1991 Fiscal Year Annual Research Report
線虫C,elegansの胚発生各期に特異的に発現される遺伝群の解析
| Project/Area Number |
02454557
|
|---|
| Research Institution | National Institute of Genetics |
|---|
Principal Investigator |
小原 雄治 国立遺伝学研究所, 遺伝情報研究センター, 助教授 (70135292)
|
|---|
| Keywords | cDNA / PCR / ハイブリダイゼ-ション / YAC / 遺伝子発現 |
|---|
| Research Abstract |
In situハイブリダイゼ-ションの条件設定のために、ジゴキシゲニン標識プロ-ブを用いる方法を試みた。
cDNAクロ-ンの系統的な解析のために、線虫himー8株(雌雄同体と雄がほぼ同数出現する)の混合期集団(発生の全ての時期を含む)からpolyーA^+mRNAを精製し、まず2Kb以上の分画についてλZAPIIを用いてcDNAライブラリ-(平均挿入長、2〜3Kb)を作成した。ここから独立の10,000プラ-クを拾い、すでに同定したabundant cDNAクロ-ンをプロ-ブにハイブリダイゼ-ションを行った。その結果、約5,000の比較的rareなcDNAクロ-ンのセットを得た。これらについて、(1)新たに開発した挿入cDNAの4塩基認識制限酵素地図作成法を用い、地図パタ-ンをフィンガ-プリントとしてクロ-ンの分類を進めた、(2)ほぼ全ゲノムをおおうYAC製列クロ-ンを利用して各cDNAのマッピングを進めた、(3)各期の単一胚から増幅したcDNAをドットブロットしたメンブレンを用いて各cDNAの発現パタ-ンを調べた。大部分はハウスキ-ピング様であったが、発生時期特異的な発現を示すクロ-ンを多数得た。(4)挿入cDNAの両端から数百塩基を、そのシングルプラ-クから簡単に決定できる条件を設定した。
一方、細胞特異的に発現する遺伝子を分離することを目指して、各割球から全cDNA種の増幅を試みた。割球の分離には成功し、各割球間のcDNAのサブトラクションの条件設定を行った。
|
-
[Publications] Akihiro Noda: "Rapid Identification of Specific Genes in E.coli by Hybridization to Membranes Containing the Ordered Set of Phage Clones" BioTechniques. 10. 474-476 (1991)
-
[Publications] 小原 雄治: "ゲノムの解析" 遺伝. 145. 17-22 (1991)
-
[Publications] 小原 雄治: "線虫胚発生の遺伝子支配の全体像解明をめざして" 細胚工学. 10. 661-666 (1991)
