1993 Fiscal Year Annual Research Report
住血吸虫におけるホルモンリセプタースーパーファミリーの構造解析
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05670222
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| Research Institution | University of Tsukuba |
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Principal Investigator |
田中 真奈実 筑波大学, 基礎医学系, 講師 (80188341)
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| Co-Investigator(Kenkyū-buntansha) |
平井 啓久 京都大学, 霊長類研究所, 助手 (10128308)
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| Keywords | YACライブラリー / FISH / ステロイドホルモンリセプター / 疾病関連遺伝子 / 寄生生物ゲノムプロジェクト |
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| Research Abstract |
ファンクショナルクローニングからポジショナルクローニングへ、発想の転換と共に技法開発を取り入れて“寄生生物ゲノムプロジェクト"が始まった。住血吸虫を用いたYACライブラリーの作成と、FISH(Fluorescent in situ hybridization)による染色体マッピングは順調に進み、ゲノムサイズ2.7×10^8bpの生物に対し4.6×10^8bpカバー(約1.7倍)のライブラリーが得られ、それぞれの染色体特異的クローンのアセンブリにより、“contig"作成が可能となった。マーカーとして特に注目したステロイドホルモンリセプタースーパーファミリーは5'末端にY'Box binding protein領域をコードし、特殊な転写調節を有する。1.2kbフラグメントの遺伝子配列が決定され、YACライブラリーのスクリーニングによりマクロマップ・染色体マッピングが進行中である。なお、先年までのcDNAライブラリーランダムシークエンスによるESTのジェネレーションにより、Venter主催のEST Gene/Bankへの当録も既に完了した。寄生虫種の“疾病関連遺伝子群"のスクリーニングが開始された。
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Research Products
(6 results)
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[Publications] Tanaka,M.: "Yeast artificial chromosome-based genome mapping of the human trematode parasite Schistosoma mansoni" Nature Genetics. 1994, (in press).
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[Publications] Franco,G.R.: "Identification of new Schistosoma mansoni genes by the EST strategy using a directional cDNA library" Nature Genetics. 1994, (in press).
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[Publications] Mei,H.: "Schistosoma mansoni:cloning and characterization of a gene encoding cytosolic Cu/Zn superoxidase dismutase." Journal of Biological Chemistry. 1994(in press).
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[Publications] Tanaka,M: "Taxonomic significance of polymorphic repetitive sequences encoding rRNA genes among Entamoeba histalytica strains" Lancet. 1994(in press).
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[Publications] Tanaka,T.: "Cysteine proteinase genes locating two different chromosomes from Trypanos rangeli" International J.for Parasitology. 1994(in press).
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[Publications] Hirai,H: "Schistosoma mansoni;chromosomal localization of female-specific genes and a female specitic DNA element" Experimental Parasitology. 76. 175-181 (1993)
