1994 Fiscal Year Annual Research Report
新型リボザイムにおける構造-活性相関及び非標準型塩基対形成能のNMRによる研究
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05780473
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| Research Institution | Yokohama National University |
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Principal Investigator |
片平 正人 横浜国立大学, 工学部・物質工学科, 専任講師 (70211844)
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| Keywords | リボザイム / NMR / 構造 / 塩基対 / 活性 / DNA / ラマン |
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| Research Abstract |
ハンマーヘッド型リボザイム及び新型リボザイムである鉛リボザイムの塩基配列にもとずいたモデルDNA、RNAを作成し、その立体構造、特に非標準型塩基対A:G塩基対が形成されているのかどうかを、NMRを用いて明らかにした。
A:G塩基対は標準型塩基対ではないにもかかわらず、研究した4種のモデルDNA及びRNAのいずれにおいても塩基対の形成が見い出された。さらに塩基対の様式は、塩基配列に依存して、異なったものになる事がわかった。
モデルRNAで見出されたA:G塩基対の構造は、塩基の横に塩基が配置されるside by side型という、非常にきわだったものである事がわかった。この特徴的な構造が、新型リボザイム・鉛リボザイムにおける切断反応のメカニズムと密接に結びついている可能性が示唆された。
さらに新型リボザイムそのものの構造研究より、同様なA:G塩基対形成が強く示唆された。
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[Publications] Masato Katahira: "NMR studies of G:A mismatches in oligodeoxynucleotide duplexes modeled after ribozymes" Nucleic Acids Research. 21. 5418-5424 (1993)
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[Publications] Masato Katahira: "A Raman spectroscopic study on conformations of DNA oligomers" Nucleosides and Nucleotides. (印刷中). (1994)
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[Publications] Masato Katahira: "Drastic difference in G:A base pairing between two consecutive G:A mismatches and a single G:A mismatch in DNA" Nucleosides and Nucleotides. (印刷中). (1994)
