1993 Fiscal Year Annual Research Report
カンジダ酵母における遺伝暗号変化の分子進化学的研究
Project/Area Number |
05265204
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Research Institution | The University of Tokyo |
Principal Investigator |
上田 卓也 東京大学, 工学部, 助手 (80184927)
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Keywords | カンジダ / 遺伝暗号 / イノシン / アンチコドン / tRNA / 5SYSNA / EF-1α / 系統樹 |
Research Abstract |
Candida cylindraceaの遺伝暗号表ではコドンCUGはセリンに対応する。しかしCURのもう一方のコドンであるCUAについては,アミノ酸の対応は不明である。CUNのコドンボックスに対応するロイシンのtRNAとしては二種類単離されているがアンチコドンはともにIAGであり,通常のwobble ruleに従えば大腸菌などの原核生物と同様にイノシンがAも読み、CUAはロイシンとなるはずである。しかし,Munzらの遺伝学的解析から,真核生物ではイノシンはAを読めないことが定説となっている。また、ではイノシンではなく修飾されたUがAに対応するとされている。二つの可能性を検討するためにCandida cylindraceaの無細胞たんぱく質合成系を構築し,CUAを含む合成mRNAを用いてCUAの対応するアミノ酸を決定した。その結果Candida cylindraceaの全tRNA画分を用いた場合,CUAはロイシンに翻訳され,Candida cylindraceaにおいてCUAはロイシンであった。また、精製したIAGのアンチコドンを持つロイシンtRNAを用いても,CUAコドンがロイシンとして翻訳された。従って,酵母においてもイノシンはAともリボソーム上で塩基対を形成すると考えべきである。 すでに5SrRNAの配列に基づきカンジダ酵母の系統関係を作製し,CUGコドンがロイシン(グループI)→セリン(グループII)→ロイシン(グループIII)の経路で変化したことを示す結果を我々は得ている。本年度はEF-1αの塩基配列を決定し,それに基づく系統樹を作製した結果,このプロセスの正当性が確認された。CUNボックスに対応するtRNAのアンチコドンの一文字目はグループIとIIのものがIとCであるが,それに対してグループIIIに属するSaccharomyces cerevisaeでは未修飾のUのものしか存在しない.この未修飾のUの存在は遺伝暗号の変化のなごりと考えられる。
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[Publications] T.Suzuki: "The gene for serine tRNA having anticodon sequence CAG in a pathogenic yeast,Candida albicans." Nucleic Acids Research. 21. 356-356 (1993)
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[Publications] T.Ohama: "Non-universal decoding of the leucine codon CUG in several Candida species" Nucleic Acids Research. 21. 4039-4045 (1993)
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[Publications] K.Watanabe: "Molecular mechanism of the genetic code variations found in Candida species and its implications in evolution of the genetic code." The Translational Apparatus Structure,Function,Regulation,Evolution. 647-656 (1993)
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[Publications] T.Suzuki: "Characterization of serine and leucine tRNAs in an asporogenic yeast Candida cylindracea and evolutionary implications of genes for tRNA^<Ser>CAG responsible for translation of a non-universal genetic code" Nucleic Acids Research. 22. 115-123 (1994)
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[Publications] 上田卓也: "リボソームRNAの触媒活性" 細胞工学. 12. 247-253 (1993)
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[Publications] 上田卓也: "生物界における変則暗号とその発生機構" 蛋白質核酸酵素. 38. 2677-2691 (1993)