1990 Fiscal Year Annual Research Report
CPUー体化3次元グラフィックス装置を活用した蛋白質の構造の迅速な精密化システム
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01880031
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| Research Institution | Nagaoka University of Technology |
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Principal Investigator |
三井 幸雄 長岡技術科学大学, 工学部, 教授 (40012637)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
中村 和郎 長岡技術科学大学, 工学部, 助教授 (00012675)
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| Keywords | コンピュ-タ-・グラフィックス / 蛋白質の構造 / X線解析 / 蛋白結晶学 / 蛋白質の構造の精密化 |
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| Research Abstract |
1.マウスのβーインタ-フェロンについては、前年度に3.0A分解能の電子密度分布図の算出に成功し、世界ではじめて、その立体構造を解明することが出来た。今年度は、分子動力学を併用したプログラムであるXPLORを動かして、この構造の徹底的な精密化を行うことに成功した。
2.リボヌクレア-ゼMsについては、前年度に、その3'GMPとの複合体の立体構造を解明し、2.5A分解能で精密化することに成功した。今年度は、GpC,ApCとの複合体について同様な研究を行い、リボヌクレア-ゼの分子職別の機構を解明することが出来た。
3.上記の1.のマウスのβーインタ-フェロンを基にして、前年度に確立したソフトウェア-・システムQUANTA,CHARMMの支援のもとに、ヒトβーインタ-フェロンの構造を類推することが出来た。
4.タンパク性プロテア-ゼ・インヒビタ-SSIとその標的酵素サブチリシンとの複合体は分子量が約8万となる。したがって、従来、その構造精密化は、極めて困難であったが、今回の研究によって確立した上記の1.2.のシステムにより、その完全な構造精密化に成造した。
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[Publications] Y.Takeuchi,S.Kojima,K.Miura,Y.Mitsi: "Molecular Recognition at the Interface between Subtilisin and SSI" Protein Engineering (M.Ikehara ed.) Japan Scientific Societies Press. 103-108 (1990)
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[Publications] Y.Takeuchi,S.Kojima,K.Miura,Y.Mitsui: "Molecular Recognition at the Active Site of Subtilis in BPN'" Protein Engineering. (1991)
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[Publications] Y.Takeuchi,K.T.Nakamura,Y.Mitsui: "Refined Crystal structure of the Complex of Subtilisim and SSI" J.Mol.Biol.(1991)
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[Publications] 三井 幸雄,石川 弘紀,竹内 康雄: "タンパク質の立体構造と機能" 現代化学,増刊19「プロテイン、エンジニアリング」. 145-160 (1990)
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[Publications] 熊谷 泉,竹内 康雄,三井 幸雄,三浦 謹一郎: "プロテア-ゼとプロテア-ゼ・インヒビタ-" シリ-ズ分子生物学の進歩 3.蛋白質の機能構造. 219-241 (1990)
