1993 Fiscal Year Annual Research Report
遺伝子の分析によるヒトおよび動物ロタウイルスの生態と進化に関する研究
Project/Area Number |
03454190
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Research Institution | Sapporo Medical University |
Principal Investigator |
浦沢 正三 札幌医科大学, 医学部, 教授 (00045379)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
後藤 仁 帯広畜産大学, 畜産学部, 教授 (20003072)
千葉 峻三 札幌医科大学, 医学部, 教授 (50045374)
谷口 孝喜 札幌医科大学, 医学部, 助教授 (40094213)
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Keywords | ヒトロタウイルス / 動物ロタウイルス / VP4遺伝子 / RNA-RNAハイブリダイゼーション / リアソータント / 系統樹 |
Research Abstract |
1.5株のウマロタウイルス(FI-14、FI-23、H2、H1、L338)を用いて、それらの株間での関連、および他の動物ロタウイルスとの関連をRNA-RNAハイブリダイゼーションで検討した。FI-14、FI-23およびH2は互いに遺伝的関連性が高いが、L338は他のウマロタウイルスとの遺伝的関連性は低いことが判明した。これら4株はいずれもヒトおよび他の動物ロタウイルスとの関連性は示されなかったが、H1株のみ、ブタロタウイルス(OSU、Gottfried、YM)と高い遺伝的関連性を示した。 2.タイ国の下痢症患者から分離したMc345およびMc323株が、ヒトロタウイルスよりもブタロタウイルスに近い遺伝子構成を有していることが示された。これらの株のVP7およびVP4遺伝子の塩基配列を決定した結果、VP7の血清型はともにヒトロタウイルスに特有のG9であったが、VP4は、他のロタウイルス株のVP4のアミノ酸配列と65.6〜82.3%と低い相同率を示し、そのなかでは、無症候性株のVP4にやや類似していた。 3.北海道の軽種馬育成牧場で分離したウマロタウイルスCH3株のVP7およびVP4遺伝子の塩基配列を決定した結果、CH3のVP7血清型はG13、VP4はH2、FI-14株と類似していることが判明した。 4.すでに決定済みのヒトロタウイルスMc35株(G10)、ウシロタウイルス3株、ウマロタウイルス5株、イヌロタウイルス2株、ネコロタウイルス2株に加え、上述の新たな株のVP4のアミノ酸配列をもとに、系統樹を作成した。 こうして、ヒトおよび各種動物ロタウイルスのVP4遺伝子を中心として遺伝的関連を明らかにすることができた。
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[Publications] Yaowapa Pongsuwanna: "Distinct yearly change of serotype dustribution of human rotavirus in Thailand as determined by ELISA and PCR." Epidemiology and Infection. 111. 407-412 (1993)
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[Publications] Michihiro Takagi: "A minor prevalent strain in a severe outbreak of foal diarrhea associated with serotype 3 rotavirus." Journal of Veterinary Medicine and Science. 55. 661-663 (1993)
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[Publications] Tomoko Urasawa: "Nucleotide sequence of VP4 and VP7 genes of a unique human rotavirus strain Mc35 with subgroup I and serotype 10 specificity." Virology. 195. 766-771 (1993)
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[Publications] Huixia Wu: "Genomic relatedness of five equine rotavirus strains with different G serotype and P type specificities." Research in Virology. 144. 455-464 (1993)
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[Publications] Huixia Wu: "Survey on the istribution of the gene 4 alleles of human rotaviruses by polymerase chain reaction." Epidemiology and Infection. (in press). (1994)
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[Publications] Koki Taniguchi: "Species specificity and interspecies relatedness in VP4 genotypes demonstrated by VP4 sequence analysis of equine,feline,and canine rotavirus strains." Virology. (in press). (1994)