遺伝子解析情報に基づいた検査診断支援データベースの構築とシステム化に関する研究

1993 Fiscal Year Annual Research Report

• Project/Area Number: 05454583
• Research Institution: Hamamatsu University School of Medicine
• Principal Investigator: 菅野 剛史 浜松医科大学, 医学部, 教授 (70051406)
• Co-Investigator(Kenkyū-buntansha): 前川 真人 浜松医科大学, 医学部, 助手 (20190291)
• Keywords: データベース / システム化 / 遺伝子変異 / コリンエステラーゼ / サイレント型遺伝子 / 人類遺伝学 / コンピューター診断

Research Abstract

遺伝子解析情報として、まず血清コリンエステラーゼの遺伝性変異をとりあげて調査した。すなわち、その存在頻度を調べるために、血清コリンエステラーゼ活性が低値(正常値の平均値-3SD)である個体を集め、DNA診断を行った。遺伝子解析手法としては、Polymerase Chain Reaction-Single Strand Conformation Polymorphism(PCR-SSCP)、塩基配列決定法を施行したところ、コリンエステラーゼ遺伝子のコドン24、365、330、119、515、418にミッセンス変異もしくはナンセンス変異を見いだした。これらは低コリンエステラーゼ血症として発現するサイレント型遺伝子と考えられる。これら低コリンエステラーゼ血症を示した個体の内、約半数が上記のサイレント型遺伝子変異のヘテロ接合体であった。すなわち、低コリンエステラーゼ血症は全人口の約1.3%を占めていたので、その約半数に遺伝子変異が存在するとすれば、およそ150人に一人の割合となる。また、欧米の報告例とは異なった特異的な遺伝子変異も検出し、人類遺伝学的な知見も得られた。このような遺伝性変異のある個体では、先天的にコリンエステラーゼ活性が低いのにもかかわらず、肝機能障害と診断された例が実在する。同じく肝臓で合成されるアルブミンとの比率などで判別関数を作成し、コンピューター診断することを現在試みている。
なお、遺伝性変異を検出する手法としてPCR-SSCP解析を用いたが、我々の検討の結果、変異の種類によっては、SDSを泳動用バッファーに加えた方が検出感度が上昇する場合があることをつきとめた。遺伝性変異のスクリーニングとしてさらに役立つ所見と考える。
他にも高HDL(high density lipoprotein)血症、高LDL(low density lipoprotein)血症、高TG(triglyceride)血症などの検体を日常分析検体などから集めており、次のステップでは研究試料として使用する予定である。

Research Products

• [Publications] 前川 真人: "Slow型乳酸脱水素酵素B(H)サブユニットバリアントの遺伝子解析" 生物物理化学. 38. 25-29 (1994)
• [Publications] 前川 真人: "Single strand conformation polymorphism(SSCP)パターンに及ぼす泳動条件の影響" 生物物理化学. 38(印刷中). (1994)
• [Publications] 前川 真人: "低コリンエステラーゼ血症例における変異遺伝子の解析" 生物物理化学. 38(印刷中). (1994)