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2014 Fiscal Year Annual Research Report

有性生殖の実現を可能にする発生ロジックの多元的かつ総合的理解

Planned Research

Project AreaMultidimensional Exploration of Logics of Plant Development
Project/Area Number 25113005
Research InstitutionKyoto University

Principal Investigator

荒木 崇  京都大学, 生命科学研究科, 教授 (00273433)

Project Period (FY) 2013-06-28 – 2018-03-31
Keywords植物 / 有性生殖 / 花成 / 生殖器官形成 / 代謝 / 複合オミクス解析 / シロイヌナズナ / ゼニゴケ
Outline of Annual Research Achievements

研究項目1
FT蛋白質の篩管を介した輸送過程の時間的側面と輸送に関わるアミノ酸残基の同定に関する論文をまとめ、現在投稿中である。また、篩部伴細胞で発現させたFT:EGFP蛋白質が細胞間移行により茎頂分裂組織全体に移動することを確認し、この輸送が阻害される突然変異体のスクリーニングを進めている。変異体候補が得られ始めている。茎頂におけるフロリゲン複合体形成に関しては、パートナーであるbZIP転写因子FDのリン酸化を実証し、当該キナーゼを同定した。複合体形成を仲介する14-3-3蛋白質については、FT遺伝子の発現制御とフロリゲン複合体形成の両面から慎重に解析を進めている。栄養・代謝と花成制御に関しては、無機栄養環境によるFT遺伝子の発現制御を介した花成調節という未開拓の研究課題に着手した。
研究項目2
環境要因に応答した生殖器官の形成誘導に関しては、SPL転写因子のひとつMpSPL1が分枝の生殖枝への分化を調節していることを明らかにした。生殖器官分化・配偶子形成に関しては、造精器のトランスクリプトーム解析とメタボローム解析を継続した。前者では16個の造精器特異的な転写因子を見いだし、遺伝子破壊株の作出と表現型解析を進めている。精細胞分化の鍵となる制御因子の候補などが得られている。遺伝子発現パターンの解析系を確立し、発現パターンのカタログ化や発現制御関係の解析に着手した。以上の概要まとめた論文の投稿準備がほぼ整った。一方、メタボローム解析では、昨年度に得たデータの解析をおこない、一次代謝などについて興味深い知見が得られた。受精と初期胚発生に関しては、転写因子LFYが接合子(受精卵)の最初の分裂に必須ではないことが明らかになった。胚発生過程の記載的な解析を進めており、第一分裂の時期や分裂面の位置について興味深い知見を得た。

Current Status of Research Progress
Current Status of Research Progress

2: Research has progressed on the whole more than it was originally planned.

Reason

研究項目1(シロイヌナズナ・花成)では、今年度の優先課題であったFT蛋白質の輸送に関して、これまでの成果のまとめと、輸送に関わる因子を同定するための系の確立ができた。後者に関しては、突然変異体の候補が得られつつあり、概ね順調に進んでいる。FT蛋白質の輸送と糖転流の関連に関しては、昨年度の知見をもとにnakr1変異体の解析を進めたが、糖転流を介した輸送への関わりよりも、無機栄養環境を介したFT遺伝子の発現制御への関わりが重要であると考えるにいたった。無機栄養環境による花成調節は未開拓の課題であることを考え、この観点から、改めて研究を継続することにした。研究内容の部分的な変更はあったが、栄養・代謝と花成という枠組みの中で興味深い課題を見いだせたと考えている。また、フロリゲン複合体形成に関わる因子に関する成果公表もできた。
研究項目2(ゼニゴケ・有性生殖)では、今年度は、造精器分化と精子形成、受精後の胚発生の2つに関して、研究が進んでいる他の生物と対比して、ゼニゴケ(基部陸上職物)における発生ロジックを明らかにすることを主眼に研究を進めた。成果公表にまではこぎ着けなかったが、どちらに関しても順調に進んでいる。造精器分化と精子形成に関しては、トランスクリプトーム解析により、これらの過程の大まかな枠組みの記述が可能になるとともに、今後の研究の展開のための萌芽を多数得ることできた。トランスクリプトーム解析により同定した転写因子遺伝子には、精細胞分化の鍵因子候補もあり、国際的な共同研究により研究を進めることになった。受精後の胚発生に関しては、研究が先行しているヒメツリガネゴケ(蘚類)との相違も含めて、基部陸上植物ゼニゴケ(苔類)における発生ロジックを明らかにできるという手応えを得つつある。
これらを総合的に評価して「概ね順調に進展している」と自己評価した。

Strategy for Future Research Activity

研究項目1(シロイヌナズナ・花成)では、これまでの研究で確立した輸送に関わる因子を同定するための系(proSUC2:FT-EGFP; ft形質転換体におけるGFP蛍光の様態と花成表現型を指標にしたスクリーニング)を、優先課題として進め、輸送に関わる因子の変異体の単離と遺伝子同定のための解析の完了を目指す。並行して、nakr1変異体と水耕栽培を用いた解析系により、無機栄養環境による花成制御機構の研究を進める。これらの進展を見ながら、可能であればC/Nバランスによる花成制御の解析・評価系の構築に着手する。
研究項目2(ゼニゴケ・有性生殖)については、これまでの研究を継続し発展させる。造精器分化と精子形成に関しては、解析が進んでいる転写因子を優先して研究を進める。特に国際共同研究により進めている精細胞分化の鍵因子候補については、早期の成果公表を目指して研究を加速したい。また、メタボローム解析では、細胞増殖と代謝という観点から、呼吸やアミノ酸代謝に関して得た興味深い予備的な知見の検証を優先課題として研究を進める。これらと並行して、発生途上の造精器の培養系の確立も試みたい。受精後の胚発生に関しては、これまでほとんど得られていない初期発生過程に関する知見を得るための記載的な研究を進める。未受精卵と受精卵をそれぞれ含む造卵器のトランスクリプトーム解析をおこなう。また、可能であれば、培養系の確立や、研究領域内の共同研究によって初期胚発生過程の1細胞解析にも挑みたいと考えている。

Remarks

(2)は、「分子代謝制御学分野」を選ぶと5分あまりの研究紹介動画を見ることができる。

  • Research Products

    (23 results)

All 2015 2014 Other

All Journal Article (3 results) (of which Peer Reviewed: 3 results,  Open Access: 1 results,  Acknowledgement Compliant: 1 results) Presentation (17 results) (of which Invited: 3 results) Book (1 results) Remarks (2 results)

  • [Journal Article] Calcium-dependent protein kinases responsible for the phosphorylation of a bZIP transcription factor FD crucial for the florigen complex formation2015

    • Author(s)
      Kawamoto, N., Sasabe, M., Endo, M., Machida, Y., and Araki, T.
    • Journal Title

      Scientific Reports

      Volume: 5 Pages: 8341

    • DOI

      10.1038/srep08341

    • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
  • [Journal Article] Tissue-specific clocks in Arabidopsis show asymmetric coupling2014

    • Author(s)
      Endo, M., Shimizu, H., Nohales, M.A., Araki, T., and Kay, S.A.
    • Journal Title

      Nature

      Volume: 515 Pages: 419-422

    • DOI

      10.1038/nature13919

    • Peer Reviewed
  • [Journal Article] シロイヌナズナとゼニゴケにおける概日時計と光周性2014

    • Author(s)
      遠藤 求, 久保田 茜, 河内孝之, 荒木 崇
    • Journal Title

      植物の生長調節

      Volume: 49 Pages: 49-58

    • Peer Reviewed
  • [Presentation] Search for the regulators of early sporophyte development in Marchantia polymorpha(日本語)2015

    • Author(s)
      丹羽優喜, 酒井友希, 肥後あすか, 遠藤 求, 山口礼子, 石崎公庸, 大和勝幸, 西浜竜一, 石田喬志, 澤進一郎, 河内孝之, 荒木 崇
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学 世田谷キャンパス(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] シロイヌナズナ FT タンパク質の輸送機構の解析2015

    • Author(s)
      堀川工望, 佐々木陽平, 遠藤 求, 荒木 崇
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学 世田谷キャンパス(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] 花成制御における NaKR1 の役割解析2015

    • Author(s)
      根岸克弥, 遠藤 求, 荒木 崇
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学 世田谷キャンパス(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] 苔類ゼニゴケの雄性配偶子形成過程を制御する分子機構の解析2015

    • Author(s)
      肥後あすか, 丹羽優喜, 大和勝幸, 坂本智昭, 倉田哲也, 白川 一, 重信秀治, 石崎公庸, 西浜竜一, 河内孝之, 荒木 崇
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学 世田谷キャンパス(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] カルシウム依存性タンパク質キナーゼCPK33はFDをリン酸化しフロリゲン複合体形成を制御する(ポスター発表)2015

    • Author(s)
      川本 望, 笹部美知子, 遠藤 求, 町田泰則, 荒木 崇
    • Organizer
      第56回日本植物生理学会年会
    • Place of Presentation
      東京農業大学 世田谷キャンパス(東京都世田谷区)
    • Year and Date
      2015-03-16 – 2015-03-18
  • [Presentation] Exploring the sexual reproduction processes in Marchantia polymorpha2014

    • Author(s)
      荒木 崇
    • Organizer
      Marchantia Workshop 2014
    • Place of Presentation
      神戸大学(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2014-12-08 – 2014-12-10
    • Invited
  • [Presentation] Phenotypic analyses of MpLFY knockout plants2014

    • Author(s)
      丹羽優喜, 酒井友希, 肥後あすか, 遠藤 求, 山口礼子, 石崎公庸, 大和勝幸, 西浜竜一, 河内孝之, 荒木 崇
    • Organizer
      Marchantia Workshop 2014
    • Place of Presentation
      神戸大学(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2014-12-08 – 2014-12-10
  • [Presentation] Toward understanding of the molecular mechanism regulating the formation of the male gametophyte(ポスター発表)2014

    • Author(s)
      肥後あすか, 丹羽優喜, 遠藤 求, 石崎公庸, 大和勝幸, 西浜竜一, 河内孝之, 荒木 崇
    • Organizer
      Marchantia Workshop 2014
    • Place of Presentation
      神戸大学(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2014-12-08 – 2014-12-10
  • [Presentation] Functional analysis of SBP-box transcription factors in Marchantia polymorpha(ポスター発表)2014

    • Author(s)
      大神貴史, 山口礼子, 丹羽優喜, 遠藤 求, 石崎公庸, 河内孝之, 荒木 崇
    • Organizer
      Marchantia Workshop 2014
    • Place of Presentation
      神戸大学(兵庫県神戸市)
    • Year and Date
      2014-12-08 – 2014-12-10
  • [Presentation] シロイヌナズナにおける概日時計機能の組織特異性2014

    • Author(s)
      遠藤 求, 清水華子, 荒木 崇, Nohales Maria, Steve A. Kay
    • Organizer
      第21回日本時間生物学会学術大会
    • Place of Presentation
      九州大学医学部百年講堂(福岡県福岡市東区)
    • Year and Date
      2014-11-08 – 2014-11-09
    • Invited
  • [Presentation] ゼニゴケの接合子におけるMpLFYの機能解析2014

    • Author(s)
      丹羽優喜, 酒井友希, 肥後あすか, 遠藤 求, 山口礼子, 石崎公庸, 大和勝幸, 西浜竜一, 河内孝之, 荒木 崇
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学 生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] シロイヌナズナの維管束における概日時計の機能解析2014

    • Author(s)
      遠藤 求, 清水華子, Steve A. Kay, 荒木 崇
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学 生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] 組織特異的に概日時計機能を阻害した系統における表現型解析2014

    • Author(s)
      清水華子, 片山可奈, 古藤知子, 荒木 崇, 遠藤 求
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学 生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] フロリゲン複合体形成を制御するタンパク質キナーゼの同定(ポスター発表)2014

    • Author(s)
      川本 望, 笹部美知子, 遠藤 求, 町田泰則, 荒木 崇
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学 生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] 苔類ゼニゴケの造精器および精子の発生過程に関与する遺伝子発現プログラムを制御する機構の解析(ポスター発表)2014

    • Author(s)
      肥後あすか, 丹羽優喜, 遠藤 求, 石崎公庸, 大和勝幸, 西浜竜一, 河内孝之, 荒木 崇
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学 生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] 苔類ゼニゴケにおけるSBP型転写因子の機能解析(ポスター発表)2014

    • Author(s)
      大神貴史, 山口礼子, 丹羽優喜, 遠藤 求, 石崎公庸, 河内孝之, 荒木 崇
    • Organizer
      日本植物学会第78回大会
    • Place of Presentation
      明治大学 生田キャンパス(神奈川県川崎市)
    • Year and Date
      2014-09-12 – 2014-09-14
  • [Presentation] Exploring the plant reproductive process using Arabidopsis and Marchantia2014

    • Author(s)
      荒木 崇
    • Organizer
      第47回発生生物学会大会
    • Place of Presentation
      ウィンク愛知(愛知県名古屋市)
    • Year and Date
      2014-05-27 – 2014-05-30
    • Invited
  • [Book] 改訂版 植物の科学2015

    • Author(s)
      塚谷裕一, 荒木 崇
    • Total Pages
      289
    • Publisher
      放送大学教育振興会
  • [Remarks] 京都大学生命科学研究科統合生命科学専攻分子代謝制御学分野HP

    • URL

      http://www.lif.kyoto-u.ac.jp/labs/plantdevbio/index.html

  • [Remarks] 京都大学生命科学研究科映像アーカイブ

    • URL

      http://www.lif.kyoto-u.ac.jp/j/?page_id=30

URL: 

Published: 2016-06-01  

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