1995 Fiscal Year Annual Research Report

RNA機能の発現機構

Research Project

Project/Area Number	04272102
Research Institution	The University of Tokyo
Principal Investigator	渡辺公綱東京大学, 大学院・工学系研究科, 教授 (00134502)
Co-Investigator(Kenkyū-buntansha)	大野陸人京都大学, 大学院・理学研究科, 助手 (80201979) 西川一八岐阜大学, 工学部, 教授 (60109262) 井上丹京都大学, 大学院・理学研究科, 教授 (40114855) 志村令郎京都大学, 大学院・理学研究科, 教授 (60025426) 横山茂之東京大学, 大学院・理学系研究科, 教授 (00159229)
Keywords	RNA / 機能構造 / nRNAスプライシング / リボザイム / tRNA / ミトコンドリア / RNA結合蛋白質 / rRNA
Research Abstract	本年度は、9人の計画班員に4人の公募班員を加えて、それぞれが順調に成果を上げた. スプライシンググループでは、RBD/RRM型のRNA結合性蛋白質をコードするゼブラフィッシュ遺伝子を同定した。また、ヒトRNAヘリカーゼ様因子HRH1に、高等真核生物のスプライシング因子の特徴の一つであるRSドメインが存在することを明らかにした。一方、グループIイントロンにおけるスプライシングのメカニズムについても生化学的な解析な進展した。tRNAグループにおいては、牛ミトコンドリアtRNA^<Ser>_<OGA>について、通常のtRNAに存在すると考えられるDアーム付近の2つのMg^<2+>結合部位が存在しないことがわかった。また、牛ミトコンドリアtRNA^<Ser>_<OGA>のアンチコドンアームとコドントリプレットとの相互作用に関する研究についても順調に進展している。一方、感度的にはRI法に匹敵するtRNAアミノ酸受容能の新しい非RI測定方法を開発した。第3のグループであるNMRグループでは、昨年度までに開発した安定同位体標識導入システムを活用し、グループIイントロンについて、基質グアノシンと認識部位との近接においてステム(P9.0)が重要であることを検証し、また、16SrRNAのデコーディング領域と抗生物質との相互作用の位置を特定した。さらに、グアニン結合アプタマ-の高次構造が、グアニンの結合にともなって大きく変化することを明らかにした。Sx1タンパク質についても、RBDIがRBDIIと同様に長いループ構造をもつこと、および、このループ部分のアミノ酸組成がこれまでに知られているRBDと異なり芳香族アミノ酸に富んでいることを明らかにし、さらに、その特定の芳香族アミノ酸が、RNA結合の特異性に重要であることを明らかにした。

Research Products
(13 results)

All Other

All Publications (13 results)

[Publications] Asakawa,S.: "Nucleotide sequence and gene organization of the starfish Asterina pectinifera mitochondrial genome" Genetics. 140. 1047-1060 (1995)
[Publications] Nitta,I: "Template-dependent polypeptide synthesis in a factor-and energy-free translation system promoted by pyridine" J.Biochem. 118. 841-849 (1995)
[Publications] Nitta,I: "Factor-and energy-free peptide synthesis promoted by aromatic tertiary amines including nucleic acid-related compounds" J.Biochsm. 118. 850-854 (1995)
[Publications] Nitta,I: "A novelfactor -and energy-free translation system promoted by tertiary amines and its implications towards the origin of the traslation system" Viva Origino. 23. 209-222 (1995)
[Publications] Takemoto,C.: "The ability of bovine mitochondrial transfer RNA(Met)to decode AUG and AUA codons." Biochimie. 77. 104-108 (1995)
[Publications] Matsuo,M.: "Highly specific and efficient cleavage of squid tRNA^<Lys> catalyzed by magnesium ions." J.Biol.Chem. 270. 10097-10104 (1995)
[Publications] Sekine,S.: "Major Identity Determinants in the Augmented D Helix of tRNA^<Glu> from Escherichia" J.Mol.Biol.256. 685-700 (1996)
[Publications] Nureki,O.: "Architectures of class-defining and specific domains of glutamyl-tRNAsynthetase" Science. 267. 1958-1965 (1995)
[Publications] Kigawa,T.: "Cell-Free Synthesis and Amino Acid-Selective Stable-Isotopic Labeling of Protein for NMR Analysis" J.Biomol.NMR. 6. 129-143 (1995)
[Publications] Tateno,M.: "A three-dimensional strcuture model of the complex of glutamy1- tRNA synthetase and its cognate tRNA" FEBS lett.377. 77-81 (1995)
[Publications] Seio,K.: "Synthesis and Properties of Conformationally Rigid Cyclouridylic Acid Having a Covalent Bonding linker between the Uracil 5-position and the 5′-Phoshate Group" Tetrahedron Letters. 36. 9515-9518 (1995)
[Publications] Liu,J.: "The zinc-binding site of Escherichia coli glutamyl-tRNA synthetase is located in the scceptor-binding domain.Studies by extended x-ray absorption fine structure,molecular modeling,and site-directed mutagenesis." J.Biol.Chem. 270. 15162-15169 (1995)
[Publications] Inoue,K: "Aspects of splice site selection in constitutive and alternative pre-mRNA splicing." Gene Expr.4. 177-182 (1995)

1995 Fiscal Year Annual Research Report

RNA機能の発現機構

Principal Investigator

渡辺 公綱 東京大学, 大学院・工学系研究科, 教授 (00134502)

Research Products

[Publications] Asakawa,S.: "Nucleotide sequence and gene organization of the starfish Asterina pectinifera mitochondrial genome" Genetics. 140. 1047-1060 (1995)

[Publications] Nitta,I: "Template-dependent polypeptide synthesis in a factor-and energy-free translation system promoted by pyridine" J.Biochem. 118. 841-849 (1995)

[Publications] Nitta,I: "Factor-and energy-free peptide synthesis promoted by aromatic tertiary amines including nucleic acid-related compounds" J.Biochsm. 118. 850-854 (1995)

[Publications] Nitta,I: "A novelfactor -and energy-free translation system promoted by tertiary amines and its implications towards the origin of the traslation system" Viva Origino. 23. 209-222 (1995)

[Publications] Takemoto,C.: "The ability of bovine mitochondrial transfer RNA(Met)to decode AUG and AUA codons." Biochimie. 77. 104-108 (1995)

[Publications] Matsuo,M.: "Highly specific and efficient cleavage of squid tRNA^<Lys> catalyzed by magnesium ions." J.Biol.Chem. 270. 10097-10104 (1995)

[Publications] Sekine,S.: "Major Identity Determinants in the Augmented D Helix of tRNA^<Glu> from Escherichia" J.Mol.Biol.256. 685-700 (1996)

[Publications] Nureki,O.: "Architectures of class-defining and specific domains of glutamyl-tRNAsynthetase" Science. 267. 1958-1965 (1995)

[Publications] Kigawa,T.: "Cell-Free Synthesis and Amino Acid-Selective Stable-Isotopic Labeling of Protein for NMR Analysis" J.Biomol.NMR. 6. 129-143 (1995)

[Publications] Tateno,M.: "A three-dimensional strcuture model of the complex of glutamy1- tRNA synthetase and its cognate tRNA" FEBS lett.377. 77-81 (1995)

[Publications] Seio,K.: "Synthesis and Properties of Conformationally Rigid Cyclouridylic Acid Having a Covalent Bonding linker between the Uracil 5-position and the 5′-Phoshate Group" Tetrahedron Letters. 36. 9515-9518 (1995)

[Publications] Liu,J.: "The zinc-binding site of Escherichia coli glutamyl-tRNA synthetase is located in the scceptor-binding domain.Studies by extended x-ray absorption fine structure,molecular modeling,and site-directed mutagenesis." J.Biol.Chem. 270. 15162-15169 (1995)

[Publications] Inoue,K: "Aspects of splice site selection in constitutive and alternative pre-mRNA splicing." Gene Expr.4. 177-182 (1995)

渡辺公綱東京大学, 大学院・工学系研究科, 教授 (00134502)