1992 Fiscal Year Annual Research Report
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04272101
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| Research Institution | Tokyo Institute of Technology |
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Principal Investigator |
岡田 典弘 東京工業大学, 生命理工学部, 教授 (60132982)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
大澤 省三 名古屋大学, 名誉教授 (10034620)
菊池 洋 三菱化成生命科学研究所(分子生物学), 主任研究員
宮田 隆 京都大学, 理学部(分子進化学), 教授 (20022692)
坂本 健作 東京工業大学, 生命理工学部(分子生物学), 教務職員
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| Keywords | レトロポゾン / リジンtRNA / プライマー / 逆転写 / アミノアシルtRNA合成酵素 / RNaseP |
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| Research Abstract |
岡田は、レトロポゾンを用いてサケ科サケ属の6種の系統関係を確定することに成功した。この系統関係は統計的な誤差のない確実な系統関係であると考えられる。リジンtRNAを起源とする5種の異なったレトロポゾンを、アライメントしたところ、それぞれのレトロポゾンは、系統的に離れた動物由来であるにもかかわらず、tRNA非相同領域において良く保存された配列が発見された。さらにこの配列と相補的な配列が、リジンtRNAをプライマーとする幾つかのレトロウイルスのU5領域に見い出された。以上の事実から、tRNAを起源とするレトロポゾンは、レトロウイルスから逆転写の際に生ずるstrong stop DNAが起源であるというモデルを提出する。
坂本は、大腸菌温度感受性の相補性試験によりリランダムの塩基置換を導入したtRNAのidentityの解析法の確立を目指している。dnaY変異株では高温でアルギニンtRNAがほとんど存在せず、AGAコドンの翻訳が阻害されるために、高温での増殖阻害が起こることが明らかになった。
宮田は、アミノアシルtRNA合成酵素のクラスI,クラスIIのグループについては、およそ60残基からなる保存領域のアライメントに基づいて、aaRSの分子系統樹を推定し、それらの分岐パターンについての予備的結果を得た。
菊池は大腸菌RNasePの触媒サブユニットであるM1RNAの遺伝系とその基質となるtRNAの前駆体の遺伝子とを連結し、ひと続きのRNAとして転写されるようなプラスミドを構築し、転写産物の反応について検討したところ、M1RNA-PretRNAの場合には、正常な位置で切断が起こり、この自己切断は低濃度のマグネシウムイオン存在以下でも起こることが明らかになった。
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[Publications] Okada.N and Oshima.K: "A model for the mechanism of generation of short interepersed elements.(SINs)" J.Mol.Evol.
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[Publications] Oshima.K, Koishi.R Matsuo.M,and Okada.N: "Several SINEs in distant species may have origlnated from a common ancestral retrovlrus,characterization of tRNA-derived retroposons." Proc.Natl.Acad.Sci.USA.
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[Publications] Okada.N: "Shaping and reshaping of salmonid genomes by amplification of tRNA-derived retroposon during evolution" Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 88. 2326-2330 (1991)
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[Publications] Miyata.T: "Evolution of RNA polymerases and brancing patterns of the three major groups of archaebacteria." J.Mol.Evol. 32. 70-78 (1991)
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[Publications] Kikuchi.Y: "Site-specific cleavage of natural mRNA sequences by newly designed hairpin catalytic RNAs." Nucleic Acids Res. 19. 6751-6755 (1991)
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[Publications] Ohsawa.S: "Evolution of the mitochondrial genetic code ZZZ.Reassignment of CUN codons from leucine to threonine during evolution of yeast mitochondria." J.Mol.Evol. 30. 322-328 (1990)
