再構成ヌクレオソームを用いた動的クロマチン構造の解明

2014 Fiscal Year Annual Research Report

• Project Area: Dynamic chromatin structure and function
• Project/Area Number: 25116002
• Research Institution: Waseda University
• Principal Investigator: 胡桃坂 仁志 早稲田大学, 理工学術院, 教授 (80300870)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 堀 哲也 国立遺伝学研究所, 大学共同利用機関等の部局等, 助教 (70550078)
• Project Period (FY): 2013-06-28 – 2018-03-31
• Keywords: ゲノム多様性 / ゲノム進化・再編 / 遺伝情報複製・再編 / ゲノム機能 / 活性発現の分子機構 / 染色体構築・機能・分配 / 生体高分子構造・機能 / 構造活性相関

Outline of Annual Research Achievements

動的クロマチン構造の実体の解明を目指して、構造生物学、計算科学、生化学、細胞生物学的研究を推進した。本年度は、クロマチンの基本構成ユニットであるヌクレオソームを試験管内で再構成し、その構造および動的性質を、構造生物学的、生化学的、および細胞生物学的手法によって解析した。まず、ある種のがん細胞において形成されるCENP-AとH3.3を1分子ずつヘテロに含むヌクレオソーム（CENP-A/H3.3ヌクレオソーム）の構造と形成メカニズムを明らかにするため、X線結晶構造解析などの構造生物学的解析、および生化学的解析を行った。まず、精製タンパク質を用いて、CENP-A/H3.3ヌクレオソームを高純度で調製することに成功した。そして、CENP-A/H3.3ヌクレオソームは、CENP-Aホモヌクレオソームよりも著しく安定であることを見いだした。また、X線結晶構造解析によって、CENP-A/H3.3ヌクレオソームの詳細な立体構造を解明した。これらのことから、がんの悪性化に寄与するヌクレオソームの構造生物学的および生化学的特徴についての詳細が明らかになった。さらにH2A.Bバリアントを含むヌクレオソームの構造と機能の解析を行うために、コントラスト変調中性子小角散乱法によりヌクレオソーム中のヒストン(またはDNA)のみの構造を観察し、ヒストンH2A.Bを含むヌクレオソームが通常型のヌクレオソームと比較して、ヒストンテールの配置が異なることを見出した。
また分担者堀は、CENP-Aを基点としたセントロメア形成のメカニズムを明らかにするため、染色体工学技術を用いた細胞生物学的な解析を行った。その結果、CENP-Aヌクレオソーム中のH4K20はモノメチル化されており、そのメチル化がCENP-Aを中心としたセントロメアクロマチン構造の形成に必須であることを解明した。

Current Status of Research Progress

1: Research has progressed more than it was originally planned.

Reason

ヌクレオソームレベルでのクロマチンの動的な構造変化を解析するために、CENP-A/H3.3ヌクレオソームおよびH2A.Bヌクレオソームの再構成を行い、それらの構造解析および生化学的解析を行うことに成功した。特に、本研究で開発したコントラスト変調中性子小角散乱法によるヌクレオソーム中のヒストン(またはDNA)のみの構造を溶液中で測定する方法は、今後のクロマチン動的構造研究に利用出来る重要な手法となる。さらに、生化学的および細胞生物学的な解析から、CENP-Aを基点としたセントロメア特異的クロマチン構造形成のメカニズムの解明に重要な知見を得ることもできた。これらの成果は当初の計画を大きく上回っており、本年度は計画以上に研究が進展したと考えられる。

Strategy for Future Research Activity

本年度の研究によって、今後のクロマチン動構造研究を遂行する上で重要な技術を確立することに成功した。特に、ヒストンH3バリアントを1分子ずつヘテロに含むヌクレオソームの再構成する技術は、ヒストンH2Aバリアントを1分子ずつヘテロに含むヌクレオソームの解析に直接応用出来る。さらに、コントラスト変調中性子小角散乱法は、X線結晶構造解析では不可能であったフレキシブルなヒストンテール領域の解析を可能とし、多様なヒストンバリアントを含むヌクレオソームの動的性質の解析に応用することができる。今後は、これらの技術を用いて、多様なヒストンバリアントの解析へと研究を発展させる。また、高次のクロマチンを再構成して、それらの構造と機能の解析を行う。

Research Products

• [Journal Article] Charge-neutralization effect of the tail regions on the histone H2A/H2B dimer structure. (2015)
  • Author(s): Saikusa, K., Shimoyama, S., Asano, Y., Nagadoi, A., Sato, M., Kurumizaka, H., Nishimura, Y., and Akashi, S.
  • Journal Title: Protein Science Volume: - Pages: -
  • DOI: 10.1002/pro.2673
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Two arginine residues suppress the flexibility of nucleosomal DNA in the canonical nucleosome core. (2015)
  • Author(s): Kono, H., Shirayama, K., Arimura, Y., Tachiwana, H., and Kurumizaka, H.
  • Journal Title: PLoS ONE Volume: 10 Pages: e0120635
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0120635.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Human tNASP promotes in vitro nucleosome assembly with histone H3.3. (2015)
  • Author(s): Kato, D., Osakabe, A., Tachiwana, H., Tanaka, H., and Kurumizaka, H.
  • Journal Title: Biochemistry Volume: 54 Pages: 1171-1179
  • DOI: 10.1021/bi501307g
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Mass spectrometric approach for characterizing the disordered tail regions of the histone H2A/H2B dimer. (2015)
  • Author(s): Saikusa, K., Nagadoi, A., Hara, K., Fuchigami, S., Kurumizaka, H., Nishimura, Y., and Akashi, S.
  • Journal Title: Anal. Chem. Volume: 87 Pages: 2220-2227
  • DOI: 10.1021/ac503689w
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Green fluorescent protein fused to the C-terminal end of RAD51 specifically interferes with secondary DNA binding by the RAD51-ssDNA complex. (2014)
  • Author(s): Kobayashi, W., Sekine, S., Machida, S., and Kurumizaka, H.
  • Journal Title: Genes Genet. Syst. Volume: 89 Pages: 169-179
  • DOI: 10.1266/ggs.89.169
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Defective FANCI binding by a Fanconi anemia-related FANCD2 mutant. (2014)
  • Author(s): Sato, K., Ishiai, M., Takata, M., and Kurumizaka, H.
  • Journal Title: PLoS ONE Volume: 9 Pages: e114752
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0114752
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Crystal structure and stable property of the cancer-associated heterotypic nucleosome containing CENP-A and H3.3. (2014)
  • Author(s): Arimura, Y., Shirayama, K., Horikoshi, N., Fujita, R., Taguchi, H., Kagawa, W., Fukagawa, T., Almouzni, G., and Kurumizaka, H.
  • Journal Title: Scientific Rep. Volume: 4 Pages: 7115
  • DOI: 10.1038/srep07115
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] A method for evaluating nucleosome stability with a protein-binding fluorescent dye. (2014)
  • Author(s): Taguchi, H., Horikoshi, N., Arimura, Y., and Kurumizaka, H.
  • Journal Title: Methods Volume: 70 Pages: 119-126
  • DOI: 10.1016/j.ymeth.2014.08.019
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] N-terminal phosphorylation of HP1α increases its nucleosome-binding specificity. (2014)
  • Author(s): Nishibuchi, G., Machida, S., Osakabe, A., Murakoshi, H., Hiragami-Hamada, K., Nakagawa, R., Fischle, W., Nishimura, Y., Kurumizaka, H., Tagami, H., and Nakayama, J.
  • Journal Title: Nucleic Acids Res. Volume: 42 Pages: 12498-12511
  • DOI: 10.1093/nar/gku995.
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] DNA binding properties of the actin-related protein Arp8 and its role in DNA repair. (2014)
  • Author(s): Osakabe, A., Takahashi, Y., Murakami, H., Otawa, K., Tachiwana, H., Oma, Y., Nishijima, H., Shibahara, KI., Kurumizaka, H., and Harata, M.
  • Journal Title: PLoS ONE Volume: 9 Pages: e108354
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0108354
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Expression and purification of human FANCI and FANCD2 using Escherichia coli cells. (2014)
  • Author(s): Takahashi, D., Sato, K., Shimomuki, M., Takata, M., and Kurumizaka, H.
  • Journal Title: Prot. Exp. Purif. Volume: 103 Pages: 8-15
  • DOI: 10.1016/j.pep.2014.08.012
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Evaluation of chemical fluorescent dyes as a protein conjugation partner for live cell imaging. (2014)
  • Author(s): Hayashi-Takanaka, Y., Stasevich, T.J., Kurumizaka, H., Nozaki, N., and Kimura, H.
  • Journal Title: PLoS ONE Volume: 9 Pages: e106271
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0106271
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Nap1 stimulates homologous recombination by RAD51 and RAD54 in higher-ordered chromatin containing histone H1. (2014)
  • Author(s): Machida, S., Takaku, M., Ikura, M., Sun, J., Suzuki, H., Kobayashi, W., Kinomura, A., Osakabe, A., Tachiwana, H., Horikoshi, Y., Fukuto, A., Matsuda, R., Ura, K., Tashiro, S., Ikura, T., and Kurumizaka, H.
  • Journal Title: Scientific Rep. Volume: 4 Pages: 4863
  • DOI: 10.1038/srep04863
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Journal Article] Distinct features of the histone core structure in nucleosomes containing the histone H2A.B variant. (2014)
  • Author(s): Sugiyama, M. Arimura, Y., Shirayama, K., Fujita, R., Oba, Y., Sato, N., Inoue, R., Oda, T., Sato, M., Heenan, R.K., and Kurumizaka, H.
  • Journal Title: Biophys. J. Volume: 106 Pages: 2206–2213
  • DOI: 10.1016/j.bpj.2014.04.007
  • Peer Reviewed / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] FANCD2 associated with chromatin anchors CtIP and regulates DNA end resection during DNA interstrand crosslink repair. (2014)
  • Author(s): Unno, J., Itaya, A., Taoka, M., Sato, K., Tomida, J., Sakai, W., Sugasawa, K., Ishiai, M., Ikura, T., Isobe, T., Kurumizaka, H., and Takata, M.
  • Journal Title: Cell Rep. Volume: 7 Pages: 1039-1047
  • DOI: 10.1016/j.celrep.2014.04.005
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] Crystal structure of human nucleosome containing the testis-specific histone variant TSH2B. (2014)
  • Author(s): Urahama, T., Horikoshi, N., Osakabe, A., Tachiwana, H., and Kurumizaka, H.
  • Journal Title: Acta Cryst. Volume: F70 Pages: 444–449
  • DOI: 10.1107/S2053230X14004695
  • Peer Reviewed / Open Access / Acknowledgement Compliant
• [Journal Article] Histone H4 Lys 20 monomethylation of the CENP-A nucleosome is essential for kinetochore assembly. (2014)
  • Author(s): Hori, T., Shang, W.H., Toyoda, A., Misu, S., Monma, N., Ikeo, K., Molina, O., Vargiu, G., Fujiyama, A., Kimura, H., Earnshaw, W.C., Fukagawa, T.
  • Journal Title: Dev Cell Volume: 29 Pages: 740-749
  • DOI: 10.1016/j.devcel.2014.05.001
  • Peer Reviewed
• [Journal Article] The CENP-O complex requirement varies among different cell types. (2014)
  • Author(s): Kagawa, N., Hori, T., Hoki, Y., Hosoya, O., Tsutsui, K., Saga, Y., Sado, T., Fukagawa, T.
  • Journal Title: Chromosome Res. Volume: 22 Pages: 293-303
  • DOI: 10.1007/s10577-014-9404-1
  • Peer Reviewed / Open Access
• [Presentation] 原子レベルで見る生命の設計図 (2015)
  • Author(s): 胡桃坂仁志
  • Organizer: 一般公開シンポジウム第2弾「生き物と細胞の設計図～DNA・クロマチン・核」
  • Place of Presentation: 千里ライフサイエンスセンター
  • Year and Date: 2015-01-12 – 2015-01-12
• [Presentation] Structural and functional studies of various nucleosomes as fundamental building blocks for Chromatin (2014)
  • Author(s): Kurumizaka, H.
  • Organizer: The 4D Nucleosome 2014
  • Place of Presentation: 安芸グランドホテル
  • Year and Date: 2014-12-17 – 2014-12-20
• [Presentation] Structural basis of the nucleosomes in the transcription start site (2014)
  • Author(s): Naoki Horikoshi, Koichi Sato, Yasuhiro Arimura, Hiroyuki Taguchi, Masahiko Harata, Hiroshi Kimura, Hitoshi Kurumizaka
  • Organizer: The 4D Nucleome 2014
  • Place of Presentation: 広島
  • Year and Date: 2014-12-17 – 2014-12-20
• [Presentation] ヌクレオソームの安定性におけるH3 K122のクロトニル化の影響 (2014)
  • Author(s): 鈴木佑弥. 堀越直樹. 胡桃坂仁志
  • Organizer: 32回染色体ワークショップ、13回核ダイナミックス
  • Place of Presentation: 広島県廿日市市
  • Year and Date: 2014-12-15 – 2014-12-17
• [Presentation] ヒストンシャペロンtNASPはヒストンH3.3特異的にヌクレオソームの形成を触媒する (2014)
  • Author(s): 加藤大貴,越阪部晃永,立和名博昭,胡桃坂仁志
  • Organizer: 32回染色体ワークショップ、13回核ダイナミックス
  • Place of Presentation: 広島県廿日市市
  • Year and Date: 2014-12-15 – 2014-12-17
• [Presentation] 新規マウスヒストンH3バリアントを含むヌクレオソームの構造安定性と機能解析 (2014)
  • Author(s): 田口裕之, 堀越直樹, 謝炎, 鯨井智也, 有村泰宏, 越阪部晃永, 前原一満, 木村宏, 大川恭行, 胡桃坂仁志
  • Organizer: 第32回染色体ワークショップ・第13回核ダイナミクス研究会
  • Place of Presentation: 広島県廿日市市
  • Year and Date: 2014-12-15 – 2014-12-17
• [Presentation] CENP-A ヌクレオソームのフレキシブルな DNA 末端はセントロメアタンパク質 CENP-B の結合を安定化する (2014)
  • Author(s): 藤田 理紗, 大竹 興一郎, 有村 泰宏, 堀越 直樹, 宮 優太, 志賀 達哉, 越阪部 晃永, 立和名 博昭, 大関 淳一郎, 舛本 寛, 胡桃坂 仁志
  • Organizer: 第32回染色体ワークショップ
  • Place of Presentation: 広島県廿日市市
  • Year and Date: 2014-12-15 – 2014-12-17
• [Presentation] 転写開始点近傍に形成される多様なヌクレオソームのX線結晶構造解析 (2014)
  • Author(s): 堀越直樹, 佐藤浩一, 有村泰宏, 田口裕之, 原田昌彦, 木村宏, 胡桃坂仁志
  • Organizer: 第32回染色体ワークショップ 第13回核ダイナミクス研究会
  • Place of Presentation: 広島
  • Year and Date: 2014-12-15 – 2014-12-17
• [Presentation] ヒストンH3.YのC末端領域は安定なヌクレオソーム形成に重要である (2014)
  • Author(s): 鯨井智也、堀越直樹、佐藤浩一、前原一満、越阪部晃永、町田晋一、田口裕之、立和名博昭、大川恭行、木村宏、胡桃坂仁志
  • Organizer: 第32回染色体ワークショップ 第13回核ダイナミクス研究会
  • Place of Presentation: 広島 廿日市市
  • Year and Date: 2014-12-15 – 2014-12-17
• [Presentation] クロマチンのエピジェネティック制御と創薬 (2014)
  • Author(s): 胡桃坂仁志
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: パシフィコ横浜
  • Year and Date: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [Presentation] マウス精巣特異的な発現を示すヒストンバリアントH3mmTを含むヌクレオソームの構造解析および生化学的解析 (2014)
  • Author(s): 浦浜 嵩、堀越 直樹、田口 裕之、鈴木 佑弥、越阪部 晃永、木村 宏、大川 恭行、胡桃坂 仁志
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [Presentation] CENP-Aヌクレオソーム特異的DNA構造のセントロメアタンパク質CENP-B結合への影響 (2014)
  • Author(s): 藤田 理紗、宮 優太、志賀 達哉、有村 泰宏、越阪部 晃永、立和名 博昭、胡桃坂 仁志
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [Presentation] クロトニル化ヒストンH3を含むヌクレオソームの安定性解析 (2014)
  • Author(s): 鈴木 佑弥、堀越 直樹、胡桃坂 仁志
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [Presentation] ヒストンコア領域におけるメチル化がヌクレオソーム構造に及ぼす影響 (2014)
  • Author(s): 村越 大夢、町田 晋一、堀越 直樹、有村 泰宏、胡桃坂 仁志
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [Presentation] モノユビキチン化ヒストンを含むヌクレオソームの解析 (2014)
  • Author(s): 西山 友貴、町田 晋一、有村 泰宏、堀越 直樹、小林 航、胡桃坂 仁志
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [Presentation] 霊長類特異的ヒストンバリアントH3.Yを含むヌクレオソームの機能解析 (2014)
  • Author(s): 鯨井 智也、堀越 直樹、佐藤 浩一、前原 一満、越阪部 晃永、町田 晋一、田口 裕之、立和名 博昭、大川 恭行、木村 宏、胡桃坂 仁志
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [Presentation] ヒストンシャペロンNASPアイソフォーム、testicular NASP (tNASP)の生化学的解析 (2014)
  • Author(s): 加藤 大貴、越阪部 晃永、胡桃坂 仁志
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [Presentation] マウス特異的ヒストンバリアントH3mm7を含むヌクレオソームの構造生物学的解析及び生化学的解析 (2014)
  • Author(s): 田口 裕之、堀越 直樹、謝 炎、鯨井 智也、有村 泰宏、越阪部 晃永、前原 一満、木村 宏、大川 恭行、胡桃坂 仁志
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [Presentation] Overlapping di-nucleosomeの再構成および生化学・構造生物学的解析 (2014)
  • Author(s): 足立 風水也、越阪部 晃永、有村 泰宏、加藤 大貴、七種 和美、明石 知子、西村 善文、杉山 正明、胡桃坂 仁志
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [Presentation] ヌクレオソームにおける紫外線損傷塩基の収納およびその認識機構の解析 (2014)
  • Author(s): 越阪部 晃永、立和名 博昭、堀越 直樹、香川 亘、山元 淳平、安田 武嗣、花岡 文雄、菅澤 薫、岩井 成憲、胡桃坂 仁志
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [Presentation] DNA損傷修復におけるアクチンファミリーArp8の機能解析 (2014)
  • Author(s): 村上 寛和、高橋 裕一朗、越阪部 晃永、胡桃坂 仁志、原田 昌彦
  • Organizer: 第37回日本分子生物学会年会
  • Place of Presentation: 横浜
  • Year and Date: 2014-11-25 – 2014-11-27
• [Presentation] Biochemical studies for homologous recombination reaction in chromatin (2014)
  • Author(s): Kurumizaka, H.
  • Organizer: The 9th 3R Symposium
  • Place of Presentation: 御殿場高原ホテル時之栖
  • Year and Date: 2014-11-17 – 2014-11-21
• [Presentation] Structures of the nucleosomes containing UV-damaged DNA bases and the damaged base recognition mechanism by DNA repair proteins (2014)
  • Author(s): Akihisa Osakabe, Hiroaki Tachiwana, Naoki Horikoshi, Wataru Kagawa, Junpei Yamamoto, Takeshi Yasuda, Fumio Hanaoka, Kaoru Sugasawa, Shigenori Iwai, Hitoshi Kurumizaka
  • Organizer: US-Japan DNA Repair Meeting
  • Place of Presentation: 徳島
  • Year and Date: 2014-10-28 – 2014-10-31
• [Presentation] ヒストンバリアントによるヌクレオソーム構造とダイナミクス制御 (2014)
  • Author(s): 胡桃坂仁志
  • Organizer: 第87回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 国立京都国際会館
  • Year and Date: 2014-10-15 – 2014-10-18
• [Presentation] Structural diversity of H2A.Z nucleosomes at the transcription start site (2014)
  • Author(s): 堀越 直樹, 佐藤 浩一, 島田 桂丞, 有村 泰宏, 越阪部 晃永, 田口 裕之, 立和名 博昭, 林－高中 陽子, 岩崎 わかな, 香川 亘, 原田 昌彦, 木村 宏, 胡桃坂 仁志
  • Organizer: 第87回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 2014-10-15 – 2014-10-18
• [Presentation] がん化の進行に関わる、ヒストンバリアントCENP-A、H3.3を1分子ずつ含むヌクレオソームの構造生物学解析 (2014)
  • Author(s): 有村 泰宏, 白山 一義, 堀越 直樹, 藤田 理紗, 田口 裕之, 香川 亘, 胡桃坂 仁志
  • Organizer: 第87回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 2014-10-15 – 2014-10-18
• [Presentation] 西淵 剛平, 町田 晋一, 越阪部 晃永, 村越 大夢, 浜田 京子, 中川 れい子, Fischle Wolfgang, 胡桃坂 仁志, 田上 英明, 中山 潤一 (2014)
  • Author(s): HP1のリン酸化はH3K9me3 nucleosomeに対する結合特異性を制御している
  • Organizer: 第87回日本生化学会大会
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 2014-10-15 – 2014-10-17
• [Presentation] クロマチン動構造とヒストンバリアント (2014)
  • Author(s): 胡桃坂仁志
  • Organizer: 第52回日本生物物理学会年会
  • Place of Presentation: 札幌コンベンションセンター
  • Year and Date: 2014-09-25 – 2014-09-27
• [Presentation] クロマチン構造とダイナミクスの多様性による遺伝子のエピジェネティクス制御機構 (2014)
  • Author(s): 胡桃坂仁志
  • Organizer: 第26回高遠・分子細胞生物学シンポジウム
  • Place of Presentation: 高遠さくらホテル 長野
  • Year and Date: 2014-08-28 – 2014-08-29
  • Invited
• [Presentation] がんに関わるヌクレオソームの生化学的・構造生物学的解析 (2014)
  • Author(s): 有村泰宏, 白山一義, 野田真美子, 藤田理紗, 堀越直樹, 胡桃坂仁志
  • Organizer: 第26回高遠分子細胞生物学シンポジウム
  • Place of Presentation: 長野県伊那市高遠町
  • Year and Date: 2014-08-28 – 2014-08-29
• [Presentation] BIOCHEMICAL ANALYSES OF RICE DNA RECOMBINASES RAD51 AND DMC1 (2014)
  • Author(s): Kurumizaka, H.
  • Organizer: Plant Genome Stability and Change 2014
  • Place of Presentation: アシロマカンファレンスセンター アメリカ
  • Year and Date: 2014-07-17 – 2014-07-19
• [Presentation] 再構成ヌクレオソームを用いた動的クロマチン構造の解明 (2014)
  • Author(s): 胡桃坂仁志
  • Organizer: 「動的クロマチン構造と機能」第2回班会議
  • Place of Presentation: サホロリゾート 北海道
  • Year and Date: 2014-07-02 – 2014-07-05
• [Presentation] ヌクレオソーム構造におけるメチル化DNA の寄与 (2014)
  • Author(s): 越阪部晃永、有村泰宏、足立風水也、堀越直樹、大川恭行、胡桃坂仁志
  • Organizer: クロマチン動構造 若手交流ワークショップ
  • Place of Presentation: 北海道
  • Year and Date: 2014-07-02 – 2014-07-03
• [Presentation] クロマチンの動態構造とDNA機能発現機構 (2014)
  • Author(s): 胡桃坂仁志
  • Organizer: 第14回日本蛋白質科学会年会
  • Place of Presentation: ワークピア横浜 横浜産貿ホールマリネリア
  • Year and Date: 2014-06-25 – 2014-06-27
• [Presentation] Biochemical and structural analyses of the nucleosome containing methylated DNA (2014)
  • Author(s): Akihisa Osakabe, Fumiya Adachi, Yasuhiro Arimura, Naoki Horikoshi, Yasuyuki Ohkawa, Hitoshi Kurumizaka
  • Organizer: EMBO Workshop Histone variants
  • Place of Presentation: ドイツ、ストラスブール
  • Year and Date: 2014-06-02 – 2014-06-07
• [Presentation] Preparation and analysis of the heterotypic nucleosome with CENP-A and H3.3 (2014)
  • Author(s): Yasuhiro Arimura, Kazuyoshi Shirayama, Naoki Horikoshi, Risa Fujita, Hiroyuki Taguchi, Wataru Kagawa and Hitoshi Kurumizaka
  • Organizer: EMBO Workshop on Histone Variants
  • Place of Presentation: Strasbourg, France
  • Year and Date: 2014-06-02 – 2014-06-07
• [Presentation] Structures and physical properties of nucleosome isoforms with histone variants (2014)
  • Author(s): Kurumizaka, H.
  • Organizer: EMBO meeting on Histone Variants
  • Place of Presentation: igbmc（フランス国立科学研究センター）
  • Year and Date: 2014-06-02 – 2014-06-04
• [Presentation] Structural basis and biological significance of nucleosomes containing human H2A.Z (2014)
  • Author(s): Naoki Horikoshi, Koichi Sato, Yasuhiro Arimura, Akihisa Osakabe, Hiroaki Tachiwana, Yoko Hayashi-Takanaka, Wakana Iwasaki, Masahiko Harata, Hiroshi Kimura, Hitoshi Kurumizaka
  • Organizer: EMBO Workshop Histone variants
  • Place of Presentation: Strasbourg, France
  • Year and Date: 2014-06-02 – 2014-06-04
• [Presentation] エピジェネティクスにおけるヒストンバリアントの役割 (2014)
  • Author(s): 胡桃坂仁志
  • Organizer: 第８回日本エピジェネティクス研究会年会
  • Place of Presentation: 東大・伊藤国際学術研究センター
  • Year and Date: 2014-05-25 – 2014-05-27
• [Presentation] メチル化DNAを含むヌクレオソームの生化学的・構造生物学的機能解析 (2014)
  • Author(s): 越阪部晃永, 足立風水也, 有村泰宏, 堀越直樹, 大川恭行, 胡桃坂仁志
  • Organizer: 第8回日本エピジェネティクス研究会年会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2014-05-25 – 2014-05-27
• [Presentation] Functional analysis of the nucleosome containing the primate specific histone variant, H3.Y (2014)
  • Author(s): 鯨井智也、堀越直樹、佐藤浩一、前原一満、越阪部晃永、田口裕之、立和名博昭、大川恭行、木村宏、胡桃坂仁志
  • Organizer: 第8回エピジェネティクス研究会年会
  • Place of Presentation: 東京
  • Year and Date: 2014-05-25 – 2014-05-27
• [Presentation] Structural and functional analysese of nucleosomes containing human H2A.Z (2014)
  • Author(s): Naoki Horikoshi, Koichi Sato, Keisuke Shimada, Yasuhiro Arimura, Akihisa Osakabe, Hiroyuki Taguchi, Hiroaki Tachiwana, Yoko Hayashi-Takanaka, Wakana Iwasaki, Wataru Kagawa, Masahiko Harata, Hiroshi Kimura, Hitoshi Kurumizaka
  • Organizer: IIAS Research Conference 2014 Chromatin Decoding
  • Place of Presentation: 京都
  • Year and Date: 2014-05-12 – 2014-05-17
• [Presentation] Structure and dynamics of the nucleosome isoforms (2014)
  • Author(s): Kurumizaka, H.
  • Organizer: 高等研カンファレンス2014「クロマチン・デコーディング」
  • Place of Presentation: 公益財団法人国際高等研究所
  • Year and Date: 2014-05-12 – 2014-05-15
  • Invited
• [Presentation] Structural and biochemical analyses of the heterotypic nucleosome containing CENP-A and H3.3 (2014)
  • Author(s): Yasuhiro Arimura, Kazuyoshi Shirayama, Naoki Horikoshi, Risa Fujita, Hiroyuki Taguchi, Wataru Kagawa and Hitoshi Kurumizaka
  • Organizer: IIAF Reserch Conference 2014“Chromatin Decoding”
  • Place of Presentation: 京都府木津川市木津川台
  • Year and Date: 2014-05-12 – 2014-05-15
• [Book] 構造生命科学で何がわかるのか，何ができるのか（田中啓二,若槻壮市） (2014)
  • Author(s): 越阪部晃永,堀越直樹,胡桃坂仁志
  • Total Pages: 15
  • Publisher: 羊土社
• [Book] 実験医学Vol32 No.13.2014[通巻541号］ (2014)
  • Author(s): 胡桃坂仁志
  • Total Pages: 6
  • Publisher: ヒストンバリアント―ベールの向こうの多様な機能
• [Remarks] 新学術領域研究(研究領域提案型) 「動的クロマチン構造と機能」ホームページ
  • URL: http://nucleosome.kyushu-u.ac.jp
• [Remarks] 胡桃坂研究室ホームページ
  • URL: http://www.eb.waseda.ac.jp/kurumizaka/