
Reason
現在まで研究項目１、２に力を注いだため、３については当初の目標よりやや遅れたが、おおむね順調に進展している。特に＜研究項目１＞では、側根形成開始を制御する転写活性化因子LBD16の下流において、TOLS1が側根形成を正に制御するのに対して、TOLS2とPUCHIが側根形成を負に制御することが明らかとなった。これらのうち、TOLS2がコードする推定ペプチド（TOLS2ペプチド）がPUCHIの機能を介して側根形成頻度を低下させること、およびTOLS2ペプチドがPUCHIの転写を誘導することが示された。また、TOLS2-PUCHIによる側根形成抑制シグナリングに関わる因子を順遺伝学的・逆遺伝学的に同定した。これらの結果から、側根の形成頻度を制御する新たな制御機構の存在を示唆することができ、当初の目標をおおむね順調に達成した。
一方、＜研究項目２＞では、ミチタネツケバナの根の皮層・内皮層の形成に異常のある突然変異体の解析から、皮層・内皮層の形成に必要な遺伝子としてシロイヌナズナSHORT-ROOTのホモログ遺伝子ChSHRを同定することができ、当初の目標をおおむね順調に達成した。
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| Strategy for Future Research Activity |
研究項目１と２については興味深い成果が順調に得られており、それぞれ早い段階での成果公表を目指す。同時に研究項目３も今後の本格的な共同研究により進展させる。
＜研究項目１＞側根形成開始を制御する転写活性化因子LBD16の下流において、TOLS1が側根形成を正に制御する機構について、TOLS1遺伝子のノックダウン植物を用いて明らかにする。また、PUCHI遺伝子レポーター系統を変異原処理した次世代から、TOLSペプチドによるPUCHI遺伝子レポーターの発現誘導パターンが変化する変異体を複数単離しているので、これらの変異系統について遺伝学的解析と表現型解析を進めるとともに、原因遺伝子の同定に向けてマッピングおよび次世代シーケンサーによる変異箇所の同定を行う。
＜研究項目２＞ミチタネツケバナから単離した根の皮層・内皮層の形成に異常のある突然変異体について、表現型を解析するとともに、原因遺伝子を同定する。
＜研究項目３＞根の成長・発生に関わる代謝物質を同定する目的で、野生型およびfba1変異体における糖代謝産物をメタボローム解析によって定量・比較する。
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[Journal Article] Lateral root development in Arabidopsis: fifty shades of auxin.2013
Author(s)
Lavenus, J., Goh, T., Roberts, I., Guyomarc’h, S., Lucas, M., De Smet, I., Fukaki, H., Beeckmann, T., Bennett M. and Laplaze, L.
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Journal Title
Trends in Plant Sci.
Volume: 18
Pages: 450-458
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Local distribution of membrane proteins on vacuoles isolated from Arabidopsis suspension-cultured cells.2013
Author(s)
Yoshida, K., Ohnishi, M., Fukao, Y., Okazaki, Y., Song, C., Hayashi, F., Fujiwara, M., Nakanishi, Y., Saito, K., Shimmen, T., Suzaki, T., Fukaki, H., Maeshima, M., Mimura, T.
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Journal Title
Plant Cell Physiol.
Volume: 54
Pages: 1571-1584
DOI
Peer Reviewed
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[Journal Article] Ion gradients in xylem exudate and guttation fluid related to tissue ion levels along primary leaves of barley.2013
Author(s)
Nagai, M., Ohnishi, M., Uehara T., Yamagami, M, Miura E., Kamakura, M., Kitamura, A., Sakaguchi, S., Sakamoto, W., Shimmen, T., Fukaki, H., Reid, R.J., Furukawa, A. and Mimura, T. Ion gradients in xylem exudate and guttation fluid related to tissue ion levels along primary leaves of barley.
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Journal Title
Plant Cell Environ.
Volume: 36
Pages: 1826-1837
DOI
Peer Reviewed
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