1991 Fiscal Year Annual Research Report
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03259104
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| Research Institution | Yokohama City University |
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Principal Investigator |
西村 善文 横浜市立大学, 大学院・総合理学研究科, 教授 (70107390)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
甲斐荘 正恒 東京都立大学, 理学部, 助教授 (20137029)
上杉 晴一 横浜国立大学, 工学部, 教授 (70028851)
神藤 平三郎 東京薬科大学, 薬学部, 助教授 (80138966)
京極 好正 大阪大学, 蛋白質研究所, 教授 (90012632)
水野 猛 名古屋大学, 農学部, 教授 (10174038)
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| Keywords | DNA結合蛋白質 / DNA / タンパク質 / NMR / 立体構造 / 転写調節 / Mybタンパク質 / がん遺伝子産物 |
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| Research Abstract |
蛋白質が認識するDNA構造の研究に関して次の事を行なった。
(1)DNA結合タンパク質の高次構造解析
(1ー1)原がん遺伝子産物MybのDNA結合ドメインの立体構造。 原がん遺伝子産物Mybは転写調節因子であり,DNA結合ドメインをもつ。DNA結合ドメインは,52個のアミノ酸からなる3個のくり返し構造をもっている。その3番目に関して,NMRとディスタンス・ジェオメトリ-により三次元立体構造を求める事ができた。その結果ヘリックス・タ-ン・ヘリックス(HTH)構造の類似体であったが,明確に区別でき,新しい型のDNA結合ドメインである事が判った。
(1ー2)プリンリプレッサ-(PurR)の2次構造解析をNMRで行なった他,OmpR,PhoB,Hu,IHFのNMRの解析を始めた。
(2)DNAの高次構造解析
(2ー1)DNAと薬物(ブレオマイシン)の相互作用をNMRで解析した結果,ブレオマイシンはDNA二重らせんの狭い溝で相互作用している事が判った。
(2ー2)オリゴA配列を持つ湾曲DNAの構造,異常に安定な一本鎖DNAの構造をNMRにより解析し,配列とDNA構造の相関を調べた。
(3)DNAとDNA結合タンパク質の相互作用。
(3ー1)大腸菌浸透圧制御のタンパク質OmpRの特異的DNA結合配列を同定し,その配列が認識されている事を確認した。
(3ー2)DNA結合タンパク質のMyb,Gal4,IHFについて,特異的配列をもつDNAとの相互作用を検討し,結合定数等を評価した。
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[Publications] 前田 純夫: "Activation of the Osmoregulated ompC Gene by the OmpR Protein in Escherichia coli." J.Biochem.110. 324-327 (1991)
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[Publications] 小田 康司: "NMR Studies of a DNA Containing 8ーHydroxy deoxyguanosine" Nucleic Acids Res.19. 1407-1412 (1991)
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[Publications] B.J.Lee: "Nuclear magnetic resonance study on the structure and interaction of cyclic AMP receptor protein." Biochemistry. 30. 9047-9054 (1991)
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[Publications] 坂口 良子: "A NMR study on the conformation of a deoxy ribonucleotide duplex d(GGGGCCCC)_2." J.Biochem.109. 317-327 (1991)
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[Publications] 田中 健一: "Systematic characterization of curved DNA segments randomly cloned from Escherichia coli." Mol.Gene Genet.226. 367-375 (1991)
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[Publications] 中島 京子: "signal transduction and osmoregulation in Escherichia coli." J.Biol.Chem.266. 10775-10780 (1991)
