1993 Fiscal Year Annual Research Report
DNA結合蛋白質に関連したHg・Znペプチド錯体の合成・NOESY・XAFS
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05209227
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| Research Institution | Tokyo University of Science |
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Principal Investigator |
山村 剛士 東京理科大学, 理工学部, 助教授 (00114702)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
千喜良 誠 中央大学, 理工学部, 教授 (70006328)
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| Keywords | ジンクフィンガー / サイトコア / 亜鉛 / NOESY / XAFS / 距離幾何学 / 分子動力学 / ペプチド錯体 |
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| Research Abstract |
【1】本計画は、Cys-X-Y-Cys型のアミノ酸配列を含むBoc-Cys-Pro-Leu-Cys-Gly-Ala-OMe、Boc-Cys-Pro-Leu-Cys-Gly-Ala-Cys-OMe、Boc-Cys-Pro-Leu-Cys-Gly-Ala-Met-Gly-His-OMe等のモデルペプチド錯体を用いて、ジンクフィンガー蛋白質の金属結合サイトを有機溶媒中で再現し、ジンクフィンガーの亜鉛結合部位に於ける配位・配座相関を明らかにすることを企てた。
【2】Boc-Cys-Pro-Leu-Cys-Gly-Ala-OMeの水銀錯体を単離精製した。亜鉛錯体はNMR的にわずかに汚い。ペプチド配位子Boc-Cys-Pro-Leu-Cys-Gly-Ala-Cys-OMeの合成は、システインの脱保護に問題を残しておりその精製法の確立までには到らなかった。Boc-Cys-Pro-Leu-Cys-Gly-Ala-Met-Gly-His-OMeはBoc-Cys-Pro-Leu-Cys-Gly-Ala-Met-OMeまでの合成・精製を完了し、現在ノナペプチドへと伸ばしている。
【3】Boc-Cys-Pro-Leu-Cys-Gly-Ala-OMeの水銀及び亜鉛錯体の^1H及び^<13>CNMRバンドを完全に帰属し,NOESYを用いてH-H間距離を求めた。
【4】Boc-Cys-Pro-Leu-Cys-Gly-Ala-OMeの水銀及び亜鉛錯体の構造を、距離幾何学によって求めた。この結果は更に、距離制限付き分子動力学で精密化した。これによって、Cys-Pro-Leu-Cys部分の水素結合性やGly-Ala部分の伸長方向と水素結合との関係を明らかにした。
【5】Boc-Cys-Pro-Leu-CysOMeの亜鉛錯体の構造を分子動力学を用いて解析し、亜鉛が5配位である可能性が得られた。XAFSの解析は4配位を示した。
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[Publications] Takeshi Yamamura: "A Square Planar NiS_4 Unit with an Aliphatic Thiolato‐Thioether Donor Set:A Carbon Monoxide Dehydrogenase Model Binds CO" J.Chem.Soc.Chem.Commun.1656-1658 (1993)
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[Publications] Takeshi Yamamura: "Syntheses and Structures of NiS_2N_2 Compounds.[N,N′-bis(o-mercaptobenzyliden)ethylenediaminato〕nickel(II),Ni(tsalen),and[N,N′-bis(o-meracaptobenzyl)ethylene" Bull.Chem.Soc.Jpn.66. 1-7 (1993)
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[Publications] Takeshi Yamamura: "Synthesis of the Zinc Complex of Boc-Glu-Thr-Ile-His-OMe:The Model Peptides for the Metal Binding Sites of Ribonucleotide Reductase" Peptide Chemistry 1992. 284-286 (1993)
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[Publications] Takeshi Yamamura: "Conformation Analyses of(Cys-Pro-Leu-Cys)Hg,[(Cys-Pro-Leu-Cys)(SBu^t)Hg]^-,and[(Cys-Pro-Leu-Cys)Zn(OMe)_2]:The Model Peptides for Cystein‐Containing Metal" Peptide Chemistry 1992. 281-283 (1993)
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[Publications] K.Sato: "Stereospecific Binding of Chemically Modified Salen‐type Shiff Base Complexes of Copper(II)with DNA" J.Chem.Soc.Chem.Commun.(予定). (1994)
