1992 Fiscal Year Annual Research Report
Project/Area Number |
04454003
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Research Institution | Nagoya University |
Principal Investigator |
杉田 護 名古屋大学, 遺伝子実験施設, 助教授 (70154474)
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Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
若杉 達也 名古屋大学, 遺伝子実験施設, 助手 (10212317)
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Keywords | RNA結合蛋白質 / RNA結合ドメイン / 葉緑体 / ラン藻 / タバコ / 遺伝子 / シロイヌナズナ / アミノ酸配列 |
Research Abstract |
葉緑体遺伝子の発現制御は主に転写後のレベルで行なわれている。我々は、このレベルの制御に関与すると考えられる葉緑体RNA結合蛋白質群(cp28〜cp33)が植物に普遍的に存在する可能性を調ベるため、ゲノムサイズが小さいシロイヌナズナの葉緑体RNA結合蛋白質遺伝子をクローン化し構造解析を行なった。さらに、葉緑体RNA結合蛋白質の起源を明らかにするためにラン藻から核酸結合蛋白質を分離しその遺伝子構造を解析した。 1.シロイヌナズナのcp29、cp31、cp33ホモログ遺伝子は、それぞれ268、253、242残基の成熟葉緑体RNA結合蛋白質をコードする。RNA結合ドメインのアミノ酸配列の相同性はタバコとシロイヌナズナの間で66〜83%と高く、各々の遺伝子のコピー数(ハプロイド当り1個)、イントロンの数(3個)、イントロンの挿入位置ともタバコ遺伝子のものと同じであった。これらの結果は、葉緑体RNA結合蛋白質が植物に普遍的に存在し、葉緑体内で重要な役割を担う蛋白質であることを示している。 2.ラン藻Anacystis nidulans6301の可溶性画分から核酸アフィニテイーカラムを用いて分離した12kDa蛋白質のN末端アミノ酸配列を決定した。その結果、共通配列型RNA結合ドメインの保存配列RNP2に相同なIYVGNL配列をもつことが判明したので、この蛋白質に対応する遺伝子をクローン化しDNA塩基配列を決定した。12kDa蛋白質は110残基からなり、82残基のRNA結合ドメインをもつ。ラン藻のRNA結合ドメインはタバコの葉緑体RNA結合蛋白質のそれと最も相同性が高いことから、葉緑体RNA結合蛋白質はラン藻起源と考えられる。本研究で見いだしたラン藻蛋白質の共通配列型RNA結合ドメインとしては原核細胞で最初の報告になる。
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[Publications] 續 順子: "Chloroplast DNA of black pine retains a residual inverted repeat lacking rRNA genes: nucleotide sequences of trnQ trnK,psbA, trnI and trnH and the absence of rps16." Molecular & General Genetics. 232. 206-214 (1992)
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[Publications] 李 育慶: "cDNA cloning and sequencing of tobacco chloroplast ribosomal protein L12." FEBS Letters. 300. 199-202 (1992)
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[Publications] 杉田 護: "植物遺伝子の転写後制御機構ー葉緑体RNA結合蛋白質ー" 蛋白質 核酸 酵素. 37. 1155-1164 (1992)
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[Publications] 若杉 達也: "葉緑体ゲノムの転写地図" 蛋白質 核酸 酵素. 37. 1077-1080 (1992)
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[Publications] 李 育慶: "Structure and expression of the tobacco nuclear gene encoding the 33 kd chloroplast ribonucleoprotein." Molecular & General Genetics. 237. (1993)
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[Publications] 杉田 護: "Nucleic acid-binding proteins containing a consensus sequence-type RNA-binding domain of the cyanobacterium Anacystis nidulans. in “Research in Photosynthesis"" Kluwer Academic Press, (1992)
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[Publications] 太田 賢: "The structure and expression of chloroplast ribonucleo-protein genes from Arabidopsis thaliana. in “Research in Photosynthesis"" Kluwer Academic Press, (1992)