1993 Fiscal Year Annual Research Report
Project/Area Number |
05259211
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Research Institution | Kyoto University |
Principal Investigator |
井口 八郎 京都大学, 理学部, 助教授 (20028195)
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Keywords | 大腸菌 / visA(hemH)変異株 / プロトヘム / hemin-permeable mutant / ペニシリン・スクリーニング / エネルギー生産系 / リボフラビン合成 / gerC遺伝子 |
Research Abstract |
大腸菌のvisA(hemH)遺伝子を欠失したミュータントは全くヘムを作れないが、グルコースを含む完全培地上ではminute colonyを作る。この表現型に着目して、ヘミンを培地に加え、プロトヘム以前のステップに欠損が生じたものは排除するようにした上で、visA欠失株と同様の表現型を示すミュータントの分離を試みた。この場合、大腸菌はヘミンの透過しないので、まずhemin-permeable mutant(visA欠失株よりヘミン添加の培地上で大きなコロニーを作るもの)を分離し、この株を用いてNTGで処理した後、ヘミン添加のトリプトン培地中でペニシリン・スクリーニングにかけた。生き残ったバクテリアをヘミン添加のLBプレートにまき、暗所、37℃で72時間保温後、minute colonyを単離した。次に大腸菌ゲノムのほぼ全域をカバーする小原らの整列クローンで相補性を調べた。相補したクローンにつき遺伝子地図から新しい遺伝子であるかどうかを判定すると共に、サブクローニング、塩基配列決定などの遺伝子解析を行なった。その結果、32箇所にマップされたミュータントのほとんどが新しいものであり、中には大腸菌染色体地図の複数箇所にマップされるものも見い出された。このうちミュータント#2-20と#1-10について詳しい解析を進めたが、#2-20はリボフラビン合成に関与する遺伝子のribHにホモロジーがあり、また#1-10はB・subtilisのgerC遺伝子とホモロジーがあった。この様に本研究で得たミュータントの多くはエネルギー代謝と直接関係をもつ遺伝子の変異したものであり、今後大腸菌細胞のエネルギー系関連遺伝子の全体像を明らかにするため役立つものと考えられる。
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[Publications] K.Nishimura et al.: "Cloning and sequencing of the hemG gene encoding protoporphyrinogen oxidase of E.colik-12" J.Bacteriol.(発表予定).
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[Publications] T.Nakayashiki et al.: "Identification of a new gene involued in heme biosynthesis in Escherichia coli" J.Bacteriol.(発表予定).
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[Publications] K.Miyamoto et al.: "Overproduction,purification and characterization of ferrocheletase from Escherichia coli" J.Biochem.(印刷中).
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[Publications] K.Nishimura et al.: "Cloning and sequencing of the hemE gene encoding uroporphyrinogen III decarboxylase of Escherichia coli" Gene. 133. 109-113 (1933)
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[Publications] M.Kitabatake & H.Inokuchi: "A simplified method for generating step-wise deletions using PCR" Gene. 123. 59-61 (1933)
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[Publications] M.J.Rogers et al.: "The recognition of E.coli glutamine tRNA by glutaminyl-tRNA synthetase" Nucl.Acids Res.Symp.Series. 29. 211-214 (1993)