1992 Fiscal Year Annual Research Report
高多型反復DNA配列を用いたラット染色体の連鎖地図の作製
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04680047
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| Research Institution | Institute for Animal Reproduction |
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Principal Investigator |
国枝 哲夫 (財)動物繁殖研究所, 第五研究部, 研究員 (80178011)
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| Keywords | ラット / 染色体 / 連鎖地図 / 反復配列 / マーカー遺伝子 / 多型性 / PCR法 |
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| Research Abstract |
本研究は、高多型反復DNA配列を用いて、ラットにおける連鎖解析のためのマーカー遺伝子を確立し、これらのマーカー遺伝子を用いて、ラット染色体の連鎖地図を作製することを目的としている。
DNAデーターベースを用いて(CA)nおよび(GA)nの反復配列を検索したところ、331の配列が、ラットにおいて検出された。このうち23の配列についてPCR用のプライマーを作製し、近交系ラットの系統間での多型性の有無について調べたところ、いづれも系統間で多型性を示すことが明らかとなった。また、同一の系統に由来する亜系統の間で比較したところ、いづれの配列も、亜系統間では同一であり、これらの配列は世代間で安定して遺伝することが示唆された。したがって、これの反復配列はラットの高多型なマーカー遺伝子として有用であることが明らかとなった。
つぎに、これらのマーカー遺伝子、および従来より明らかとなっているマーカー遺伝子を用いて、ラット染色体の連鎖地図の作製を試みた。その結果、ラットの第5、7、8、10染色体上のいくつかのマーカー遺伝子の連鎖地図が明らかとなった。具体的には、第5染色体上では、A8、Aco-1、Mup-1、Jun、Glut-1、Ahd-2、Pudの7遺伝子座が、第7染色体上ではIgf-1、Myc、Cyp2d2、Ela-1/Perif、Lalbaの6遺伝子座が、第8染色体上ではEs-6、Apoc-3、Ncamの3遺伝子座が、第10染色体上ではIL-3、Ngfrr、Ghの4遺伝子座が各々この順で連鎖していることが明らかとなった。
以上の結果は、ラットの遺伝的解析のための有用な知見を与えるものと考える。現在、これらのマーカー遺伝子を用いて、いくつかの病態モデルラットの疾患原因遺伝子の染色体上へのマッピングを継続中である。
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[Publications] Kunieda,T.: "Localization of the interleukin-3 gene to rat chromosome 10by linkage analyses with a variable number of tandem repeats(VNTR)." Mammalian Genome. 3. 464-466 (1992)
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[Publications] Xian M.: "Effect of a partial deletion of Y chromosome on in vitro fertilizing ability of mouse spermatozoa." Biology of Reproduction.47. 549-553 (1992)
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[Publications] Kobayashi,E.: "A polymorphisms detected in variable number of tandem repeats (VNTR) of the seminal vesicle secretion (SVS)IV gene in inbred rat." Biochem.Genet.30. 339-346 (1992)
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[Publications] Kunieda,T.: "Polymorphic microsatellite loci of the rat(Rattus norvegicus)." Mammalian Genome. 3. 564-567 (1992)
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[Publications] Takahashi,M: "A restriction fragment length polymorphism (RFLP)locus of rat (Rattus norvegicus)linked to Cs-1 locus of rat linkage group X3." Biochem.Genet.30. 537-544 (1992)
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[Publications] Sakiyama,T.: "Study of bone marow transplanation for Niemann-Pick mice using Sry and Zfy genes." J.Inher.Metab.Dis.15. 821-826 (1992)
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[Publications] Kobayashi,E.: "Linkage among esterase-6(Es-6),neural cell adhesion molecule(NCAM),and apolipoprotein C-3(apoc-3) genes on rat chromosome 8." Mammalian Genome. 3. 656-658 (1992)
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[Publications] Valdivia,R.P.A.: "PCR sexing and development rate differences in preimplantation mouse embryos fertilized and cultured in vitro." Mol.Reprod.Dev.
