真核細胞リボソームに特徴的なリボソームタンパク質の構造,機能および進化

1993 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 04304055
• Research Institution: 山梨医科大学
• Principal Investigator: 劔 邦夫 山梨医科大学, 医学部, 教授 (10018690)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 内海 利夫 新潟大学, 医学部, 助手 (50143764) ; 和田 明 京都大学, 理学部, 助手 (80025387) ; 田中 龍夫 琉球大学, 医学部, 教授 (70018688) ; 大鷹 英子 広島大学, 原医研, 教授 (30034630) ; 高木 正道 東京大学, 農学部, 教授 (50018339)
• Keywords: 真核細胞 / リボソームタンパク質 / シクロヘキシミド / 遺伝子のクローニング / 進化学的解析 / 二次元電気泳動 / 酸性リボソームタンパク質

Research Abstract

我々は,真核細胞リボソームに特徴的と考えられるリボソームタンパク質,ことに,シクロヘキシミドの感受性に関係しているタンパク質や,酸性リボソームタンパク質ファミリー,に焦点をあててその構造と機能を研究し,さらにそれを手がかりに真核細胞リボソームの特性を明らかにすることを目的としている.昨年度中に班員によって得られた成果は次のようである.1.酵母Candida maltosaなどに見られる菌類でのシクロヘキシミド耐性という性質はリボソームタンパク質L41の56番目のアミノ酸の性質によることがわかり,殊に,C.maltosaでは耐性型のL41タンパク質の遺伝子はon-offのスイッチが入ることを示した(高木).2.RFHR法でラット肝リボソームタンパク質を分析.6個の未知タンパク質を見出し,アミノ酸配列解析を行った.それらはUBI-1に相同性を示す新成分,既知S23a,L13の修飾されたもの,などであった(和田,内海).3.ラット肝リボソームの"GTPaseドメイン"の真核生物型高次構造を認識する抗体(抗28S)を作成し,この部位の結合タンパク質の結合能やその抗体による認識度を測定したところ,酸性リボソームタンパク質,およびL12が真核生物に特徴的なRNA構造形成に関与することが判明した(内海,劔).4.ニワトリや酵母のリボソームタンパク質遺伝子のいくつかについて塩基配列を決定した.さらに,これらを含む55種の相同リボソームタンパク種データベースの構築を進め,真核化構築機構に関わりあいの深い事象を浮き彫りにした(大鷹,田中).これまでのところ研究は比較的順調に進められている.来年度は3年目の最終年度になるが,班員同士の連絡を更に密にしながら,このままの方向で研究を進めれば,かなりの成果が期待される.

Research Products

• [Publications] S.Kawai: "Drastic alteration of cycloheximide sensitivity by subustitution of amino acid in the L14 ribosomal protein of yeast." J.Bacteriology. 174. 254-262 (1992)
• [Publications] E.Otaka: "The ribosomal proteins:I.An introduction to a compilation of the protein species equivalents various organisms---." Protein Seq.Data Analysis. 5. 285-300 (1993)
• [Publications] E.Otaka: "The ribosomal proteins:II.Alignments of the equivalents of ribosomal large subunit proteins from E.coli,compiled by---." Protein Seq.Data Analysis. 5. 301-313 (1993)
• [Publications] M.Machida: "The structure of the gene encoding chicken ribosomal protein L37a." Eur.J.Biochem.213. 77-80 (1993)
• [Publications] N.Shimbara: "Down-regulation of ubiquitin gene expression during differentiation of human leukemia cells." FEBS Lett.322. 75-78 (1993)
• [Publications] N.Kenmochi: "A common nuclear factor that binds to the transcriptional control regions of ribosomal protein L5 and 5S rRNA genes" Biochim.Biophys.Res.Commun.194. 1131-1134 (1993)
• [Publications] N.Maeda: "The complete nucleotide sequence of chicken ribosomal protein L7a gene and the multiple factor binding sites in its 5'-region." Biochimie. 75. 785-790 (1993)
• [Publications] A.Wada: "A 5-kDa protein(SCS23)from the 30S subunit of the spinach chloroplast ribosome." FEBS Lett.319. 115-118 (1993)
• [Publications] M.Yamaguchi: "Regulation of the E.coli rmf gene encoding the ribosome modulation factor(RMF):Growth phase and growth-rate dependent control." EMBO J.12. 625-630 (1993)
• [Publications] M.Kajitani: "Regulation of E.coli hfg gene encoding the host factor for Qb." J.Bacteriology. 176 (in press). (1994)
• [Publications] S.Odani: "On the molecular origin of charge heterogenity of rat-liver fatty acid binding protein." Arch.Biochem.Biophys.308 (in press). (1993)
• [Publications] 剱 邦夫: "真核細胞の酸性リボソーム蛋白の構造と機能" 生化学. 66 (印刷中). (1993)
• [Publications] E.Otaka: "NATO ASI series,Vol.H71 Protein synthesis and Targeting" Springer-Verlag Berlin Heidelberg, 16 (1993)
• [Publications] E.Otaka: "The translational appartus" Plenum Publishing Corporation (in press), 15 (1993)