1991 Fiscal Year Annual Research Report
DNA複製開始におけるプライマ-蛋白質受容塩基種の決定機構に関する基礎研究
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03640543
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| Research Institution | Sophia University |
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Principal Investigator |
廣川 秀夫 上智大学, 理工学部, 教授 (30011737)
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| Keywords | 直鎖状DNA複製 / プロティンプライミングDNA複製 / DNA末端結合蛋白質 / 複製開始反応 / 鋳型DNA3^1末端塩基配列 / バクテリオファ-ジ |
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| Research Abstract |
1.本年度前半は、実験材料のファ-ジφ29とM2の大量精製を行った。高密度回転培養装置を用いて一回の培養(2〜3l)で約10^<15>のファ-ジ粒子を生産させる条件を確立した。
2.ファ-ジDNAは、ファ-ジ粒子を1ml当り10^<12>以下の稀釈した後、1%SDS存右下フェノ-ルにより抽出し,透析後、C_sCl密度平衡遠心法に単一バンドとして,精製した。これは末端結合蛋白質をDNAに持ったTP・DNA複合体である。
3.in vitro DNA複製開始反応系を構成するファ-ジDNAポリメラ-ゼ,およびプライマ-蛋白質の遺伝子をともに発現ベクタ-のtacプロモ-タ-下流にクロ-ニングし、大腸菌中でIPTG誘導後、溶菌させDNAセファロ-ズ,ホスホセルロ-ズ、カラムクロマトグラフィ-により単離精製した。
4.精製されたDNAポリメラ-ゼ,プライマ-蛋白質,TP・鋳型DNAによりin vitro DNA複製開始反応を行った。反応生成物(イニシェ-ション複合体・PP・dAMP)の検出は、SDS・PAGE法により蛋白質染色のバンドの位置の確認とRGDペプチドの結合性により判定した。
5.本研究の目的であるTP・鋳型DNA3^1末端の改変については、先づM2DNAについてのみ3^1末端より20merヌクレオチド配列を合成し3^1exoヌクレア-ゼ処理したTP・M2DNAとアニ-ルさせた。これをin vitro DNA複製反応系によりPPへのヌクレオチド結合を測定したが、期待通りの複合体生成はみられなかった。
実験は現在も進行中である。改変されたTP・鋳型DNAの末端構造の完全さ(インテグリィティ-)に決定的要因があるものと推測している。今後、改変TP・鋳型DNA生成法を改良して、プロティンプライミングDNA複製開始における3^1末端塩基配列の役割・機能を解析する。
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[Publications] HIROKAWA,H.,Kobayashi,H.and Matsumoto,K.: "Protein priming replication of linear DNA primer protein recogniges terminal protein of the template DNA(Abstruct)" Molecular Genetics of bacteria and Phages,CSH meeting. 11 (1991)
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[Publications] Kobayashi,H.,Kitabayashi,K,Matsumoto,K.and HIROKAWA,H.: "Receptor sequence in the terminal protein of bacteriophage M2 that interacts with an RGD (AgーGlyーAsp)sequence of the primer protein" Virology. 185. 901-903 (1991)
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[Publications] Kobayashi,H.,Kitabayashi,K,Matsumoto,K.and HIROKAWA,Hideo.: "primer protein of becteriophage M2 expreses the RGD receptor site upon linking the first deokynucleotide" Mol.Gen.Genet.226. 65-69 (1991)
