1992 Fiscal Year Annual Research Report
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03403009
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| Research Institution | The University of Tokyo |
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Principal Investigator |
黒田 玲子 東京大学, 教養学部, 教授 (90186552)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
松下 信之 東京大学, 教養学部, 助手 (80219427)
錦織 紳一 東京大学, 教養学部, 助教授 (70134400)
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| Keywords | DNA / ポルフィリン錯体 / 誘起CD |
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| Research Abstract |
われわれは水溶性ポルフィリンのフリーベース、銅、ニッケル、鉄錯体錯体がいわゆる水素結合形成能がないにもかかわらずDNAの塩基配列を認識することを見いだした。還元剤存在下で鉄錯体は塩基配列特異的にDNAを切断する。この塩基配列認識機構を解明するにはDNAとの相互作用様式を詳しく解析する必要があるが、intercalation,major/minor groove binding,outside binding,aggregationなど複数の結合様式があり、さらに、各々の様式が、溶液のイオン強度、化合物のr値(DNA塩基対1モル当りの化合物のモル数)、DNAのコンフォメーション等に依存して複雑な挙動を示すため、解析が著しく因難である。そこで、アキラルなポルフィリン錯体がキラルなDNAの場のもとで誘起されるCDスペクトルと吸収スペクトルとを併用して解析を行なった。intercalationモードがなく、かつentercalationによる大きなDNAのコンフォメーション変化を無視できるマンガン錯体の誘起CDを、天然のcalf thymus DNA,合成DNA、poly(da-dt)_2を用いて広範囲のr値で測定し、得られたスペクトルをガウス分解して解析した。抗生物質添加時におけるCDスペクトル変化より、Soret帯の短波長側、長波長側のピークをそれぞれ、DNAのminor groove,major grooveへの結合によるものと帰属できた。また、広範囲のr値で各モード(poly(dG-dC)_2へのmajor groove bindingなど)への結合の割合を算出した。さらに、これらの結果を基に、intercalationを起こすフリーベース体の誘起CDスペクトルの解析を同様に行い、結合の塩基配列選択性を定量的に解析した。一方、アミノ酸をリガンドとしたキラルな錯体の合成も進めている。
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Research Products
(6 results)
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[Publications] R. Kuroda: "Origin of Sequence Specific Cleavage of DNA by Bleomycins." Nucleic Acids Symposium series. 27. 9-10 (1992)
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[Publications] R. Kuroda: "Structure of New DNA Photocleaving Agents: 3,6-Diamino-10-[6-(4-nitrobenzoyloxy)hexyL]acridinium Chloride and 9-[6-(4-Nitrobenzolyoxy)hexylamino]acridine Hydrochloride." Acta Crystallographica. C48. 512-515 (1992)
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[Publications] M. Shinomiya: "Synthesis of Novel DNA Photocleaving Agents with Potential Sequence Specificity." Tetrahedron Letters. 33. 2697-2700 (1992)
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[Publications] M.Orma: "Esherichia-coli DNA Gyrase: Genetic Analysis of gyrA ahd gyrB Mutations Responsible for Thermosensitive Enzyme activity." FEBS Letters. 312. 61-65 (1992)
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[Publications] T. Kitazawa: "Tetrahderal Guest in a Tetrahedral Caveity: a Neopoentane Molecule Encaged in a Three-demensional Cadmeum Cyanide Framework." Journal of Chemical Society Chemical Communication. 413-415 (1992)
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[Publications] K.Konishi: "Chiral (-substituted Porphyrins Related to Heme Inactivation Products. Ferst Crysltallographic Determination of Absolute Stereochemistry and Correlation with Circular Dichroism." Journal of the American Chemical Society.
