1992 Fiscal Year Annual Research Report

特異的DNA切断分子の開発のための修飾オリゴタクレオチドの大量合成とその高度利用

Research Project

Project/Area Number	04226207
Research Institution	Kyoto University
Principal Investigator	杉山弘京都大学, 工学部, 助手 (50183843)
Keywords	DNA切断分子 / オリゴタクレオチド / DNA合成 / アンチセンスDNA
Research Abstract	核酸を塩基配列特異手に切断する分子の開発は、ヒト遺伝子全塩基配列決定の実現やアンチセンス、アンチジーン法など特定遺伝子の発現制御を行なうために達成しなければならない新技術である。制がん性抗生物質には、塩基配列特異手に切断するものが知られており、しかも活性種をデオキシリボースの特異な水素を引き抜くように空間手に配置し、特異的でしかも高効率DNA切断を達成しているものがある。これらのもつ精密な分子機能を明らかにし、これらをDNA切断分子の分子設計に生かすことは重要である。核酸有機化学の手法を駆使し切断分子のその分子認識とDNA切断の化学を一挙に解明しこれに基づいて画期的な特異的DNA切断分子を開発することが本研究の目的である。本研究では短鎖DNAを用いた解析手法をもちいネオカルチノスタチン(NCS)によるDNA切断について、5位および4位の競争手水素引き抜きが引き起こされていることを示した。この結果に基づいてNCSがいかに特異手に-AT-サイトを認識するかを分子レベルで明らかにし、結合モデルを提案した。またデュオカルマイシンによるDNAアルキル化と切断については反応の全容を明らかにした。上記天然物の特つ巧妙な分子認識について詳しく評価し、その相互作用の体系化を試みた。次にこれら小分子DNA切断結果をふまえDNA切断分子の設計を行なった。システマティックで迅速な合成を目ざし、DNA自動合成機で合成ができるように設計した。DNA切断部位としてトリペプチドグリシルグリシルヒスチジンNi錯体を用い、ホスホロアミダイトとしてDNA認識部位であるオリゴヌクレオチドの5末端に一挙に導入した。切断分子の構造は酵素分解、マススペクトルおよび ^1H-NMRにより確認した。切断分子の切断機能はHPLCおよびゲル電気泳動により解析した。その結果1本鎖DNAを配列特異的に効率よく切断することが明らかになった。

Research Products
(4 results)

All Other

All Publications (4 results)

[Publications] 杉山弘: "Sequence-Specific Cleavage of Oligonucleptides by Neocarzinostatin. Conmpetitive Depxyribose Hydroxylation and Molecular Recognition Responsible for Site-Specificity." J.Am.Chem.Soc.114. 5573-5578 (1992)
[Publications] 杉山弘: "A Novel Cyclization Pathway in Activation of Neocarzinostatin Chromophore by Thiol under Physiological Conditions." Tetrahedron Letters. 33. 515-518 (1992)
[Publications] 杉山弘: "A Novel Guanine N3 Alkylation by Antitumor Antibiotic Duocarmycin A" Tetrahedron Letter. 34. (1993)
[Publications] 杉山弘: "Photochemical Deoxyribose C2' Oxidation in 5-Iodouracil-containing Hexanucleotide." Nuvleic Acids S石m.Seies. 27. 7-8 (1992)

1992 Fiscal Year Annual Research Report

特異的DNA切断分子の開発のための修飾オリゴタクレオチドの大量合成とその高度利用

Principal Investigator

杉山 弘 京都大学, 工学部, 助手 (50183843)

Research Products

[Publications] 杉山 弘: "Sequence-Specific Cleavage of Oligonucleptides by Neocarzinostatin. Conmpetitive Depxyribose Hydroxylation and Molecular Recognition Responsible for Site-Specificity." J.Am.Chem.Soc.114. 5573-5578 (1992)

[Publications] 杉山 弘: "A Novel Cyclization Pathway in Activation of Neocarzinostatin Chromophore by Thiol under Physiological Conditions." Tetrahedron Letters. 33. 515-518 (1992)

[Publications] 杉山 弘: "A Novel Guanine N3 Alkylation by Antitumor Antibiotic Duocarmycin A" Tetrahedron Letter. 34. (1993)

[Publications] 杉山 弘: "Photochemical Deoxyribose C2' Oxidation in 5-Iodouracil-containing Hexanucleotide." Nuvleic Acids S石m.Seies. 27. 7-8 (1992)

杉山弘京都大学, 工学部, 助手 (50183843)

[Publications] 杉山弘: "Sequence-Specific Cleavage of Oligonucleptides by Neocarzinostatin. Conmpetitive Depxyribose Hydroxylation and Molecular Recognition Responsible for Site-Specificity." J.Am.Chem.Soc.114. 5573-5578 (1992)

[Publications] 杉山弘: "A Novel Cyclization Pathway in Activation of Neocarzinostatin Chromophore by Thiol under Physiological Conditions." Tetrahedron Letters. 33. 515-518 (1992)

[Publications] 杉山弘: "A Novel Guanine N3 Alkylation by Antitumor Antibiotic Duocarmycin A" Tetrahedron Letter. 34. (1993)

[Publications] 杉山弘: "Photochemical Deoxyribose C2' Oxidation in 5-Iodouracil-containing Hexanucleotide." Nuvleic Acids S石m.Seies. 27. 7-8 (1992)